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豬流感病毒廣東株分離鑒定及遺傳進(jìn)化分析

發(fā)布時(shí)間:2021-06-05 04:53
  本研究從廣東省某豬場(chǎng)采集37份疑似豬流感癥狀的豬鼻拭子樣品,接種于9日齡SPF雞胚并收集尿囊液,通過血凝試驗(yàn)、血凝抑制試驗(yàn)和RT-PCR鑒定,分離得到一株豬流感病毒,經(jīng)RT-PCR分別擴(kuò)增8個(gè)基因片段,進(jìn)行基因測(cè)序及序列分析,與GenBank收錄的參考毒株比對(duì)并構(gòu)建進(jìn)化樹。結(jié)果顯示,分離毒株為H1N1亞型豬流感病毒,將其命名為A/swine/Guangdong/2/2018(H1N1)。遺傳進(jìn)化分析顯示,分離株8個(gè)片段的核酸序列與A/swine/Guangdong/L3/2009(H1N1)對(duì)應(yīng)序列的同源性均達(dá)99%以上,與經(jīng)典型H1N1亞型豬流感病毒處于同一分支。分離毒株HA的裂解位點(diǎn)為PSIQSR↓GL,符合低致病性流感病毒分子特征。HA基因受體位點(diǎn)為190D、225G和226Q,表明本毒株既可以結(jié)合SAα-2,6-Gal型人類流感病毒SA受體,也有結(jié)合SAα-2,3-Gal型禽類流感病毒SA受體的可能,在28、40、104、304、498、557位氨基酸處有6個(gè)潛在糖基化位點(diǎn);NA蛋白在50、58、63、68、98、146、235位氨基酸處有6個(gè)潛在糖基化位點(diǎn),NA蛋白氨基酸序列... 

【文章來源】:中國畜牧獸醫(yī). 2020,47(08)北大核心

【文章頁數(shù)】:9 頁

【部分圖文】:

豬流感病毒廣東株分離鑒定及遺傳進(jìn)化分析


8個(gè)節(jié)段PCR擴(kuò)增結(jié)果電泳圖

電泳圖,進(jìn)化樹,基因,電泳圖


HA基因進(jìn)化樹

氨基酸序列,進(jìn)化樹,基因,氨基酸序列


NA基因進(jìn)化樹


本文編號(hào):3211475

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