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寒泊羊脂聯(lián)素基因表達(dá)及生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-05-05 16:42
  試驗(yàn)旨在探究脂聯(lián)素(adiponectin,ADIPOQ)基因在不同月齡寒泊羊背最長肌組織中的表達(dá)規(guī)律及生物學(xué)特征。采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法對(duì)3個(gè)不同時(shí)期(1、7、13月齡)寒泊羊背最長肌組織中ADIPOQ基因mRNA表達(dá)水平進(jìn)行檢測(cè),并利用生物信息學(xué)方法分析ADIPOQ基因的核苷酸及編碼氨基酸序列分子結(jié)構(gòu)特征、蛋白特性及網(wǎng)絡(luò)互作蛋白。結(jié)果顯示,ADIPOQ基因在1、7、13月齡寒泊羊背最長肌組織中均有表達(dá),并隨著月齡增加呈現(xiàn)增加趨勢(shì),無顯著性差異(P>0.05)。綿羊ADIPOQ基因核苷酸及氨基酸序列與山羊(98.60%和99.00%)、牛(98.60%和87.00%)的同源性較高。蛋白理化性質(zhì)分析發(fā)現(xiàn),ADIPOQ蛋白分子式為C1172H1776N314O349S5,分子質(zhì)量為26.00 ku,理論等電點(diǎn)(pI)為5.88,推測(cè)該蛋白為酸性蛋白;ADIPOQ親水性總平均值(GRAVY)為-0.403,推測(cè)該蛋白為親水性蛋白,不屬于跨膜蛋白;信號(hào)肽序列為Met

【文章來源】:中國畜牧獸醫(yī). 2020,47(12)北大核心

【文章頁數(shù)】:10 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 樣品采集
    1.2 主要試劑
    1.3 組織RNA提取及cDNA合成
    1.4 引物設(shè)計(jì)及合成
    1.5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
    1.6 統(tǒng)計(jì)分析
    1.7 生物信息學(xué)分析
        1.7.1 序列獲取及系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建
        1.7.2 理化性質(zhì)分析及亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)
        1.7.3 蛋白高級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
        1.7.4 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)
2 結(jié) 果
    2.1 RNA提取與質(zhì)量檢測(cè)
    2.2 ADIPOQ基因在不同月齡寒泊羊背最長肌中的表達(dá)量
    2.3 綿羊ADIPOQ基因生物信息學(xué)分析
        2.3.1 不同物種ADIPOQ基因核苷酸及氨基酸序列相似性比對(duì)及系統(tǒng)發(fā)育分析
        2.3.2 ADIPOQ蛋白理化性質(zhì)分析
        2.3.3 ADIPOQ蛋白親/疏水性預(yù)測(cè)分析
        2.3.4 ADIPOQ跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
        2.3.5 ADIPOQ磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)
        2.3.6 ADIPOQ蛋白亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)
        2.3.7 ADIPOQ蛋白保守結(jié)構(gòu)域分析
        2.3.8 ADIPOQ蛋白高級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
        2.3.9 ADIPOQ蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析
3 討 論
4 結(jié) 論


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]貴州黑山羊ADIPOQ基因組織表達(dá)分析及脂肪中表達(dá)規(guī)律研究[J]. 楊洋,陳浩林,徐敏,倪鍇.  中國畜牧雜志. 2020(10)
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[3]牛肌內(nèi)前體脂肪細(xì)胞的分離培養(yǎng)及分化相關(guān)基因的表達(dá)規(guī)律研究[J]. 張萌萌,魏勝娟,王藝如,王深圳,鄭月英,鄭豪,顏培實(shí).  畜牧與獸醫(yī). 2018(05)
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[9]藏羊脂聯(lián)素基因多態(tài)性及其與產(chǎn)肉性能的相關(guān)性分析[J]. 楊樹猛,馬登錄,郭淑珍,李保明,馬忠濤,才讓鬧日,牛小瑩,格桂花,趙光平,楊秀蘭,張玉珍,尕旦吉,張海濱.  中國草食動(dòng)物科學(xué). 2014(02)
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本文編號(hào):3170229

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