應(yīng)激是現(xiàn)代養(yǎng)豬生產(chǎn)中影響豬生長(zhǎng)性能等性狀的重要因素,而氧化應(yīng)激又是眾多應(yīng)激中比較常見(jiàn)的一種類(lèi)型。氧化應(yīng)激通過(guò)影響豬機(jī)體的相關(guān)基因和長(zhǎng)鏈非編碼RNA（long noncoding RNA,lncRNA）的表達(dá)調(diào)控,造成機(jī)體組織的氧化損傷,引起各種機(jī)能和代謝的變化,使其處于亞健康狀態(tài),降低生產(chǎn)性能。豬機(jī)體可以利用自身的抗氧化系統(tǒng)來(lái)消除氧化應(yīng)激產(chǎn)生的負(fù)面作用;豬屠宰后胴體的抗氧化酶可以維持肌肉氧化還原狀態(tài)的穩(wěn)衡。那么,氧化應(yīng)激導(dǎo)致豬肝臟組織中l(wèi)ncRNA和基因發(fā)生異常表達(dá),以及利用宰后24h的pH值（即終點(diǎn)pH,pHu）評(píng)估胴體肌肉的抗氧化性狀等內(nèi)容未見(jiàn)研究報(bào)道。因此,本研究首先以長(zhǎng)白豬斷奶仔豬為試驗(yàn)動(dòng)物,利用Diquat（DQ）構(gòu)建斷奶仔豬的氧化應(yīng)激模型,探討氧化應(yīng)激條件下斷奶仔豬肝臟組織轉(zhuǎn)錄組的表達(dá)特征;然后,通過(guò)對(duì)胴體肌肉抗氧化性狀與pHu的相關(guān)性分析,以及不同pHu分組對(duì)抗氧化酶活性及其基因的表達(dá)量的影響,建立胴體肌肉抗氧化性狀與pHu之間的評(píng)估關(guān)系。主要研究?jī)?nèi)容及結(jié)果如下:1、對(duì)氧化應(yīng)激組斷奶仔豬進(jìn)行腹腔注射10 mg/kg體重DQ后,仔豬表現(xiàn)出嘔吐、食欲下降,并伴隨直腸溫度顯著升... 

【文章來(lái)源】：山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省

【文章頁(yè)數(shù)】：94 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

lncRNA的分類(lèi)（引自Maetal,2013）

10圖 1-2 長(zhǎng)鏈非編碼 RNA（lncRNA）或不同種類(lèi)的 lncRNA 在生物發(fā)生、成熟和降解的不點(diǎn)被差異調(diào)控（引自 Quinn & Chang, 2016）Fig.1-2 Some long non-coding RNAs (lncRNAs) or classes of lncRNAs are regulated differentialdifferent points of their biogenesis, maturation and degradation (citated from Quinn & Chang, 201.3.2 氧化應(yīng)激相關(guān)的 mRNA（1）Nrf2 基因

圖 2-1 lncRNA 序列生物信息學(xué)分析Figure 2-1 The bioinformatic analysis for lncRNA sequencing據(jù)生物信息學(xué)分析a Hiseq 得到的原始圖像數(shù)據(jù)文件經(jīng) CASAVA 堿基識(shí)別(Base測(cè)序序列(Sequenced Reads)，我們稱(chēng)之為 Raw Data 或 Raw Re稱(chēng)為 fq）文件格式存儲(chǔ)，其中包含測(cè)序序列（reads）的序列信量信息。對(duì)測(cè)序的原始數(shù)據(jù)通過(guò) FastQC 進(jìn)行質(zhì)量評(píng)估。ic 進(jìn)行質(zhì)量剪切，得到相對(duì)準(zhǔn)確的有效數(shù)據(jù)。NA-seq 測(cè)序評(píng)估ISAT2將樣本有效數(shù)據(jù)比對(duì)到參考基因組上，統(tǒng)計(jì)Mapping信息果進(jìn)行冗余序列分析、插入片段分布等分析。采用 Qualimap 根分布檢查、基因組結(jié)構(gòu)分布等分析。利用 BEDTools 進(jìn)行基因覆上測(cè)序序列分布等分析。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
[1]日糧添加L-茶氨酸對(duì)斷奶仔豬的抗應(yīng)激效果研究[D]. 劉通.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[2]葡萄籽提取物減緩西雜肉�？漳c上皮細(xì)胞熱應(yīng)激反應(yīng)的功能與機(jī)制研究[D]. 朱旺.西南大學(xué) 2015
[3]奶牛肢蹄病患牛體內(nèi)礦物元素和氧化應(yīng)激指標(biāo)的變化[D]. 李忠鵬.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]豬CuZnSOD基因的克隆、mRNA表達(dá)及其對(duì)肉質(zhì)抗氧化性能的影響[D]. 杜金芳.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
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本文編號(hào)：3144012