本研究旨在研究高山美利奴羊INHA基因外顯子多態(tài)性及其與產(chǎn)羔數(shù)的相關(guān)性。本實(shí)驗(yàn)通過比對高山美利奴羊全基因組測序結(jié)果中不同個體INHA外顯子,分析高山美利奴羊INHA基因的單核苷酸多態(tài)性,應(yīng)用生物信息學(xué)軟件分析高山美利奴羊INHA基因突變前后不同等位基因的m RNA二級結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)及三級結(jié)構(gòu)。通過上述分析,將引起高山美利奴羊INHA編碼氨基酸變化的位點(diǎn)作為該基因的特異性候選位點(diǎn),通過直接測序法分析高山美利奴羊特異性候選位點(diǎn)INHA基因多態(tài)性,并分析其與產(chǎn)羔數(shù)的相關(guān)性。結(jié)果發(fā)現(xiàn),高山美利奴羊INHA基因外顯子區(qū)域存在3個SNPs,分別為T206A （Met→Lys）、T387A（Thr→Thr）、G900A （Pro→Pro）;INHA基因3個SNPS都改變了RNA的最小自由能以及二級結(jié)構(gòu),錯義突變T206A （Met→Lys）引起蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)的改變;高山美利奴羊INHA基因T206A突變表現(xiàn)出3種基因型分別命名為TT、TA、AA,基因型與產(chǎn)羔數(shù)關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)TT、TA基因型個體的產(chǎn)羔數(shù)極顯著高于TT基因型個體（p<0.01）。本研究初步表明INHA基因是影響高山... 

【文章來源】：基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020,39(03)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：7 頁

【文章目錄】：
1 結(jié)果與分析
    1.1 高山美利奴羊INHA基因外顯子SNPs篩選
    1.2 SNP位點(diǎn)的遺傳多態(tài)性
    1.3 生物信息學(xué)分析
    1.4 PCR擴(kuò)增及測序
    1.5 高山美利奴羊INHA基因外顯子T206A SNP位點(diǎn)的基因型頻率和等位基因頻率分析
    1.6 INHA基因多態(tài)性與產(chǎn)羔數(shù)關(guān)聯(lián)分析
2 討論
3 材料與方法
    3.1 材料
    3.2 血液基因組DNA的提取
    3.3 全基因組測序及INAH基因多態(tài)位點(diǎn)篩選
    3.4 多態(tài)位點(diǎn)遺傳多樣性分析
    3.5 生物信息學(xué)分析
    3.6 引物設(shè)計
    3.7 PCR擴(kuò)增與測序
    3.8 統(tǒng)計學(xué)分析


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號：3195881