四川部分地區(qū)PED和TGE分子流行病學(xué)調(diào)查及PEDV部分S基因變異分析
發(fā)布時(shí)間:2021-05-15 22:57
豬流行性腹瀉(Porcine epidemic diarrhea, PED)和豬傳染性胃腸炎(Transmissible gastroenteriris of swine, TGE)分別由同屬于冠狀病毒科冠狀病毒屬的豬流行性腹瀉病毒(Porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)和豬傳染性胃腸炎病毒(Transmissible gastroenteritis virus of swine, TGEV)引起的以腹瀉、嘔吐、脫水為特征,嚴(yán)重危害哺乳仔豬的兩種高度接觸性腸道傳染病。四川地區(qū)從2011年10月份開(kāi)始,在全省范圍內(nèi)爆發(fā)以仔豬水樣腹瀉,死亡率極高為特征的腹瀉疫情,給我省帶來(lái)了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。此次疫情中進(jìn)行了PEDV-TGEV二聯(lián)疫苗免疫的豬場(chǎng)也并無(wú)幸免。為了明確此次腹瀉疫情中的主要病毒病原分布情況、感染情況以及PEDV在此次腹瀉疫情中的變異情況,特開(kāi)展本研究。本試驗(yàn)樣本采集于2011年10月至2012年4月、2012年10月至2013年4月兩個(gè)時(shí)間段,包括四川省資陽(yáng)、廣元、攀枝花、成都等10個(gè)區(qū)域進(jìn)行腹瀉樣品采集工作,覆蓋了四川東部、西部、中部地區(qū)的大...
【文章來(lái)源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:60 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞表
第一部分 文獻(xiàn)綜述
1. 豬流行性腹瀉
1.1 豬流行性腹瀉的發(fā)病機(jī)理
1.2 豬流行性腹瀉的病理變化
1.3 豬流行性腹瀉病毒概述
1.3.1 PEDV的病毒學(xué)分類(lèi)
1.3.2 PEDV的形態(tài)特征
1.3.3 PEDV的理化特性
1.3.4 PEDV的細(xì)胞培養(yǎng)特性
1.3.5 PEDV的基因組結(jié)構(gòu)
1.3.6 PEDV主要結(jié)構(gòu)蛋白及功能
1.4 豬流行腹瀉的分子流行病學(xué)調(diào)查
1.5 豬流行性腹瀉的診斷方法
2 豬傳染性胃腸炎
2.1 豬傳染性胃腸炎的發(fā)病機(jī)理
2.2 豬傳染性胃腸炎的病理變化
2.3 豬傳染性胃腸炎病毒概述
2.3.1 TGEV的形態(tài)結(jié)構(gòu)
2.3.2 TGEV的理化特性
2.3.3 TGEV的細(xì)胞培養(yǎng)特性
2.3.4 TGEV的基因組結(jié)構(gòu)
2.3.5 TGEV的主要蛋白及功能
2.4 TGE的分子流行病學(xué)調(diào)查
2.5 TGE的診斷方法
3 本研究的目的和意義
第二部分 PEDV和TGEV分子流行病學(xué)調(diào)查
1. 材料與方法
1.1 病料
1.2 試劑
1.3 主要的儀器設(shè)備
1.4 引物的設(shè)計(jì)
1.5 病毒總RNA的提取
1.6 CDNA的合成
1.7 PCR擴(kuò)增
1.8 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)及鑒定
2. 結(jié)果
2.1 RT-PCR結(jié)果
2.2 臨床樣品的檢測(cè)結(jié)果
3. 討論
第三部分 PEDV部分S基因遺傳變異分析
1. 材料
1.1 病料
1.2 試劑
1.3 主要的儀器設(shè)備
1.4 主要溶液配制
2. 方法
2.1 引物的設(shè)計(jì)
2.2 病毒總RNA的提取
2.3 CDNA的合成
2.4 PCR擴(kuò)增
2.5 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)及鑒定
2.6 目的基因的克隆
3. 結(jié)果
3.1 RT-PCR結(jié)果
3.2 PEDV S基因的序列和進(jìn)化分析
3.3 S基因的核苷酸及氨基酸同源性分析
4 討論
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄 四川地區(qū)豬流行性腹瀉部分S基因測(cè)序結(jié)果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]山東省部分地區(qū)豬流行性腹瀉流行病學(xué)調(diào)查及其M基因遺傳變異分析[J]. 趙夢(mèng)姣,陳書(shū)民,成巖,孫振,姜世金,田夫林. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2013(10)
[2]豬流行性腹瀉病毒研究現(xiàn)狀[J]. 楊德全,鞠厚斌,葛菲菲,寧昆,劉健,王建,周錦萍. 畜牧與獸醫(yī). 2013(08)
[3]豬流行性腹瀉病毒的RT-PCR檢測(cè)及DY株的分離鑒定[J]. 任玉鵬,陳弟詩(shī),顏其貴,程渝,郭玲,楊紹林,舒蕾. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2013(07)
[4]豬流行性腹瀉病毒RT-PCR檢測(cè)與ORF3基因分子流行病學(xué)調(diào)查[J]. 董彥鵬,白娟,范寶超,李玉峰,姜平. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2013(07)
[5]華南地區(qū)豬流行性腹瀉病毒的分離鑒定及其S基因抗原表位片段的遺傳變異分析[J]. 田野,蘇丹萍,蔣偉,鐘望,張顯浩,陳瑞愛(ài),賀東生. 中國(guó)獸醫(yī)雜志. 2013(05)
[6]2010~2012年華中地區(qū)豬流行性腹瀉病毒分子特征和遺傳進(jìn)化分析[J]. 鄭逢梅,霍金耀,趙軍,常洪濤,王曉夢(mèng),陳陸,王川慶. 病毒學(xué)報(bào). 2013(02)
[7]2011年廣西豬群豬流行性腹瀉和豬傳染性胃腸炎調(diào)查[J]. 甘海霞,梁晟,韋顯凱,溫麗霞,鄭列豐,鄒聯(lián)斌. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2012(10)
[8]豬流行性腹瀉病毒的RT-PCR鑒定及其M、N和E基因的序列分析[J]. 張紅壘,董潔,梁亞冰,許信剛,童德文. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2012(09)
[9]豬流行性腹瀉病毒RT-PCR檢測(cè)方法建立及初步應(yīng)用研究[J]. 吳學(xué)敏,陳如敬,王隆柏,車(chē)勇良,劉玉濤,莊向生,嚴(yán)山,周倫江. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2012(26)
[10]豬流行性腹瀉病毒ORF3和M基因的克隆與序列分析[J]. 王隆柏,吳學(xué)敏,車(chē)勇良,陳如敬,魏宏,劉玉濤,莊向生,周倫江. 中國(guó)動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào). 2012(03)
本文編號(hào):3188485
【文章來(lái)源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:60 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞表
第一部分 文獻(xiàn)綜述
1. 豬流行性腹瀉
1.1 豬流行性腹瀉的發(fā)病機(jī)理
1.2 豬流行性腹瀉的病理變化
1.3 豬流行性腹瀉病毒概述
1.3.1 PEDV的病毒學(xué)分類(lèi)
1.3.2 PEDV的形態(tài)特征
1.3.3 PEDV的理化特性
1.3.4 PEDV的細(xì)胞培養(yǎng)特性
1.3.5 PEDV的基因組結(jié)構(gòu)
1.3.6 PEDV主要結(jié)構(gòu)蛋白及功能
1.4 豬流行腹瀉的分子流行病學(xué)調(diào)查
1.5 豬流行性腹瀉的診斷方法
2 豬傳染性胃腸炎
2.1 豬傳染性胃腸炎的發(fā)病機(jī)理
2.2 豬傳染性胃腸炎的病理變化
2.3 豬傳染性胃腸炎病毒概述
2.3.1 TGEV的形態(tài)結(jié)構(gòu)
2.3.2 TGEV的理化特性
2.3.3 TGEV的細(xì)胞培養(yǎng)特性
2.3.4 TGEV的基因組結(jié)構(gòu)
2.3.5 TGEV的主要蛋白及功能
2.4 TGE的分子流行病學(xué)調(diào)查
2.5 TGE的診斷方法
3 本研究的目的和意義
第二部分 PEDV和TGEV分子流行病學(xué)調(diào)查
1. 材料與方法
1.1 病料
1.2 試劑
1.3 主要的儀器設(shè)備
1.4 引物的設(shè)計(jì)
1.5 病毒總RNA的提取
1.6 CDNA的合成
1.7 PCR擴(kuò)增
1.8 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)及鑒定
2. 結(jié)果
2.1 RT-PCR結(jié)果
2.2 臨床樣品的檢測(cè)結(jié)果
3. 討論
第三部分 PEDV部分S基因遺傳變異分析
1. 材料
1.1 病料
1.2 試劑
1.3 主要的儀器設(shè)備
1.4 主要溶液配制
2. 方法
2.1 引物的設(shè)計(jì)
2.2 病毒總RNA的提取
2.3 CDNA的合成
2.4 PCR擴(kuò)增
2.5 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)及鑒定
2.6 目的基因的克隆
3. 結(jié)果
3.1 RT-PCR結(jié)果
3.2 PEDV S基因的序列和進(jìn)化分析
3.3 S基因的核苷酸及氨基酸同源性分析
4 討論
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄 四川地區(qū)豬流行性腹瀉部分S基因測(cè)序結(jié)果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]山東省部分地區(qū)豬流行性腹瀉流行病學(xué)調(diào)查及其M基因遺傳變異分析[J]. 趙夢(mèng)姣,陳書(shū)民,成巖,孫振,姜世金,田夫林. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2013(10)
[2]豬流行性腹瀉病毒研究現(xiàn)狀[J]. 楊德全,鞠厚斌,葛菲菲,寧昆,劉健,王建,周錦萍. 畜牧與獸醫(yī). 2013(08)
[3]豬流行性腹瀉病毒的RT-PCR檢測(cè)及DY株的分離鑒定[J]. 任玉鵬,陳弟詩(shī),顏其貴,程渝,郭玲,楊紹林,舒蕾. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2013(07)
[4]豬流行性腹瀉病毒RT-PCR檢測(cè)與ORF3基因分子流行病學(xué)調(diào)查[J]. 董彥鵬,白娟,范寶超,李玉峰,姜平. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2013(07)
[5]華南地區(qū)豬流行性腹瀉病毒的分離鑒定及其S基因抗原表位片段的遺傳變異分析[J]. 田野,蘇丹萍,蔣偉,鐘望,張顯浩,陳瑞愛(ài),賀東生. 中國(guó)獸醫(yī)雜志. 2013(05)
[6]2010~2012年華中地區(qū)豬流行性腹瀉病毒分子特征和遺傳進(jìn)化分析[J]. 鄭逢梅,霍金耀,趙軍,常洪濤,王曉夢(mèng),陳陸,王川慶. 病毒學(xué)報(bào). 2013(02)
[7]2011年廣西豬群豬流行性腹瀉和豬傳染性胃腸炎調(diào)查[J]. 甘海霞,梁晟,韋顯凱,溫麗霞,鄭列豐,鄒聯(lián)斌. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2012(10)
[8]豬流行性腹瀉病毒的RT-PCR鑒定及其M、N和E基因的序列分析[J]. 張紅壘,董潔,梁亞冰,許信剛,童德文. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2012(09)
[9]豬流行性腹瀉病毒RT-PCR檢測(cè)方法建立及初步應(yīng)用研究[J]. 吳學(xué)敏,陳如敬,王隆柏,車(chē)勇良,劉玉濤,莊向生,嚴(yán)山,周倫江. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2012(26)
[10]豬流行性腹瀉病毒ORF3和M基因的克隆與序列分析[J]. 王隆柏,吳學(xué)敏,車(chē)勇良,陳如敬,魏宏,劉玉濤,莊向生,周倫江. 中國(guó)動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào). 2012(03)
本文編號(hào):3188485
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