四環(huán)素類藥物受體的制備及進(jìn)化
發(fā)布時(shí)間:2021-04-21 16:00
獸藥在畜牧業(yè)快速發(fā)展過程中發(fā)揮著不可替代的作用,四環(huán)素類藥物作為一類廣譜抗生素被廣泛用于治療動(dòng)物的多種感染性疾病。但此類藥物在動(dòng)物性食品中的殘留會(huì)給消費(fèi)者帶來一系列潛在的健康危害。本論文的目的是制備出四環(huán)素類藥物的受體TetR蛋白并對(duì)其進(jìn)行定向進(jìn)化,以其為識(shí)別元件建立新型免疫法對(duì)此類藥物在動(dòng)物性食品中的殘留進(jìn)行檢測(cè)。首先,研究者從四環(huán)素耐藥菌中提取總DNA,利用PCR技術(shù)擴(kuò)增出TetR蛋白的基因,將其插入表達(dá)載體并導(dǎo)入BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞中進(jìn)行表達(dá)。結(jié)果表明,該TetR蛋白的分子量為44 KDa,能同時(shí)識(shí)別5種四環(huán)素類藥物,IC50為2.37-31 ng/mL。分子對(duì)接的結(jié)果表明,該受體的結(jié)合位點(diǎn)由12個(gè)氨基酸組成,它們主要通過疏水作用力和pi-pi鍵與藥物分子中的D環(huán)發(fā)生結(jié)合。以該TetR蛋白為核心試劑建立的競(jìng)爭(zhēng)化學(xué)發(fā)光免疫法可以對(duì)牛奶中的這5種四環(huán)素類藥物進(jìn)行檢測(cè),檢測(cè)限為1.24-15.7 ng/mL,添加回收率為77-96%。然后,研究者對(duì)TetR蛋白中的關(guān)鍵接觸氨基酸分別進(jìn)行了虛擬突變。結(jié)果表明,將105位脯氨酸突變?yōu)楸奖彼岷屠野彼釙r(shí),受體的穩(wěn)定性明顯提升。于是研究...
【文章來源】:河北農(nóng)業(yè)大學(xué)河北省
【文章頁數(shù)】:93 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 引言
1.1 四環(huán)素類藥物概述
1.1.1 理化性質(zhì)
1.1.2 作用機(jī)制
1.1.3 藥物殘留及其危害
1.2 四環(huán)素類藥物殘留檢測(cè)方法現(xiàn)狀
1.2.1 微生物法
1.2.2 理化檢測(cè)法
1.2.3 免疫分析方法
1.2.4 其它
1.3 受體
1.3.1 受體免疫分析法
1.3.2 受體免疫分析法應(yīng)用于獸藥殘留檢測(cè)
1.3.3 TetR蛋白
1.4 分子對(duì)接及定向進(jìn)化
1.4.1 受體空間結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
1.4.2 分子對(duì)接
1.4.3 定點(diǎn)突變技術(shù)
1.5 研究目的和意義
2 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 藥品與試劑
2.1.2 所用儀器
2.1.3 所用溶液
2.1.4 所用軟件
2.2 TetR受體的制備及鑒定
2.2.1 合成引物
2.2.2 四環(huán)素耐藥菌復(fù)蘇
2.2.3 TetR基因的擴(kuò)增和純化
2.2.4 酶切載體及基因
2.2.5 目的片段與重組載體連接及轉(zhuǎn)化
2.2.6 TetR受體的原核表達(dá)
2.2.7 TetR受體的純化
2.2.8 TetR受體的鑒定
2.2.9 添加回收實(shí)驗(yàn)
2.3 TetR受體的體外進(jìn)化
2.3.1 序列對(duì)比
2.3.2 同源建模
2.3.3 分子對(duì)接
2.3.4 構(gòu)建TetR突變體模型
2.3.5 TetR突變體分子對(duì)接
2.3.6 合成突變體引物
2.3.7 定點(diǎn)突變
2.3.8 突變質(zhì)粒轉(zhuǎn)化
2.3.9 誘導(dǎo)TetR突變體表達(dá)
2.3.10 TetR突變體純化
2.3.11 TetR突變體的鑒定
2.4 固相分散微萃取結(jié)合超高效液相(MOF-MIP-DSPME-UPLC)方法的建立
2.4.1 金屬-有機(jī)框架材料(MOF)的制備
2.4.2 MOF-MIP的制備及檢驗(yàn)
2.4.3 UPLC條件
2.4.4 添加回收實(shí)驗(yàn)
3 結(jié)果與分析
3.1 TetR受體的制備
3.1.1 TetR基因
3.1.2 重組表達(dá)載體
3.1.3 TetR受體誘導(dǎo)表達(dá)
3.1.4 TetR受體純化
3.1.5 建立化學(xué)發(fā)光法檢測(cè)牛奶中四環(huán)素藥物殘留
3.1.6 樣品檢測(cè)
3.2 同源建模及體外進(jìn)化
3.2.1 序列對(duì)比
3.2.2 同源建模
3.2.3 分子對(duì)接
3.2.4 構(gòu)建突變體模型
3.2.5 突變體分子對(duì)接
3.2.6 定點(diǎn)突變及突變體基因
3.2.7 TetR突變體的表達(dá)及純化
3.2.8 建立競(jìng)爭(zhēng)熒光免疫法檢測(cè)雞蛋中四環(huán)素藥物殘留
3.2.9 樣品提取及添加回收
3.3 MOF-MIP- DSPME-UPLC方法的建立及應(yīng)用
3.3.1 MOF和MOF-MIP的檢驗(yàn)
3.3.2 MOF-MIP的性能
3.3.3 樣品檢測(cè)
4 討論
4.1 TetR受體的分子識(shí)別機(jī)制
4.2 體外進(jìn)化
4.2.1 分子對(duì)接
4.2.2 定點(diǎn)突變
4.3 相關(guān)方法的比較
4.4 展望
5 結(jié)論
5.1 成功制備出了四環(huán)素類藥物的受體TetR蛋白
5.2 成功對(duì)TetR蛋白進(jìn)行了體外定向進(jìn)化
5.3 建立了MOF-MIP-DSPME-UPLC法
參考文獻(xiàn)
在讀期間發(fā)表論文
作者簡介
致謝
附錄
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]酶比色法測(cè)定特殊醫(yī)學(xué)用途嬰兒配方食品中的膽堿含量[J]. 柯燕娜,張玉柱,鮑笑嶺,裴煒. 乳業(yè)科學(xué)與技術(shù). 2020(01)
[2]基于熒光光譜、表面等離子體共振、分子對(duì)接技術(shù)的天然產(chǎn)物中14-3-3τ蛋白抑制劑的篩選[J]. 何田,賈瑋娟,王彎彎,王弘. 國際藥學(xué)研究雜志. 2019(08)
[3]光譜法及分子對(duì)接技術(shù)研究黃體酮與牛血清白蛋白的結(jié)合機(jī)制[J]. 楊淑玲,廖先萍,范星,庹潯. 發(fā)光學(xué)報(bào). 2019(11)
[4]基于碳點(diǎn)-銪的比率熒光探針可視化檢測(cè)四環(huán)素[J]. 楊偉強(qiáng),張桂云,林華,倪建聰,黃玲鳳. 高等學(xué)校化學(xué)學(xué)報(bào). 2019(11)
[5]一種雞肉中四環(huán)素類獸藥殘留高效液相色譜檢測(cè)方法的建立[J]. 王余磊,舒相華,張雪,高云梅,楊崑,張雅靖,呂濤,宋春蓮. 甘肅畜牧獸醫(yī). 2019(10)
[6]非水毛細(xì)管電泳在手性分離中的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 王超越,孫文宇,呂華偉,顏繼忠,童勝強(qiáng). 理化檢驗(yàn)(化學(xué)分冊(cè)). 2019(10)
[7]毛細(xì)管電泳檢測(cè)技術(shù)專利狀況分析[J]. 田裕,胡正耀. 分析試驗(yàn)室. 2019(09)
[8]競(jìng)爭(zhēng)化學(xué)發(fā)光酶免疫檢測(cè)動(dòng)物源性食品中四環(huán)素殘留[J]. 欒軍,王毅謙,龍?jiān)气P,張曉燕,柳菡,蔣魯巖,高玲,封振,馬麗. 食品工業(yè)科技. 2020(04)
[9]超高效液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜法檢測(cè)水產(chǎn)品中四環(huán)素類藥物及其差向異構(gòu)體[J]. 李佩佩,張小軍,嚴(yán)忠雍,陳思,張帥,方益,龍舉. 中國食品學(xué)報(bào). 2019(07)
[10]檢測(cè)利巴韋林殘留的化學(xué)發(fā)光酶免疫法建立[J]. 何方洋,崔廷婷,王兆芹,顧蓉蓉,馮月君,蔣金峰,叢倩千,楊春艷. 畜牧與獸醫(yī). 2019(06)
博士論文
[1]氨基酸突變對(duì)四種蛋白質(zhì)與其配體相互作用影響的分子動(dòng)力學(xué)模擬研究[D]. 牛瑞娟.吉林大學(xué) 2019
[2]基于群智能算法的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)研究[D]. 陳燁.中國礦業(yè)大學(xué) 2018
[3]蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)從頭預(yù)測(cè)構(gòu)象空間優(yōu)化理論與方法[D]. 周曉根.浙江工業(yè)大學(xué) 2018
[4]比例型熒光探針的設(shè)計(jì)合成及生物應(yīng)用研究[D]. 李新然.蘭州大學(xué) 2018
[5]基于適配體識(shí)別—化學(xué)發(fā)光功能化納米探針的食品安全危害因子檢測(cè)方法研究[D]. 郝麗玲.江南大學(xué) 2017
[6]土壤—蔬菜系統(tǒng)中四環(huán)素類抗生素遷移積累與污染的細(xì)胞診斷方法[D]. 劉娣.浙江大學(xué) 2017
[7]基于受體蛋白MphR(A和E)的類ELISA構(gòu)建及在大環(huán)內(nèi)酯類藥物殘留檢測(cè)的初步應(yīng)用[D]. 程永友.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[8]動(dòng)物性食品中喹噁啉類藥物代謝物和磺胺類—喹諾酮類藥物多殘留免疫分析方法研究[D]. 蔣文曉.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[9]G蛋白偶聯(lián)受體與小分子配體相互作用機(jī)制的分子模擬研究[D]. 白啟峰.蘭州大學(xué) 2014
[10]雞肉中金剛烷胺殘留的生物識(shí)別材料研究與親和檢測(cè)方法建立[D]. 孫海新.中國海洋大學(xué) 2013
碩士論文
[1]同源異效桑源藥材(桑葉、桑枝、桑白皮、桑椹)的物質(zhì)基礎(chǔ)研究[D]. 成勝榮.江蘇大學(xué) 2019
[2]基于酶抑制與銅介導(dǎo)的熒光分析法用于有機(jī)磷農(nóng)藥的檢測(cè)[D]. 黃念.廣西師范大學(xué) 2019
[3]幾種中藥有效成分與生物大分子相互作用機(jī)制的光譜法及分子對(duì)接研究[D]. 吳鋆.長春師范大學(xué) 2019
[4]微生物法生產(chǎn)甘油酸的發(fā)酵及提取工藝研究[D]. 姚浩軻.河南大學(xué) 2019
[5]基于分子對(duì)接的海水魚ACE抑制三肽鑒定及作用機(jī)制研究[D]. 樊玥.渤海大學(xué) 2019
[6]兩類催眠鎮(zhèn)靜藥的殘留檢測(cè)方法研究[D]. 夏婉秋.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[7]通過氨基酸定點(diǎn)突變調(diào)控水稻OsHAL3蛋白功能的研究[D]. 仝澤方.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[8]30%土霉素注射液組方的改進(jìn)和制備工藝的優(yōu)化[D]. 李雙江.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[9]吩噻嗪類藥物單鏈抗體的制備及進(jìn)化[D]. 史芳舒.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[10]等度洗脫HPLC法靈敏檢測(cè)四環(huán)素類抗生素及其差向異構(gòu)體的研究[D]. 賴曉靜.南昌大學(xué) 2018
本文編號(hào):3152058
【文章來源】:河北農(nóng)業(yè)大學(xué)河北省
【文章頁數(shù)】:93 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 引言
1.1 四環(huán)素類藥物概述
1.1.1 理化性質(zhì)
1.1.2 作用機(jī)制
1.1.3 藥物殘留及其危害
1.2 四環(huán)素類藥物殘留檢測(cè)方法現(xiàn)狀
1.2.1 微生物法
1.2.2 理化檢測(cè)法
1.2.3 免疫分析方法
1.2.4 其它
1.3 受體
1.3.1 受體免疫分析法
1.3.2 受體免疫分析法應(yīng)用于獸藥殘留檢測(cè)
1.3.3 TetR蛋白
1.4 分子對(duì)接及定向進(jìn)化
1.4.1 受體空間結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
1.4.2 分子對(duì)接
1.4.3 定點(diǎn)突變技術(shù)
1.5 研究目的和意義
2 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 藥品與試劑
2.1.2 所用儀器
2.1.3 所用溶液
2.1.4 所用軟件
2.2 TetR受體的制備及鑒定
2.2.1 合成引物
2.2.2 四環(huán)素耐藥菌復(fù)蘇
2.2.3 TetR基因的擴(kuò)增和純化
2.2.4 酶切載體及基因
2.2.5 目的片段與重組載體連接及轉(zhuǎn)化
2.2.6 TetR受體的原核表達(dá)
2.2.7 TetR受體的純化
2.2.8 TetR受體的鑒定
2.2.9 添加回收實(shí)驗(yàn)
2.3 TetR受體的體外進(jìn)化
2.3.1 序列對(duì)比
2.3.2 同源建模
2.3.3 分子對(duì)接
2.3.4 構(gòu)建TetR突變體模型
2.3.5 TetR突變體分子對(duì)接
2.3.6 合成突變體引物
2.3.7 定點(diǎn)突變
2.3.8 突變質(zhì)粒轉(zhuǎn)化
2.3.9 誘導(dǎo)TetR突變體表達(dá)
2.3.10 TetR突變體純化
2.3.11 TetR突變體的鑒定
2.4 固相分散微萃取結(jié)合超高效液相(MOF-MIP-DSPME-UPLC)方法的建立
2.4.1 金屬-有機(jī)框架材料(MOF)的制備
2.4.2 MOF-MIP的制備及檢驗(yàn)
2.4.3 UPLC條件
2.4.4 添加回收實(shí)驗(yàn)
3 結(jié)果與分析
3.1 TetR受體的制備
3.1.1 TetR基因
3.1.2 重組表達(dá)載體
3.1.3 TetR受體誘導(dǎo)表達(dá)
3.1.4 TetR受體純化
3.1.5 建立化學(xué)發(fā)光法檢測(cè)牛奶中四環(huán)素藥物殘留
3.1.6 樣品檢測(cè)
3.2 同源建模及體外進(jìn)化
3.2.1 序列對(duì)比
3.2.2 同源建模
3.2.3 分子對(duì)接
3.2.4 構(gòu)建突變體模型
3.2.5 突變體分子對(duì)接
3.2.6 定點(diǎn)突變及突變體基因
3.2.7 TetR突變體的表達(dá)及純化
3.2.8 建立競(jìng)爭(zhēng)熒光免疫法檢測(cè)雞蛋中四環(huán)素藥物殘留
3.2.9 樣品提取及添加回收
3.3 MOF-MIP- DSPME-UPLC方法的建立及應(yīng)用
3.3.1 MOF和MOF-MIP的檢驗(yàn)
3.3.2 MOF-MIP的性能
3.3.3 樣品檢測(cè)
4 討論
4.1 TetR受體的分子識(shí)別機(jī)制
4.2 體外進(jìn)化
4.2.1 分子對(duì)接
4.2.2 定點(diǎn)突變
4.3 相關(guān)方法的比較
4.4 展望
5 結(jié)論
5.1 成功制備出了四環(huán)素類藥物的受體TetR蛋白
5.2 成功對(duì)TetR蛋白進(jìn)行了體外定向進(jìn)化
5.3 建立了MOF-MIP-DSPME-UPLC法
參考文獻(xiàn)
在讀期間發(fā)表論文
作者簡介
致謝
附錄
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]酶比色法測(cè)定特殊醫(yī)學(xué)用途嬰兒配方食品中的膽堿含量[J]. 柯燕娜,張玉柱,鮑笑嶺,裴煒. 乳業(yè)科學(xué)與技術(shù). 2020(01)
[2]基于熒光光譜、表面等離子體共振、分子對(duì)接技術(shù)的天然產(chǎn)物中14-3-3τ蛋白抑制劑的篩選[J]. 何田,賈瑋娟,王彎彎,王弘. 國際藥學(xué)研究雜志. 2019(08)
[3]光譜法及分子對(duì)接技術(shù)研究黃體酮與牛血清白蛋白的結(jié)合機(jī)制[J]. 楊淑玲,廖先萍,范星,庹潯. 發(fā)光學(xué)報(bào). 2019(11)
[4]基于碳點(diǎn)-銪的比率熒光探針可視化檢測(cè)四環(huán)素[J]. 楊偉強(qiáng),張桂云,林華,倪建聰,黃玲鳳. 高等學(xué)校化學(xué)學(xué)報(bào). 2019(11)
[5]一種雞肉中四環(huán)素類獸藥殘留高效液相色譜檢測(cè)方法的建立[J]. 王余磊,舒相華,張雪,高云梅,楊崑,張雅靖,呂濤,宋春蓮. 甘肅畜牧獸醫(yī). 2019(10)
[6]非水毛細(xì)管電泳在手性分離中的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 王超越,孫文宇,呂華偉,顏繼忠,童勝強(qiáng). 理化檢驗(yàn)(化學(xué)分冊(cè)). 2019(10)
[7]毛細(xì)管電泳檢測(cè)技術(shù)專利狀況分析[J]. 田裕,胡正耀. 分析試驗(yàn)室. 2019(09)
[8]競(jìng)爭(zhēng)化學(xué)發(fā)光酶免疫檢測(cè)動(dòng)物源性食品中四環(huán)素殘留[J]. 欒軍,王毅謙,龍?jiān)气P,張曉燕,柳菡,蔣魯巖,高玲,封振,馬麗. 食品工業(yè)科技. 2020(04)
[9]超高效液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜法檢測(cè)水產(chǎn)品中四環(huán)素類藥物及其差向異構(gòu)體[J]. 李佩佩,張小軍,嚴(yán)忠雍,陳思,張帥,方益,龍舉. 中國食品學(xué)報(bào). 2019(07)
[10]檢測(cè)利巴韋林殘留的化學(xué)發(fā)光酶免疫法建立[J]. 何方洋,崔廷婷,王兆芹,顧蓉蓉,馮月君,蔣金峰,叢倩千,楊春艷. 畜牧與獸醫(yī). 2019(06)
博士論文
[1]氨基酸突變對(duì)四種蛋白質(zhì)與其配體相互作用影響的分子動(dòng)力學(xué)模擬研究[D]. 牛瑞娟.吉林大學(xué) 2019
[2]基于群智能算法的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)研究[D]. 陳燁.中國礦業(yè)大學(xué) 2018
[3]蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)從頭預(yù)測(cè)構(gòu)象空間優(yōu)化理論與方法[D]. 周曉根.浙江工業(yè)大學(xué) 2018
[4]比例型熒光探針的設(shè)計(jì)合成及生物應(yīng)用研究[D]. 李新然.蘭州大學(xué) 2018
[5]基于適配體識(shí)別—化學(xué)發(fā)光功能化納米探針的食品安全危害因子檢測(cè)方法研究[D]. 郝麗玲.江南大學(xué) 2017
[6]土壤—蔬菜系統(tǒng)中四環(huán)素類抗生素遷移積累與污染的細(xì)胞診斷方法[D]. 劉娣.浙江大學(xué) 2017
[7]基于受體蛋白MphR(A和E)的類ELISA構(gòu)建及在大環(huán)內(nèi)酯類藥物殘留檢測(cè)的初步應(yīng)用[D]. 程永友.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[8]動(dòng)物性食品中喹噁啉類藥物代謝物和磺胺類—喹諾酮類藥物多殘留免疫分析方法研究[D]. 蔣文曉.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[9]G蛋白偶聯(lián)受體與小分子配體相互作用機(jī)制的分子模擬研究[D]. 白啟峰.蘭州大學(xué) 2014
[10]雞肉中金剛烷胺殘留的生物識(shí)別材料研究與親和檢測(cè)方法建立[D]. 孫海新.中國海洋大學(xué) 2013
碩士論文
[1]同源異效桑源藥材(桑葉、桑枝、桑白皮、桑椹)的物質(zhì)基礎(chǔ)研究[D]. 成勝榮.江蘇大學(xué) 2019
[2]基于酶抑制與銅介導(dǎo)的熒光分析法用于有機(jī)磷農(nóng)藥的檢測(cè)[D]. 黃念.廣西師范大學(xué) 2019
[3]幾種中藥有效成分與生物大分子相互作用機(jī)制的光譜法及分子對(duì)接研究[D]. 吳鋆.長春師范大學(xué) 2019
[4]微生物法生產(chǎn)甘油酸的發(fā)酵及提取工藝研究[D]. 姚浩軻.河南大學(xué) 2019
[5]基于分子對(duì)接的海水魚ACE抑制三肽鑒定及作用機(jī)制研究[D]. 樊玥.渤海大學(xué) 2019
[6]兩類催眠鎮(zhèn)靜藥的殘留檢測(cè)方法研究[D]. 夏婉秋.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[7]通過氨基酸定點(diǎn)突變調(diào)控水稻OsHAL3蛋白功能的研究[D]. 仝澤方.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[8]30%土霉素注射液組方的改進(jìn)和制備工藝的優(yōu)化[D]. 李雙江.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[9]吩噻嗪類藥物單鏈抗體的制備及進(jìn)化[D]. 史芳舒.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[10]等度洗脫HPLC法靈敏檢測(cè)四環(huán)素類抗生素及其差向異構(gòu)體的研究[D]. 賴曉靜.南昌大學(xué) 2018
本文編號(hào):3152058
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