蒙古馬是我國(guó)五大固有類型馬品種之一,在長(zhǎng)時(shí)間的自然選擇以及人工選育條件下,逐漸形成了適應(yīng)極端惡劣氣候、耐粗飼、抗病和持久力強(qiáng)等特性。相比其他馬品種,耐力性能極為突出,適合長(zhǎng)距離賽事。國(guó)外對(duì)速度型賽馬純血馬開展了大量運(yùn)動(dòng)學(xué)研究工作,而對(duì)蒙古馬的運(yùn)動(dòng)學(xué)生理機(jī)制尚不明確。本研究選取6匹蒙古馬為實(shí)驗(yàn)對(duì)象,用Miseq高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)短期高負(fù)荷運(yùn)動(dòng)前后蒙古馬的骨骼肌進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和生物信息學(xué)分析。在專業(yè)騎手的騎乘下全速奔跑20 mins,分別在短期高負(fù)荷奔跑前與奔跑后活體采取骨骼肌組織,用Miseq高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)樣本建立轉(zhuǎn)錄組文庫(kù),并與純血馬基因組序列比對(duì),進(jìn)行差異表達(dá)基因分析及GO功能富集和KEGG pathway分析。結(jié)果顯示:從轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)中得到25367個(gè)SNP位點(diǎn),其中1號(hào)和11號(hào)染色體SNP數(shù)目最多;另外還發(fā)現(xiàn)了4種可變剪接類型,其中外顯子跳躍類型最多。短期高負(fù)荷運(yùn)動(dòng)后比運(yùn)功前可變剪接數(shù)量明顯提高。運(yùn)動(dòng)前后兩組中共檢測(cè)到205個(gè)顯著性差異表達(dá)基因（P<0.05）,120個(gè)基因上調(diào),85個(gè)基因下調(diào);GO功能富集分析結(jié)果顯示,77%的差異表達(dá)基因富集于生物學(xué)過程、7.7%富集于細(xì)... 

【文章來(lái)源】：內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)

【文章頁(yè)數(shù)】：53 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
縮略語(yǔ)表
1 引言
    1.1 馬屬動(dòng)物簡(jiǎn)介
    1.2 蒙古馬運(yùn)動(dòng)性能
    1.3 純血馬運(yùn)動(dòng)性能
    1.4 馬運(yùn)動(dòng)基因研究進(jìn)展
    1.5 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及Miseq測(cè)序技術(shù)
        1.5.1 轉(zhuǎn)錄組
        1.5.2 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)
        1.5.3 Miseq測(cè)序平臺(tái)
        1.5.4 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序在馬運(yùn)動(dòng)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用
2 試驗(yàn)主要內(nèi)容、目的及意義
    2.1 試驗(yàn)?zāi)康暮鸵饬x
    2.2 試驗(yàn)主要內(nèi)容與技術(shù)路線
3 蒙古馬短期高負(fù)荷運(yùn)動(dòng)前后轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)構(gòu)建及測(cè)序分析
    3.1 試驗(yàn)材料
        3.1.1 試驗(yàn)樣本
        3.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑耗材
        3.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器設(shè)備
        3.1.4 試驗(yàn)主要數(shù)據(jù)庫(kù)和分析軟件
    3.2 試驗(yàn)方法
        3.2.1 肌肉總RNA的提取
        3.2.2 檢測(cè)總RNA的完整性
        3.2.3 骨骼肌總RNA反轉(zhuǎn)錄合成cDNA
        3.2.4 實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)體系
        3.2.5 轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序文庫(kù)制備
        3.2.6 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量控制及序列比對(duì)
        3.2.7 基因差異表達(dá)分析
        3.2.8 差異基因的功能分析
        3.2.9 SNP統(tǒng)計(jì)與可變剪切分析
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 RNA質(zhì)量檢測(cè)與原始數(shù)據(jù)整理、過濾及質(zhì)量評(píng)估
        3.3.2 與參考基因組比對(duì)
        3.3.3 SNP與可變剪切分析
        3.3.4 差異表達(dá)序列的篩選
        3.3.5 相關(guān)性分析
        3.3.6 編碼蛋白的差異表達(dá)分析
        3.3.7 蒙古馬短期高負(fù)荷運(yùn)動(dòng)前后差異表達(dá)基因的實(shí)時(shí)定量檢測(cè)
        3.3.8 差異基因的GeneOntology功能富集分析
        3.3.9 差異基因KEGGPathway及KO富集分析
4 討論
5 結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
作者簡(jiǎn)介


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]蒙古馬高負(fù)荷運(yùn)動(dòng)訓(xùn)練前后轉(zhuǎn)錄組差異表達(dá)分析[J]. 趙啟南,芒來(lái),白東義,趙一萍,李蓓,烏尼爾夫,烏英嘎,蘇日嘎,敖乳嘎.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(06)
[2]馬屬動(dòng)物進(jìn)化特征概述[J]. 任秀娟,趙一萍,薩如拉,鮑紅梅,王希生,道楞,阿娜爾,魏睿元,蘇日嘎,彩麗干,白東義,李蓓,楊麗華,烏尼爾夫,芒來(lái).  畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(03)
[3]伊犁馬DMRT3基因多態(tài)性研究[J]. 何美升,于茜,高程程,曹行,馬海玉,劉玲玲,姜鑫,劉武軍.  新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(01)
[4]耐力訓(xùn)練對(duì)糖尿病糖脂代謝相關(guān)因子基因表達(dá)的影響[J]. 邵月.  中國(guó)老年學(xué)雜志. 2014(11)
[5]轉(zhuǎn)錄組與RNA-Seq技術(shù)[J]. 張春蘭,秦孜娟,王桂芝,紀(jì)志賓,王建民.  生物技術(shù)通報(bào). 2012(12)
[6]PGC-1α在骨骼肌運(yùn)動(dòng)、代謝調(diào)節(jié)中的作用[J]. 烏日古木拉,楊麗華,高雅汗,芒來(lái).  畜牧獸醫(yī)科技信息. 2011(12)
[7]蒙古馬肌酸激酶基因多態(tài)性和不同運(yùn)動(dòng)時(shí)期表達(dá)量的研究[J]. 楊麗華,白東義,烏日古木拉,高雅罕,黃金龍,趙啟楠,芒來(lái).  畜牧與獸醫(yī). 2011(12)
[8]Cyr61基因的生物學(xué)功能及在腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中的作用[J]. 喬英,郭瑞芳,呂有勇.  內(nèi)蒙古醫(yī)學(xué)雜志. 2011(02)
[9]肌球蛋白輕鏈的調(diào)節(jié)及其對(duì)腫瘤細(xì)胞增殖、轉(zhuǎn)移的影響[J]. 王叢陽(yáng),王輝,沈傳陸.  醫(yī)學(xué)綜述. 2010(21)
[10]不同品種豬背最長(zhǎng)肌eIF4E、PPARGC-1、VEGFA和C-Jun mRNA豐度比較研究[J]. 楊舟,王修啟.  華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2010(S1)

博士論文
[1]蒙古馬高負(fù)荷運(yùn)動(dòng)訓(xùn)練前后轉(zhuǎn)錄組與miRNA文庫(kù)特征及關(guān)聯(lián)分析[D]. 趙啟南.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]EGFR信號(hào)通路通過Egr2促進(jìn)骨祖細(xì)胞增殖并抑制骨祖細(xì)胞凋亡的實(shí)驗(yàn)性研究[D]. 蘭生輝.華中科技大學(xué) 2012
[3]蒙古馬MSTN基因克隆及序列分析和部分品種多態(tài)性研究[D]. 王全喜.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005

碩士論文
[1]訓(xùn)練對(duì)蒙古馬肌肉發(fā)育相關(guān)基因MyoG的表達(dá)量影響研究[D]. 敖乳嘎.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]六個(gè)品種馬CKM基因遺傳多樣性研究[D]. 姚全福.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010



本文編號(hào)：3170660