應激是現(xiàn)代養(yǎng)豬生產中影響豬生長性能等性狀的重要因素,而氧化應激又是眾多應激中比較常見的一種類型。氧化應激通過影響豬機體的相關基因和長鏈非編碼RNA（long noncoding RNA,lncRNA）的表達調控,造成機體組織的氧化損傷,引起各種機能和代謝的變化,使其處于亞健康狀態(tài),降低生產性能。豬機體可以利用自身的抗氧化系統(tǒng)來消除氧化應激產生的負面作用;豬屠宰后胴體的抗氧化酶可以維持肌肉氧化還原狀態(tài)的穩(wěn)衡。那么,氧化應激導致豬肝臟組織中l(wèi)ncRNA和基因發(fā)生異常表達,以及利用宰后24h的pH值（即終點pH,pHu）評估胴體肌肉的抗氧化性狀等內容未見研究報道。因此,本研究首先以長白豬斷奶仔豬為試驗動物,利用Diquat（DQ）構建斷奶仔豬的氧化應激模型,探討氧化應激條件下斷奶仔豬肝臟組織轉錄組的表達特征;然后,通過對胴體肌肉抗氧化性狀與pHu的相關性分析,以及不同pHu分組對抗氧化酶活性及其基因的表達量的影響,建立胴體肌肉抗氧化性狀與pHu之間的評估關系。主要研究內容及結果如下:1、對氧化應激組斷奶仔豬進行腹腔注射10 mg/kg體重DQ后,仔豬表現(xiàn)出嘔吐、食欲下降,并伴隨直腸溫度顯著升... 

【文章來源】：山東農業(yè)大學山東省

【文章頁數(shù)】：94 頁

【學位級別】：博士

【部分圖文】：

lncRNA的分類（引自Maetal,2013）

10圖 1-2 長鏈非編碼 RNA（lncRNA）或不同種類的 lncRNA 在生物發(fā)生、成熟和降解的不點被差異調控（引自 Quinn & Chang, 2016）Fig.1-2 Some long non-coding RNAs (lncRNAs) or classes of lncRNAs are regulated differentialdifferent points of their biogenesis, maturation and degradation (citated from Quinn & Chang, 201.3.2 氧化應激相關的 mRNA（1）Nrf2 基因

圖 2-1 lncRNA 序列生物信息學分析Figure 2-1 The bioinformatic analysis for lncRNA sequencing據(jù)生物信息學分析a Hiseq 得到的原始圖像數(shù)據(jù)文件經 CASAVA 堿基識別(Base測序序列(Sequenced Reads)，我們稱之為 Raw Data 或 Raw Re稱為 fq）文件格式存儲，其中包含測序序列（reads）的序列信量信息。對測序的原始數(shù)據(jù)通過 FastQC 進行質量評估。ic 進行質量剪切，得到相對準確的有效數(shù)據(jù)。NA-seq 測序評估ISAT2將樣本有效數(shù)據(jù)比對到參考基因組上，統(tǒng)計Mapping信息果進行冗余序列分析、插入片段分布等分析。采用 Qualimap 根分布檢查、基因組結構分布等分析。利用 BEDTools 進行基因覆上測序序列分布等分析。

【參考文獻】：
期刊論文
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[2]殼寡糖對氧化應激仔豬生長性能、抗氧化能力及空腸養(yǎng)分消化和轉運能力的影響[J]. 田剛,黃琳惠,宋曉華,陳代文,毛湘冰,虞潔,鄭萍,何軍,余冰.  動物營養(yǎng)學報. 2018(07)
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[6]核因子E2相關因子2調控機體抗氧化途徑特性及其與畜禽的健康和肉品質的關系[J]. 林謙,邱磊,云龍,曹蓉,賀喜,侯德興.  動物營養(yǎng)學報. 2014(06)
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博士論文
[1]約克夏豬和金華豬甲狀腺組織mRNA、lncRNA和miRNA測序及功能分析[D]. 沈一飛.浙江大學 2016
[2]氧化應激對仔豬精氨酸代謝和需求特點的影響及機制研究[D]. 鄭萍.四川農業(yè)大學 2010
[3]仔豬氧化應激及硒的抗應激效應和機理的研究[D]. 袁施彬.四川農業(yè)大學 2007

碩士論文
[1]日糧添加L-茶氨酸對斷奶仔豬的抗應激效果研究[D]. 劉通.西北農林科技大學 2016
[2]葡萄籽提取物減緩西雜肉牛空腸上皮細胞熱應激反應的功能與機制研究[D]. 朱旺.西南大學 2015
[3]奶牛肢蹄病患牛體內礦物元素和氧化應激指標的變化[D]. 李忠鵬.山東農業(yè)大學 2014
[4]豬CuZnSOD基因的克隆、mRNA表達及其對肉質抗氧化性能的影響[D]. 杜金芳.山東農業(yè)大學 2011
[5]豬氧化應激模型構建以及茶多酚的抗應激效應的研究[D]. 徐靜.四川農業(yè)大學 2009



本文編號：3144012