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牛諾如病毒實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測方法的建立及應(yīng)用

發(fā)布時(shí)間:2021-04-16 17:49
  牛諾如病毒(BNoV)是國內(nèi)新發(fā)的犢牛腹瀉病原,筆者擬建立檢測BNoV的Real-time PCR方法。根據(jù)BNoV流行株的RNA聚合酶(RdRp)基因序列設(shè)計(jì)引物,通過優(yōu)化反應(yīng)條件和體系,成功建立基于EvaGreen檢測BNoV的Real-time PCR方法。該檢測方法的Ct值與標(biāo)準(zhǔn)品模板在2.24×102~2.24×108拷貝·μL-1線性關(guān)系良好,相關(guān)系數(shù)R2=0.997,擴(kuò)增效率為98.44%;該方法可特異性檢出BNoV,對其他犢牛腹瀉相關(guān)病原呈陰性;最低檢測限為22.4拷貝·μL-1;批間和批內(nèi)的變異系數(shù)均小于2%,重復(fù)性好。對2017年9月—2019年5月采自河南省的221份犢牛腹瀉樣本中BNoV的檢出率為11.31%(25/221),采樣場陽性率為92.86%(13/14)。本試驗(yàn)所建方法靈敏度高、特異性強(qiáng)、穩(wěn)定性好,為BNoV的檢測和流行病學(xué)調(diào)查提供了有力手段。 

【文章來源】:畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020,51(07)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:9 頁

【部分圖文】:

牛諾如病毒實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測方法的建立及應(yīng)用


BNoV RdRp基因目的片段的PCR擴(kuò)增

熔解曲線,熒光定量PCR,方法,非特異性


重組質(zhì)粒pMD18T-BNoV-RdRp經(jīng)擴(kuò)增后,擴(kuò)增產(chǎn)物在Tm值為87 ℃處出現(xiàn)單一波峰(圖2),無引物二聚體和非特異性擴(kuò)增峰。圖3 熒光定量PCR方法的標(biāo)準(zhǔn)曲線

標(biāo)準(zhǔn)曲線,熒光定量PCR,反應(yīng)體,標(biāo)準(zhǔn)曲線


熒光定量PCR方法的標(biāo)準(zhǔn)曲線

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]牛病毒性腹瀉病毒鏈特異性SYBR Green熒光定量PCR方法的建立及應(yīng)用[J]. 劉存,鄧永,梁琳,李金祥,張彥明,崔尚金.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(10)
[2]部分地區(qū)奶牛腹瀉糞便樣中諾如病毒的檢測和演化分析[J]. 王玥琳,郭紫晶,岳華,湯承.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(05)
[3]檢測紐布病毒的Real-time RT-PCR方法的建立與應(yīng)用[J]. 郭紫晶,何琪富,湯承,張斌,岳華.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(04)
[4]豬圓環(huán)病毒3型TaqMan熒光定量PCR方法的建立和初步應(yīng)用[J]. 李暢,庫旭鋼,王俊偉,李靜,朱玲,何啟蓋.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(06)
[5]三種熒光染料SYBR GreenⅠ、LCGreen PLUS、EvaGreen在實(shí)時(shí)定量PCR應(yīng)用中的比較[J]. 邵曉青,呂申,馮璐,李梅.  大連醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(05)



本文編號:3141892

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