為研究四川地區(qū)豬繁殖與呼吸綜合征病毒（PRRSV）的流行及進化趨勢,本研究以GP5蛋白為研究對象,對2018年間收集的378份四川省不同區(qū)市縣PRRSV疑似病料進行了實時熒光定量PCR檢測,并對部分毒株ORF5基因的核苷酸序列和推導的氨基酸序列進行進化分析和N-糖基化位點預測。通過疑似病料實時熒光定量PCR檢測,共檢出陽性樣品69份,陽性率為18.25%。對其中23株PRRSV的ORF5基因序列分析結果顯示,ORF5基因之間核苷酸同源性為81.6%～100%,推導的氨基酸同源性為81.4%～100%,均屬于美洲型毒株。其中,1株屬于以經(jīng)典毒株VR2332為代表的亞型Ⅰ,17株屬于以高致病毒株JXA1為代表的亞型Ⅱ,5株屬于重組毒株NADC30為代表的亞型Ⅲ,說明2018年間四川省PRRSV流行毒株存在基因多樣性,HP-PRRSV依然是主要流行毒株,但仍存在不斷進化的經(jīng)典毒株,同時,類似NADC30和QYYZ的重組毒株也開始出現(xiàn)。通過氨基酸突變位點和N-糖基化位點分析發(fā)現(xiàn),23株PRRSV在GP5兩個重要抗原表位相關區(qū)域和毒力相關位點均發(fā)生了一定程度的突變,推測這些突變可能影響了病毒逃避... 

【文章來源】：中國畜牧獸醫(yī). 2020,47(04)北大核心

【文章頁數(shù)】：11 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
        1.1.1 病料采集
        1.1.2 主要試劑及儀器
    1.2 RNA提取與反轉錄
    1.3 PRRSV熒光定量PCR檢測
    1.4 ORF5基因的擴增
    1.5 ORF5基因遺傳進化分析
    1.6 GP5蛋白糖基化位點預測
2 結 果
    2.1 PRRSV的實時熒光定量PCR鑒定
    2.2 陽性樣品ORF5基因測序結果
    2.3 ORF5基因的核苷酸序列同源性分析
    2.4 基于ORF5基因推導的氨基酸序列同源性分析
    2.5 基于ORF5基因核苷酸序列的PRRSV遺傳進化分析
    2.6 氨基酸突變位點分析
    2.7 GP5蛋白潛在N-糖基化位點變化分析
3 討 論
4 結 論


【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3175041