豬脂肪分解通路中主要基因的網絡構建
發(fā)布時間:2021-05-15 23:17
脂肪代謝性狀屬于多基因控制的復雜性狀。目前有關脂肪分解的研究大多著眼于幾個甚至單一基因,難以發(fā)現基因之間的互作,應用于育種實踐時具有一定的局限性。HSL是一種重要的脂肪分解酶,已有研究證實CB1可以影響HSL基因的表達,但是調控機制并不清楚。本文采用文獻挖掘方法,構建了與脂肪分解有關的基因網絡,闡明脂解基因之間的作用機理;推測CB1通過CB1→PPARγ2→perilipinA→HSL通路對HSL起調控作用,并通過試驗對CB1對HSL基因表達的調控進行驗證,可為今后進一步開展脂肪分解通路的研究提供理論依據。本研究分析了脂肪動員、線粒體與過氧化物酶體內脂肪酸的β氧化和甘油代謝三個環(huán)節(jié)中相關酶及其編碼基因的性質特征,并解釋了調控通路的作用機制;運用生物信息學方法分析CB1→PPARγ2→perilipinA→HSL通路中4個基因編碼的蛋白質的理化性質與結構;選取了4、5、6、7月齡15頭美系大白豬屠宰采樣,對CB1、PPARγ2和HSL基因表達進行相對定量。結果顯示:興奮性G蛋白偶聯受體通路、抑制性G蛋白偶聯受體通路和Gq/PLC/PKC通路屬于G蛋白偶聯通路,調控機制相似;酪氨酸激酶受體...
【文章來源】:河北農業(yè)大學河北省
【文章頁數】:56 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 引言
1.1 脂肪組織和脂肪細胞
1.1.1 脂肪組織和脂肪細胞的構成
1.1.2 脂肪組織和脂肪細胞的起源和發(fā)育
1.1.3 脂肪因子
1.2 脂肪的分解過程及相關脂肪酶
1.2.1 脂肪的動員
1.2.2 甘油的代謝
1.2.3 脂肪酸的 β 氧化
1.2.4 其他調節(jié)脂肪分解的基因
1.3 脂肪分解的信號機制
1.3.1 興奮性 G 蛋白偶聯受體通路
1.3.2 抑制性 G 蛋白偶聯受體通路
1.3.3 酪氨酸激酶受體通路
1.3.4 Gq/PLC/PKC 通路
1.3.5 JAK‐STATs 通路
1.4 脂肪分解代謝的研究方法
1.5 有待解決的問題
1.6 本研究的內容
1.7 本研究的意義
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.1.1 生物信息學分析材料
2.1.2 提取總 RNA 試驗材料
2.1.3 主要的試驗試劑
2.1.4 試劑的配制
2.2 試驗方法
2.2.1 調控網絡的構建
2.2.2 生物信息學分析
2.2.3 主要的試驗儀器
2.2.4 總 RNA 的提取
2.2.5 RNA 純度和質量的檢測
2.2.6 RNase free DNaseⅠ處理總 RNA
2.2.7 引物設計
2.2.8 PCR 鑒定 gDNA
2.2.9 反轉錄成 cDNA
2.2.10 Real‐time PCR
2.2.11 數據處理
3 結果與分析
3.1 脂肪降解通路中主要基因的網絡構建
3.1.1 豬脂肪分解調控網絡
3.1.2 G 蛋白偶聯受體介導的調控通路
3.2 CB1/ PPARΓ2/HSL 通路中蛋白質的生物信息學分析
3.2.1 蛋白質的理化性質
3.2.2 蛋白質的信號肽和亞細胞定位
3.2.3 蛋白質的二級結構
3.3 CB1 調控 HSL 表達研究
3.3.1 RNA 純度和質量的檢測結果
3.3.2 反應曲線
3.3.3 CB1、PPARγ2 和 HSL 基因的組織表達譜
3.3.4 豬不同體重階段 CB1、PPARγ2 和 HSL 基因的表達趨勢
4 討論
4.1 豬脂肪分解通路中的基因網絡
4.2 脂解通路之間的關系
4.3 CB1/ PPARΓ2/HSL 通路的推測
4.3.1 CB1/ PPARγ2/HSL 通路中蛋白質的生物信息學分析
4.3.2 CB1 對 HSL 表達的調控
4.4 有待進一步研究的問題
5 結論
參考文獻
縮略詞表
在讀期間發(fā)表的論文
作者簡歷
致謝
本文編號:3188514
【文章來源】:河北農業(yè)大學河北省
【文章頁數】:56 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 引言
1.1 脂肪組織和脂肪細胞
1.1.1 脂肪組織和脂肪細胞的構成
1.1.2 脂肪組織和脂肪細胞的起源和發(fā)育
1.1.3 脂肪因子
1.2 脂肪的分解過程及相關脂肪酶
1.2.1 脂肪的動員
1.2.2 甘油的代謝
1.2.3 脂肪酸的 β 氧化
1.2.4 其他調節(jié)脂肪分解的基因
1.3 脂肪分解的信號機制
1.3.1 興奮性 G 蛋白偶聯受體通路
1.3.2 抑制性 G 蛋白偶聯受體通路
1.3.3 酪氨酸激酶受體通路
1.3.4 Gq/PLC/PKC 通路
1.3.5 JAK‐STATs 通路
1.4 脂肪分解代謝的研究方法
1.5 有待解決的問題
1.6 本研究的內容
1.7 本研究的意義
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.1.1 生物信息學分析材料
2.1.2 提取總 RNA 試驗材料
2.1.3 主要的試驗試劑
2.1.4 試劑的配制
2.2 試驗方法
2.2.1 調控網絡的構建
2.2.2 生物信息學分析
2.2.3 主要的試驗儀器
2.2.4 總 RNA 的提取
2.2.5 RNA 純度和質量的檢測
2.2.6 RNase free DNaseⅠ處理總 RNA
2.2.7 引物設計
2.2.8 PCR 鑒定 gDNA
2.2.9 反轉錄成 cDNA
2.2.10 Real‐time PCR
2.2.11 數據處理
3 結果與分析
3.1 脂肪降解通路中主要基因的網絡構建
3.1.1 豬脂肪分解調控網絡
3.1.2 G 蛋白偶聯受體介導的調控通路
3.2 CB1/ PPARΓ2/HSL 通路中蛋白質的生物信息學分析
3.2.1 蛋白質的理化性質
3.2.2 蛋白質的信號肽和亞細胞定位
3.2.3 蛋白質的二級結構
3.3 CB1 調控 HSL 表達研究
3.3.1 RNA 純度和質量的檢測結果
3.3.2 反應曲線
3.3.3 CB1、PPARγ2 和 HSL 基因的組織表達譜
3.3.4 豬不同體重階段 CB1、PPARγ2 和 HSL 基因的表達趨勢
4 討論
4.1 豬脂肪分解通路中的基因網絡
4.2 脂解通路之間的關系
4.3 CB1/ PPARΓ2/HSL 通路的推測
4.3.1 CB1/ PPARγ2/HSL 通路中蛋白質的生物信息學分析
4.3.2 CB1 對 HSL 表達的調控
4.4 有待進一步研究的問題
5 結論
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本文編號:3188514
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