HBK-SPF鴨是中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所在紹興麻鴨基礎(chǔ)上培育的SPF鴨，包括HBK-Q和HBK-B品系，現(xiàn)已繁育至第8代。TAP分子是MHC20class20I抗原遞呈路徑中一個(gè)關(guān)鍵蛋白分子，它將水解的內(nèi)源性多肽運(yùn)送到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)，并提呈給MHC20class20I分子，與CD8+T細(xì)胞結(jié)合，引起特異的免疫應(yīng)答。本研究利用16對微衛(wèi)星標(biāo)記對F5代和F6代HBK-SPF鴨進(jìn)行遺傳多樣性分析，HBK-SPF鴨在16個(gè)位點(diǎn)共檢測到71個(gè)等位基因，每個(gè)位點(diǎn)的平均等位基因數(shù)為4.14，與F2代和F3代相比有所下降；F5代和F6代鴨群偏離Hardy-Weinberg平衡的位點(diǎn)有所減少，分別僅有2個(gè)和4個(gè)位點(diǎn)顯著偏離平衡狀態(tài)；多態(tài)信息含量（PIC）大于0.5的位點(diǎn)數(shù)量減少，F(xiàn)5代2個(gè)群體的平均PIC分別為0.511和0.512，F(xiàn)6代2個(gè)群體的平均PIC分別為0.48和0.505；F5代2個(gè)群體的期望雜合度（He）分別為0.575和0.574，F(xiàn)6代的He分別為0.546和0.566。結(jié)果表明經(jīng)過6個(gè)世代的繁育，偏離Hardy-Weinberg平衡的位點(diǎn)減少，以等位基因數(shù)目為標(biāo)志的群體遺傳多樣性下... 

【文章來源】：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁數(shù)】：71 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 引言
    1.1 研究的目的及意義
    1.2 微衛(wèi)星 DNA 概述
        1.2.1 微衛(wèi)星 DNA 的發(fā)現(xiàn)
        1.2.2 微衛(wèi)星 DNA 的結(jié)構(gòu)及特點(diǎn)
        1.2.3 微衛(wèi)星 DNA 的分布及起源
        1.2.4 微衛(wèi)星標(biāo)記在家禽中的應(yīng)用
    1.3 家禽主要組織相容性復(fù)合體概述
        1.3.1 雞（Gallus gallus）MHC 的結(jié)構(gòu)
        1.3.2 火雞（Meleagrisg allopavo）MHC 的結(jié)構(gòu)
        1.3.3 鵪鶉（Coturnix japonica）MHC 的結(jié)構(gòu)
        1.3.4 鵝（Anser cygnoides）MHC 的結(jié)構(gòu)
        1.3.5 鴨（Anas platyrhynchos）MHC 的結(jié)構(gòu)
        1.3.6 雞 MHC 單倍型與抗病性的關(guān)系
    1.4 TAP 基因概述
        1.4.1 人 TAP 基因及轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制
        1.4.2 雞的 TAP 基因及與 MHC 的關(guān)系
    1.5 HBK-SPF 鴨
        1.5.1 種源
        1.5.2 病原微生物凈化
        1.5.3 遺傳學(xué)結(jié)構(gòu)
第二章 HBK-SPF 鴨的群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
    2.1 材料
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
        2.1.2 主要儀器設(shè)備
        2.1.3 主要試劑
        2.1.4 微衛(wèi)星位點(diǎn)引物
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 基因組 DNA 的提取
        2.2.2 DNA 濃度和純度的檢測
        2.2.3 PCR 反應(yīng)體系
        2.2.4 PCR 產(chǎn)物的序列測定
        2.2.5 數(shù)據(jù)分析
    2.3 結(jié)果
        2.3.1 鴨微衛(wèi)星位點(diǎn)的基因頻率
        2.3.2 Hardy-Weinberg 平衡檢驗(yàn)
        2.3.3 群體內(nèi)遺傳變異參數(shù)
        2.3.4 群體間在世代間遺傳變異分析
    2.4 討論
        2.4.1 群體內(nèi)的遺傳變異
        2.4.2 群體間的遺傳變異
        2.4.3 與傳統(tǒng)飼養(yǎng)方式鴨的遺傳多樣性差異
第三章 鴨 MHC I 區(qū)域多態(tài)性位點(diǎn)篩選及不同單倍型鴨分群
    3.1 材料
        3.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
        3.1.2 主要試劑
    3.2 實(shí)驗(yàn)方法
        3.2.1 基因組 DNA 的提取
        3.2.2 多態(tài)性位點(diǎn)分析和引物設(shè)計(jì)
        3.3.3 PCR 反應(yīng)體系及反應(yīng)條件
        3.2.4 單鏈構(gòu)象多態(tài)性（SSCP）檢測
        3.2.5 序列分析
        3.2.6 A 位點(diǎn)多態(tài)性分析
        3.2.7 單倍型鴨種群的建立
    3.3 結(jié)果
        3.3.1 重復(fù)結(jié)構(gòu)的 PCR 擴(kuò)增結(jié)果
        3.3.2 SSCP 分析結(jié)果
        3.3.3 推測多態(tài)性位點(diǎn)的分析結(jié)果
    3.4 討論
第四章 不同單倍型鴨 TAP 基因結(jié)構(gòu)及生物信息學(xué)分析
    4.1 材料與方法
        4.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
        4.1.2 主要試劑
        4.1.3 引物設(shè)計(jì)
        4.1.4 反應(yīng)體系及反應(yīng)條件
        4.1.5 數(shù)據(jù)分析
    4.2 結(jié)果
        4.2.1 PCR 擴(kuò)增結(jié)果
        4.2.2 核苷酸同源性分析
        4.2.3 氨基酸同源性分析
        4.2.4 編碼區(qū)結(jié)構(gòu)預(yù)測
    4.3 討論
第五章 MHC 單倍型鴨鴨疫里默氏桿菌和 I 型鴨肝炎病毒感染試驗(yàn)
    5.1 材料與方法
        5.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
        5.1.2 主要試劑
        5.1.3 主要儀器
        5.1.4 不同單倍型鴨對鴨疫里默氏桿菌的感染試驗(yàn)
        5.1.5 不同單倍型鴨 I 型鴨肝炎病毒的感染試驗(yàn)
    5.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        5.2.1 鴨疫里默氏桿菌感染試驗(yàn)結(jié)果
        5.2.2 I 型鴨肝炎感染試驗(yàn)結(jié)果
    5.3 討論
第六章 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡介



本文編號：3179018