發(fā)布時(shí)間：2021-05-21 02:50

　　旨在通過(guò)高通量測(cè)序研究慢性腎衰竭（chronic renal failure,CRF）對(duì)寵物犬腸道菌群多樣性的影響,并預(yù)測(cè)分析菌群的基因功能。本研究選取30只2歲健康犬,隨機(jī)等分為慢性腎衰竭模型組（CRF,腎動(dòng)脈結(jié)扎法制備）、假手術(shù)對(duì)照組（Sham）和健康對(duì)照組（HCG）,常規(guī)飼養(yǎng),試驗(yàn)周期56 d。試驗(yàn)過(guò)程中,定期檢測(cè)血肌酐（Scr）、血尿素氮（BUN）和尿蛋白/肌酐比（UP/C）,無(wú)菌采集新鮮糞便進(jìn)行細(xì)菌16S rDNA測(cè)序,分析慢性腎衰竭對(duì)犬腸道菌群結(jié)構(gòu)、多樣性與功能的影響,并以CRF組差異菌群為自變量進(jìn)行主成分Logistic回歸分析,構(gòu)建菌群標(biāo)志物綜合指數(shù)（FMI）用于慢性腎衰竭預(yù)測(cè)。結(jié)果顯示:1)從試驗(yàn)后第28天開(kāi)始,CRF組Scr、BUN和UP/C分別顯著高于自身試驗(yàn)前、HCG組和Sham組（P<0.05）。2)CRF組不同時(shí)間點(diǎn)腸道菌群有顯著差異,第56天時(shí)的Chao 1指數(shù)、Shannon指數(shù)均降低,擬桿菌門（Bacteroidetes）、變形桿菌門（Proteobacteria）和放線菌門（Actinobacteria）的相對(duì)豐度增加,厚壁菌門（Firmicu... 

【文章來(lái)源】：畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020,51(10)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：9 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
    1.2 試驗(yàn)設(shè)計(jì)
    1.3 腎功能指標(biāo)測(cè)定
    1.4 腸道菌群16S rDNA高通量測(cè)序
        1.4.1 糞便采集
        1.4.2 糞便總DNA提取與PCR分析
        1.4.3 高通量測(cè)序及處理
    1.5 生物信息學(xué)分析
    1.6 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié) 果
    2.1 犬腎功能指標(biāo)的變化
    2.2 慢性腎衰竭對(duì)犬腸道菌群多樣性的影響
    2.3 腸道菌群組成分析
    2.4 不同組間差異菌群LEfSe分析
    2.5 差異菌群與CRF相關(guān)性分析
    2.6 腸道菌群互作網(wǎng)絡(luò)分析
    2.7 腸道菌群基因功能預(yù)測(cè)
3 討 論
4 結(jié) 論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[3]基于高通量測(cè)定肉雞回腸微生物多樣性及PICRUSt基因預(yù)測(cè)分析[J]. 徐帥,林奕岑,周夢(mèng)佳,倪學(xué)勤,曾東,曾燕.  動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)學(xué)報(bào). 2016(08)
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本文編號(hào)：3198902