太行雞CYP19A1基因克隆及生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-05-17 09:21
試驗(yàn)旨在克隆蛋雞CYP19A1基因,對(duì)其遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行生物信息學(xué)分析并探究其在太行雞不同組織中及不同產(chǎn)蛋量個(gè)體中的表達(dá)情況。以河北省太行雞為研究對(duì)象,通過(guò)設(shè)計(jì)引物對(duì)CYP19A1基因CDS區(qū)進(jìn)行克隆測(cè)序,運(yùn)用生物信息學(xué)軟件對(duì)其功能結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè)。結(jié)果顯示,CYP19A1基因含有一個(gè)1 509 bp的開(kāi)放閱讀框(ORF),編碼502個(gè)氨基酸。同源性比對(duì)和系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)分析結(jié)果表明,太行雞CYP19A1基因與鴨的同源性較高(90.7%),并且在不同物種間高度保守。對(duì)CYP19A1蛋白理化性質(zhì)進(jìn)行預(yù)測(cè)分析發(fā)現(xiàn),該蛋白為親水蛋白,蛋白分子式為C2602H4103N675O719S36,分子質(zhì)量為57.51 ku,理論等電點(diǎn)為5.99,其中含量最高的是亮氨酸(為14.0%)。蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)由α-螺旋、延伸鏈、β-折疊及無(wú)規(guī)則卷曲4種結(jié)構(gòu)組成,所占比例分別為58.95%、2.18%、3.93%和34.93%。組織表達(dá)譜分析發(fā)現(xiàn),CYP19A1基因在不同組織中均有表達(dá),但其在卵巢中表達(dá)量最高。實(shí)時(shí)熒...
【文章來(lái)源】:中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2020,47(05)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 樣品采集
1.1.2 主要試劑
1.2 方法
1.2.1 太行雞血液DNA提取
1.2.2 各組織RNA提取
1.2.3 cDNA合成
1.2.4 克隆及測(cè)序
1.2.5 CYP19A1基因生物信息學(xué)分析
1.2.6 組織半定量表達(dá)分析
1.2.7 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
1.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié) 果
2.1 生產(chǎn)性能
2.2 CYP19A1基因序列分析
2.3 CYP19A1基因生物信息學(xué)分析
2.3.1 同源性分析
2.3.2 CYP19A1蛋白理化性質(zhì)分析
2.3.3 CYP19A1蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)分析
2.3.4 NJ系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)
2.4 組織半定量表達(dá)結(jié)果
2.5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果
3 討 論
4 結(jié) 論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]廣西麻雞CYP19A1基因的克隆、序列分析和組織表達(dá)譜研究[J]. 孫甜甜,楊祝良,鄧?yán)^賢,曾令湖,蔣和生,楊秀榮. 中國(guó)家禽. 2017(18)
[2]Cyp19a1基因在中華鱉早期卵巢分化中的功能研究[J]. 包海聲,蔡晗,韓偉,張海艷,孫偉,葛楚天,錢(qián)國(guó)英. 中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2017(06)
[3]補(bǔ)腎調(diào)周法對(duì)超排卵周期顆粒細(xì)胞CYP19A1 mRNA表達(dá)的影響[J]. 何珊,常宏,劉大艷,鄧少潔,樊丹怡. 中國(guó)醫(yī)院用藥評(píng)價(jià)與分析. 2015(07)
[4]利用shRNA真核表達(dá)載體干涉雌性雞胚性腺中芳香化酶基因(CYP19A1)的表達(dá)[J]. 朱曉亮,徐桂云,楊寧,李俊英,鄭江霞. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2011(06)
[5]奧利亞羅非魚(yú)卵巢芳香化酶基因的克隆及其表達(dá)[J]. 唐永凱,李建林,陳文華,俞菊華. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2008(05)
博士論文
[1]雌激素和TGF-β1對(duì)雞原始卵泡和生長(zhǎng)卵泡發(fā)育的調(diào)節(jié)作用及其機(jī)理的研究[D]. 趙丹.浙江大學(xué) 2018
碩士論文
[1]雞卵泡體細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組研究及芳香化酶基因調(diào)控分析[D]. 景若曦.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
本文編號(hào):3191516
【文章來(lái)源】:中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2020,47(05)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 樣品采集
1.1.2 主要試劑
1.2 方法
1.2.1 太行雞血液DNA提取
1.2.2 各組織RNA提取
1.2.3 cDNA合成
1.2.4 克隆及測(cè)序
1.2.5 CYP19A1基因生物信息學(xué)分析
1.2.6 組織半定量表達(dá)分析
1.2.7 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
1.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié) 果
2.1 生產(chǎn)性能
2.2 CYP19A1基因序列分析
2.3 CYP19A1基因生物信息學(xué)分析
2.3.1 同源性分析
2.3.2 CYP19A1蛋白理化性質(zhì)分析
2.3.3 CYP19A1蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)分析
2.3.4 NJ系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)
2.4 組織半定量表達(dá)結(jié)果
2.5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果
3 討 論
4 結(jié) 論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]廣西麻雞CYP19A1基因的克隆、序列分析和組織表達(dá)譜研究[J]. 孫甜甜,楊祝良,鄧?yán)^賢,曾令湖,蔣和生,楊秀榮. 中國(guó)家禽. 2017(18)
[2]Cyp19a1基因在中華鱉早期卵巢分化中的功能研究[J]. 包海聲,蔡晗,韓偉,張海艷,孫偉,葛楚天,錢(qián)國(guó)英. 中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2017(06)
[3]補(bǔ)腎調(diào)周法對(duì)超排卵周期顆粒細(xì)胞CYP19A1 mRNA表達(dá)的影響[J]. 何珊,常宏,劉大艷,鄧少潔,樊丹怡. 中國(guó)醫(yī)院用藥評(píng)價(jià)與分析. 2015(07)
[4]利用shRNA真核表達(dá)載體干涉雌性雞胚性腺中芳香化酶基因(CYP19A1)的表達(dá)[J]. 朱曉亮,徐桂云,楊寧,李俊英,鄭江霞. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2011(06)
[5]奧利亞羅非魚(yú)卵巢芳香化酶基因的克隆及其表達(dá)[J]. 唐永凱,李建林,陳文華,俞菊華. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2008(05)
博士論文
[1]雌激素和TGF-β1對(duì)雞原始卵泡和生長(zhǎng)卵泡發(fā)育的調(diào)節(jié)作用及其機(jī)理的研究[D]. 趙丹.浙江大學(xué) 2018
碩士論文
[1]雞卵泡體細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組研究及芳香化酶基因調(diào)控分析[D]. 景若曦.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
本文編號(hào):3191516
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