發(fā)布時(shí)間：2021-04-20 09:18

　　為探討豬活化白細(xì)胞黏附分子（Activated Leukocyte Cell Adhesion Molecule,ALCAM）基因的結(jié)構(gòu)與功能,本研究運(yùn)用EMBOSS和Codon W軟件分析豬ALCAM基因密碼子使用偏好性,運(yùn)用生物信息學(xué)相關(guān)軟件分析ALCAM蛋白的理化性質(zhì)、結(jié)構(gòu)功能并預(yù)測(cè)與其存在互作關(guān)系的蛋白,運(yùn)用實(shí)時(shí)熒光定量的方法檢測(cè)ALCAM基因在梅山豬不同組織中的表達(dá)水平。結(jié)果表明:ALCAM基因偏好使用以A/U結(jié)尾的密碼子,存在28個(gè)偏好性較強(qiáng)的密碼子（RSCU值>1）,其中CGG、AGA、GGA、GCU、ACA這5個(gè)密碼子的偏好性最強(qiáng),豬ALCAM基因與小鼠和酵母基因組的密碼子使用差異小于大腸桿菌基因組,表明小鼠和酵母更適合作為ALCAM基因的外源表達(dá)系統(tǒng);豬ALCAM基因CDS區(qū)序列全長(zhǎng)1 713 bp,編碼570個(gè)氨基酸,為脂溶性、不穩(wěn)定的親水性蛋白,存在一個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域（515～537 aa）和信號(hào)肽區(qū)域（1～27 aa）;該蛋白存在5個(gè)潛在的N-糖基化位點(diǎn)和96個(gè)特異性蛋白激酶結(jié)合位點(diǎn),二級(jí)結(jié)構(gòu)以無(wú)規(guī)則卷曲和延伸鏈為主,可能與CD6、CD44、PTPRC和CNT... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)畜牧雜志. 2020,56(11)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：6 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 實(shí)驗(yàn)材料
    1.2引物設(shè)計(jì)與合成
    1.3 總RNA提取、c DNA合成和熒光定量反應(yīng)
    1.4豬ALCAM基因密碼子偏好性分析
    1.5 生物信息學(xué)分析
    1.6 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 ALCAM基因組、m RNA和蛋白結(jié)構(gòu)分析
    2.2 豬ALCAM基因密碼子偏好性分析
        2.2.1 豬ALCAM基因堿基組成及相關(guān)參數(shù)分析
        2.2.2 豬ALCAM基因RSCU值分析
        2.2.3 與模式生物基因組密碼子使用頻率比較分析
    2.3 豬ALCAM基因蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能位點(diǎn)分析
    2.4 進(jìn)化分析
    2.5 梅山豬ALCAM基因組織表達(dá)譜分析
3 討論
4 結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]草原紅牛FABP7基因克隆、生物信息學(xué)及組織表達(dá)差異分析[J]. 呂陽(yáng),曹陽(yáng),高一,劉理想,薛佳佳,張國(guó)梁.  中國(guó)畜牧雜志. 2019(09)
[2]類烏齊牦牛SIRT3基因克隆與生物信息學(xué)及差異表達(dá)分析[J]. 楊玉梅,柴志欣,王會(huì),王吉坤,信金偉,姬秋梅,鐘金城.  中國(guó)畜牧雜志. 2019(06)
[3]蛋白質(zhì)糖基化修飾的研究進(jìn)展[J]. 王曉龍,王秀然,盧天成.  基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(10)
[4]豬miR-192對(duì)DLG5和ALCAM基因的靶向作用關(guān)系驗(yàn)證[J]. 孫麗,吳森,吳嘉韻,趙呈祥,吳圣龍,包文斌.  農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2017(09)



本文編號(hào)：3149410