粘菌素耐藥基因(mcr-1-mcr-8)的流行病學(xué)調(diào)查及mcr-1傳播機(jī)制的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-05-08 19:02
粘菌素是一種環(huán)狀多肽類(lèi)抗菌素,主要用于治療畜禽胃腸道感染,在我國(guó)、歐洲等世界多個(gè)國(guó)家也長(zhǎng)期作為促生長(zhǎng)劑添加于飼料中。2016年,我國(guó)學(xué)者首次報(bào)道在大腸桿菌中發(fā)現(xiàn)質(zhì)粒攜帶的粘菌素耐藥基因(mcr-1),這種可水平傳播的粘菌素耐藥基因的報(bào)道突破了長(zhǎng)期以來(lái)認(rèn)為粘菌素不存在可轉(zhuǎn)移耐藥機(jī)制的觀點(diǎn)。截至目前,世界范圍內(nèi)共發(fā)現(xiàn)八種粘菌素耐藥基因(mcr-1,mcr-2,mcr-3,mcr-4,wcr-5,mcr-6,mcr-7,wcr-8)。作為治療多重耐藥革蘭氏陰性菌感染的最后一道防線,這些粘菌素耐藥基因和粘菌素耐藥菌株的出現(xiàn),極大地降低了粘菌素的使用有效性,同時(shí)也給人和動(dòng)物的健康帶來(lái)巨大的威脅。本研究首先建立了檢測(cè)八個(gè)質(zhì)粒介導(dǎo)的粘菌素耐藥基因的熒光定量PCR(qPCR)方法,并使用該方法對(duì)來(lái)自我國(guó)9省市的1,552份豬拭子,24省市的3,343份家禽拭子以及134份人拭子樣本進(jìn)行了八種mcr基因的流行現(xiàn)狀調(diào)查,同時(shí)還在我國(guó)禁止粘菌素用于促生長(zhǎng)劑兩年后,對(duì)mcr-1的持續(xù)性影響進(jìn)行了評(píng)估,最后對(duì)來(lái)自食源性動(dòng)物和非食源性動(dòng)物來(lái)源的mcr-1陽(yáng)性大腸桿菌進(jìn)行了耐藥特征分析,分子遺傳比較以及大腸桿茵mc...
【文章來(lái)源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:170 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
符號(hào)說(shuō)明
第一部分 文獻(xiàn)綜述 多粘菌素的研究進(jìn)展
1 多粘菌素概述
1.1 多粘菌素的化學(xué)結(jié)構(gòu)
1.2 多粘菌素的化學(xué)穩(wěn)定性
1.3 多粘菌素的作用機(jī)理
1.4 多粘菌素的抗菌譜
1.5 多粘菌素的敏感性分析方法
1.6 多粘菌素的耐藥監(jiān)測(cè)情況
2 多粘菌素的使用
2.1 多粘菌素在人類(lèi)醫(yī)學(xué)上的使用
2.2 多粘菌素在動(dòng)物中的使用
3 多粘菌素的耐藥機(jī)制
3.1 細(xì)菌的固有耐藥
3.2 脂多糖修飾
3.3 異質(zhì)性耐藥
3.4 質(zhì)粒介導(dǎo)的多粘菌素耐藥基因
4 多粘菌素耐藥菌的相關(guān)研究
4.1 多粘菌素耐藥的鮑曼不動(dòng)桿菌的流行現(xiàn)狀
4.2 多粘菌素耐藥的銅綠假單胞菌的流行現(xiàn)狀
4.3 多粘菌素耐藥的腸桿菌科細(xì)菌的流行現(xiàn)狀
5 質(zhì)粒介導(dǎo)的粘菌素耐藥基因
5.1 質(zhì)粒介導(dǎo)的粘菌素耐藥基因的發(fā)現(xiàn)
5.2 質(zhì)粒介導(dǎo)的粘菌素耐藥基因的種類(lèi)
5.3 質(zhì)粒介導(dǎo)的粘菌素耐藥基因的流行現(xiàn)狀
參考文獻(xiàn)
第二部分 研究?jī)?nèi)容
第一章 檢測(cè)八個(gè)粘菌素耐藥基因(mcr-1-mcr-8)的熒光定量PCR方法的建立
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果
2.1 特異性的mcr基因(mcr-1-mcr-8)的qPCR方法建立
3 討論
參考文獻(xiàn)
第二章 粘菌素耐藥基因(mcr-1-mcr-8)在我國(guó)豬體內(nèi)的分子流行病學(xué)調(diào)查
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果
2.1 八種不同粘菌素耐藥基因(mcr-1-mcr-8)在我國(guó)豬體內(nèi)的流行現(xiàn)狀
2.2 八種粘菌素耐藥基因在豬的鼻腔和肛門(mén)中的流行現(xiàn)狀
2.3 不同的粘菌素耐藥基因在豬體內(nèi)共感染的流行現(xiàn)狀
2.4 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析
3 討論
參考文獻(xiàn)
第三章 粘菌素耐藥基因(mcr-1-mcr-8)在我國(guó)家禽體內(nèi)的分子流行病學(xué)調(diào)查
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果
2.1 八種不同粘菌素耐藥基因(mcr-1-mcr-8)在我國(guó)家禽中的流行現(xiàn)狀
2.2 八種粘菌素耐藥基因在家禽的咽喉和泄殖腔的流行現(xiàn)狀
2.3 不同粘菌素耐藥基因在家禽體內(nèi)共感染的流行現(xiàn)狀
2.4 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析
3 討論
參考文獻(xiàn)
第四章 粘菌素耐藥基因(mcr-1-mcr-8)在不孕癥患者陰道拭子中的分子流行病學(xué)調(diào)查
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果
2.1 粘菌素耐藥基因(mcr-1-mcr-8)在不孕癥女性陰道拭子中的流行現(xiàn)狀
2.2 系統(tǒng)進(jìn)樹(shù)分析
3 討論
參考文獻(xiàn)
第五章 質(zhì)粒介導(dǎo)的粘菌素耐藥基因(mcr-1)的持續(xù)性影響
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果
2.1 mcr-1的陽(yáng)性率比較
2.2 mcr-1陽(yáng)性樣本拷貝數(shù)的比較
2.3 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析
2.4 mcr-1的體外轉(zhuǎn)移模擬
3 討論
參考文獻(xiàn)
第六章 攜帶mcr-1基因的大腸桿菌分離株的耐藥特性研究
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果
2.1 攜帶mcr-1的大腸桿菌PCR鑒定
2.2 攜帶mcr-1的大腸桿菌對(duì)粘菌素的耐藥性
2.3 攜帶mcr-1的大腸桿菌的藥物敏感性測(cè)定
2.4 攜帶mcr-1的食源性動(dòng)物大腸桿菌與非食源性動(dòng)物大腸桿菌的耐藥性比較
2.5 攜帶mcr-1的大腸桿菌耐藥譜及多重耐藥分析
3 討論
參考文獻(xiàn)
第七章 大腸桿菌mcr-1傳播機(jī)制的研究
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果
2.1 攜帶mcr-1的大腸桿菌的MLST分析
2.2 攜帶mcr-1的大腸桿菌的PFGE分型
2.3 攜帶mcr-1的大腸桿菌質(zhì)粒的接合轉(zhuǎn)移
2.4 攜帶mcr-1的大腸桿菌質(zhì)粒圖譜
2.5 質(zhì)粒接合轉(zhuǎn)移成功菌株的藥物敏感性實(shí)驗(yàn)
3 討論
參考文獻(xiàn)
全文總結(jié)
致謝
攻讀博士學(xué)位期間取得的科研成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]細(xì)菌耐藥性——全球矚目的焦點(diǎn)[J]. 陳代杰. 藥學(xué)進(jìn)展. 2018(06)
[2]mcr-1基因介導(dǎo)黏菌素耐藥性研究進(jìn)展[J]. 周洋,劉秋云,李玉寧,張丹艷. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2018(03)
[3]mcr-1介導(dǎo)多黏菌素耐藥性的研究進(jìn)展[J]. 趙菲菲,呂曉菊. 中國(guó)抗生素雜志. 2017(12)
[4]革蘭陰性菌異質(zhì)性耐藥的研究進(jìn)展[J]. 孫坤玲,徐繡宇,賈曉炯,張莉萍. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(09)
[5]多黏菌素異質(zhì)性耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌的研究[J]. 錢(qián)鎏佳,陳代杰,林惠敏. 中國(guó)抗生素雜志. 2017(03)
[6]質(zhì)粒介導(dǎo)的黏菌素耐藥基因mcr-1研究進(jìn)展[J]. 易靈嫻,劉藝云,吳仁杰,梁梓森,劉健華. 遺傳. 2017(02)
[7]多粘菌素耐藥性的研究進(jìn)展[J]. 王影,李艷然,韓鐫竹,高鐸,李欣南. 微生物學(xué)通報(bào). 2017(01)
[8]肺炎克雷伯菌脈沖場(chǎng)凝膠電泳分型能力評(píng)價(jià)[J]. 杜小莉,周海健. 疾病監(jiān)測(cè). 2015(11)
博士論文
[1]mcr-1基因在腸道病原菌中的分布特征與傳播規(guī)律研究[D]. 梁蓓蓓.軍事科學(xué)院 2018
碩士論文
[1]質(zhì)粒介導(dǎo)的黏菌素耐藥基因mcr-1的發(fā)現(xiàn)[D]. 劉藝云.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]禽致病性大腸桿菌脂多糖突變株的構(gòu)建及其生物學(xué)特性研究[D]. 韓月.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
本文編號(hào):3175834
【文章來(lái)源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:170 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
符號(hào)說(shuō)明
第一部分 文獻(xiàn)綜述 多粘菌素的研究進(jìn)展
1 多粘菌素概述
1.1 多粘菌素的化學(xué)結(jié)構(gòu)
1.2 多粘菌素的化學(xué)穩(wěn)定性
1.3 多粘菌素的作用機(jī)理
1.4 多粘菌素的抗菌譜
1.5 多粘菌素的敏感性分析方法
1.6 多粘菌素的耐藥監(jiān)測(cè)情況
2 多粘菌素的使用
2.1 多粘菌素在人類(lèi)醫(yī)學(xué)上的使用
2.2 多粘菌素在動(dòng)物中的使用
3 多粘菌素的耐藥機(jī)制
3.1 細(xì)菌的固有耐藥
3.2 脂多糖修飾
3.3 異質(zhì)性耐藥
3.4 質(zhì)粒介導(dǎo)的多粘菌素耐藥基因
4 多粘菌素耐藥菌的相關(guān)研究
4.1 多粘菌素耐藥的鮑曼不動(dòng)桿菌的流行現(xiàn)狀
4.2 多粘菌素耐藥的銅綠假單胞菌的流行現(xiàn)狀
4.3 多粘菌素耐藥的腸桿菌科細(xì)菌的流行現(xiàn)狀
5 質(zhì)粒介導(dǎo)的粘菌素耐藥基因
5.1 質(zhì)粒介導(dǎo)的粘菌素耐藥基因的發(fā)現(xiàn)
5.2 質(zhì)粒介導(dǎo)的粘菌素耐藥基因的種類(lèi)
5.3 質(zhì)粒介導(dǎo)的粘菌素耐藥基因的流行現(xiàn)狀
參考文獻(xiàn)
第二部分 研究?jī)?nèi)容
第一章 檢測(cè)八個(gè)粘菌素耐藥基因(mcr-1-mcr-8)的熒光定量PCR方法的建立
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果
2.1 特異性的mcr基因(mcr-1-mcr-8)的qPCR方法建立
3 討論
參考文獻(xiàn)
第二章 粘菌素耐藥基因(mcr-1-mcr-8)在我國(guó)豬體內(nèi)的分子流行病學(xué)調(diào)查
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果
2.1 八種不同粘菌素耐藥基因(mcr-1-mcr-8)在我國(guó)豬體內(nèi)的流行現(xiàn)狀
2.2 八種粘菌素耐藥基因在豬的鼻腔和肛門(mén)中的流行現(xiàn)狀
2.3 不同的粘菌素耐藥基因在豬體內(nèi)共感染的流行現(xiàn)狀
2.4 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析
3 討論
參考文獻(xiàn)
第三章 粘菌素耐藥基因(mcr-1-mcr-8)在我國(guó)家禽體內(nèi)的分子流行病學(xué)調(diào)查
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果
2.1 八種不同粘菌素耐藥基因(mcr-1-mcr-8)在我國(guó)家禽中的流行現(xiàn)狀
2.2 八種粘菌素耐藥基因在家禽的咽喉和泄殖腔的流行現(xiàn)狀
2.3 不同粘菌素耐藥基因在家禽體內(nèi)共感染的流行現(xiàn)狀
2.4 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析
3 討論
參考文獻(xiàn)
第四章 粘菌素耐藥基因(mcr-1-mcr-8)在不孕癥患者陰道拭子中的分子流行病學(xué)調(diào)查
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果
2.1 粘菌素耐藥基因(mcr-1-mcr-8)在不孕癥女性陰道拭子中的流行現(xiàn)狀
2.2 系統(tǒng)進(jìn)樹(shù)分析
3 討論
參考文獻(xiàn)
第五章 質(zhì)粒介導(dǎo)的粘菌素耐藥基因(mcr-1)的持續(xù)性影響
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果
2.1 mcr-1的陽(yáng)性率比較
2.2 mcr-1陽(yáng)性樣本拷貝數(shù)的比較
2.3 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析
2.4 mcr-1的體外轉(zhuǎn)移模擬
3 討論
參考文獻(xiàn)
第六章 攜帶mcr-1基因的大腸桿菌分離株的耐藥特性研究
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果
2.1 攜帶mcr-1的大腸桿菌PCR鑒定
2.2 攜帶mcr-1的大腸桿菌對(duì)粘菌素的耐藥性
2.3 攜帶mcr-1的大腸桿菌的藥物敏感性測(cè)定
2.4 攜帶mcr-1的食源性動(dòng)物大腸桿菌與非食源性動(dòng)物大腸桿菌的耐藥性比較
2.5 攜帶mcr-1的大腸桿菌耐藥譜及多重耐藥分析
3 討論
參考文獻(xiàn)
第七章 大腸桿菌mcr-1傳播機(jī)制的研究
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果
2.1 攜帶mcr-1的大腸桿菌的MLST分析
2.2 攜帶mcr-1的大腸桿菌的PFGE分型
2.3 攜帶mcr-1的大腸桿菌質(zhì)粒的接合轉(zhuǎn)移
2.4 攜帶mcr-1的大腸桿菌質(zhì)粒圖譜
2.5 質(zhì)粒接合轉(zhuǎn)移成功菌株的藥物敏感性實(shí)驗(yàn)
3 討論
參考文獻(xiàn)
全文總結(jié)
致謝
攻讀博士學(xué)位期間取得的科研成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]細(xì)菌耐藥性——全球矚目的焦點(diǎn)[J]. 陳代杰. 藥學(xué)進(jìn)展. 2018(06)
[2]mcr-1基因介導(dǎo)黏菌素耐藥性研究進(jìn)展[J]. 周洋,劉秋云,李玉寧,張丹艷. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2018(03)
[3]mcr-1介導(dǎo)多黏菌素耐藥性的研究進(jìn)展[J]. 趙菲菲,呂曉菊. 中國(guó)抗生素雜志. 2017(12)
[4]革蘭陰性菌異質(zhì)性耐藥的研究進(jìn)展[J]. 孫坤玲,徐繡宇,賈曉炯,張莉萍. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(09)
[5]多黏菌素異質(zhì)性耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌的研究[J]. 錢(qián)鎏佳,陳代杰,林惠敏. 中國(guó)抗生素雜志. 2017(03)
[6]質(zhì)粒介導(dǎo)的黏菌素耐藥基因mcr-1研究進(jìn)展[J]. 易靈嫻,劉藝云,吳仁杰,梁梓森,劉健華. 遺傳. 2017(02)
[7]多粘菌素耐藥性的研究進(jìn)展[J]. 王影,李艷然,韓鐫竹,高鐸,李欣南. 微生物學(xué)通報(bào). 2017(01)
[8]肺炎克雷伯菌脈沖場(chǎng)凝膠電泳分型能力評(píng)價(jià)[J]. 杜小莉,周海健. 疾病監(jiān)測(cè). 2015(11)
博士論文
[1]mcr-1基因在腸道病原菌中的分布特征與傳播規(guī)律研究[D]. 梁蓓蓓.軍事科學(xué)院 2018
碩士論文
[1]質(zhì)粒介導(dǎo)的黏菌素耐藥基因mcr-1的發(fā)現(xiàn)[D]. 劉藝云.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]禽致病性大腸桿菌脂多糖突變株的構(gòu)建及其生物學(xué)特性研究[D]. 韓月.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
本文編號(hào):3175834
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