鴿毛滴蟲外泌體的分離鑒定及蛋白質(zhì)譜分析
發(fā)布時間:2021-04-15 15:41
旨在研究鴿毛滴蟲是否分泌外泌體及蟲源外泌體的蛋白組成和功能,為探索外泌體在鴿毛滴蟲寄生過程中的作用奠定基礎。采集鴿毛滴蟲感染個體口腔及咽部病灶處樣本,進行分離培養(yǎng)及純化,使用顯微鏡鑒定蟲體形態(tài),提取DNA并比對其序列,確定培養(yǎng)物是否為鴿毛滴蟲蟲株;通過對培養(yǎng)液上清進行超速離心,透射電子顯微鏡、Western blot技術(shù)和納米顆粒追蹤分析(nanoparticle tracking analysis, NTA)鑒定培養(yǎng)液上清中是否含有蟲源外泌體;最后通過Label-free技術(shù)分析蟲源外泌體的蛋白質(zhì)譜表達。結(jié)果顯示,蟲體具有明顯的毛滴蟲形態(tài)及特征,與鴿毛滴蟲ITS1/5.8S/ITS2基因比對率達98%。從蟲體培養(yǎng)液中提取的囊泡經(jīng)透射電子顯微鏡觀察具有明顯的茶托樣結(jié)構(gòu);NTA結(jié)果顯示,粒徑集中于125.1 nm,峰值粒徑為132.3 nm,占比99.3%;CD63和TSG101等外泌體標記蛋白的條帶明顯,表明提取物為外泌體。質(zhì)譜結(jié)果顯示,烯醇酶、3-磷酸甘油醛-脫氫酶、磷酸甘油酸變位酶和延伸因子為表達量較高的蛋白質(zhì)。GO功能注釋顯示外泌體蛋白富集到細胞內(nèi)和胞漿等細胞組分,發(fā)揮GTP連接...
【文章來源】:畜牧獸醫(yī)學報. 2020,51(07)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:11 頁
【部分圖文】:
鴿毛滴蟲顯微鏡鑒定
2.1.2 DNA提取及測序經(jīng)PCR擴增ITS1/5.8S/ITS2基因后,瓊脂糖凝膠電泳的結(jié)果見圖2,由圖可見,電泳片段條帶明顯,長度在250~500 bp。經(jīng)測序,片段長度為343 bp,在NCBI數(shù)據(jù)庫中進行BLAST比對,結(jié)果見表1,擴增產(chǎn)物與鴿毛滴蟲ITS1/5.8S/ITS2基因具有98.43%的相似性。
表1 測序產(chǎn)物與ITS1/5.8S/ITS2基因BlAST結(jié)果Table 1 BLAST results of sequencing products and ITS1/5.8 S/ITS2 gene 指標 Index 數(shù)值 Value 匹配分值 Max score 558 總體分值 Total score 558 覆蓋率/% Query cover 97 Expect值 E value 6×10-164 一致性/% Consistency 98.432.3 外泌體蛋白質(zhì)譜分析
【參考文獻】:
期刊論文
[1]寄生蟲來源的外泌體研究進展[J]. 倪愛心,麻慧,陳繼蘭. 畜牧獸醫(yī)學報. 2019(05)
[2]豬繁殖與呼吸綜合征病毒感染的MARC-145細胞中外泌體的分離與鑒定[J]. 張亮,王帥帥,陳忍霞,陶佳麗,范闊海,段馬魁,扆妍妍,姜俊兵. 畜牧獸醫(yī)學報. 2017(07)
[3]細粒棘球絳蟲延伸因子1生物信息學分析[J]. 李超群,樊海寧,張耀剛,曹得萍. 中國公共衛(wèi)生. 2017(04)
[4]乳中miRNA的研究進展[J]. 林德麟,陳婷,黎夢,謝梅英,習欠云,孫加節(jié),張永亮. 畜牧獸醫(yī)學報. 2016(09)
[5]熱休克蛋白與寄生蟲感染的關(guān)系[J]. 王強,李勉,張龍現(xiàn). 中國畜牧獸醫(yī). 2009(06)
[6]亞洲牛帶絳蟲泛素綴合酶基因及其蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的生物信息學分析[J]. 廖興江,戴佳琳,周靈貴,申萍香,黃江,黃艷,胡旭初. 中國人獸共患病學報. 2009(03)
[7]弓形蟲信號轉(zhuǎn)導蛋白14-3-3基因的克隆與表達[J]. 都建,沈繼龍,汪學龍,王維. 中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志. 2003(05)
[8]日本血吸蟲重組信號蛋白14-3-3疫苗免疫保護性的觀察[J]. 劉慶中,沈繼龍. 中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志. 2003(05)
碩士論文
[1]亞洲帶絳蟲外泌體的分離鑒定及其對LoVo細胞的影響[D]. 梁盼紅.中國農(nóng)業(yè)科學院 2019
[2]柔嫩艾美耳球蟲外泌體的分離與鑒定及泛素蛋白功能初步研究[D]. 李志行.上海師范大學 2019
[3]犬源毛滴蟲的分離鑒定及其生物學特性研究[D]. 孟瑩.吉林大學 2013
本文編號:3139616
【文章來源】:畜牧獸醫(yī)學報. 2020,51(07)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:11 頁
【部分圖文】:
鴿毛滴蟲顯微鏡鑒定
2.1.2 DNA提取及測序經(jīng)PCR擴增ITS1/5.8S/ITS2基因后,瓊脂糖凝膠電泳的結(jié)果見圖2,由圖可見,電泳片段條帶明顯,長度在250~500 bp。經(jīng)測序,片段長度為343 bp,在NCBI數(shù)據(jù)庫中進行BLAST比對,結(jié)果見表1,擴增產(chǎn)物與鴿毛滴蟲ITS1/5.8S/ITS2基因具有98.43%的相似性。
表1 測序產(chǎn)物與ITS1/5.8S/ITS2基因BlAST結(jié)果Table 1 BLAST results of sequencing products and ITS1/5.8 S/ITS2 gene 指標 Index 數(shù)值 Value 匹配分值 Max score 558 總體分值 Total score 558 覆蓋率/% Query cover 97 Expect值 E value 6×10-164 一致性/% Consistency 98.432.3 外泌體蛋白質(zhì)譜分析
【參考文獻】:
期刊論文
[1]寄生蟲來源的外泌體研究進展[J]. 倪愛心,麻慧,陳繼蘭. 畜牧獸醫(yī)學報. 2019(05)
[2]豬繁殖與呼吸綜合征病毒感染的MARC-145細胞中外泌體的分離與鑒定[J]. 張亮,王帥帥,陳忍霞,陶佳麗,范闊海,段馬魁,扆妍妍,姜俊兵. 畜牧獸醫(yī)學報. 2017(07)
[3]細粒棘球絳蟲延伸因子1生物信息學分析[J]. 李超群,樊海寧,張耀剛,曹得萍. 中國公共衛(wèi)生. 2017(04)
[4]乳中miRNA的研究進展[J]. 林德麟,陳婷,黎夢,謝梅英,習欠云,孫加節(jié),張永亮. 畜牧獸醫(yī)學報. 2016(09)
[5]熱休克蛋白與寄生蟲感染的關(guān)系[J]. 王強,李勉,張龍現(xiàn). 中國畜牧獸醫(yī). 2009(06)
[6]亞洲牛帶絳蟲泛素綴合酶基因及其蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的生物信息學分析[J]. 廖興江,戴佳琳,周靈貴,申萍香,黃江,黃艷,胡旭初. 中國人獸共患病學報. 2009(03)
[7]弓形蟲信號轉(zhuǎn)導蛋白14-3-3基因的克隆與表達[J]. 都建,沈繼龍,汪學龍,王維. 中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志. 2003(05)
[8]日本血吸蟲重組信號蛋白14-3-3疫苗免疫保護性的觀察[J]. 劉慶中,沈繼龍. 中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志. 2003(05)
碩士論文
[1]亞洲帶絳蟲外泌體的分離鑒定及其對LoVo細胞的影響[D]. 梁盼紅.中國農(nóng)業(yè)科學院 2019
[2]柔嫩艾美耳球蟲外泌體的分離與鑒定及泛素蛋白功能初步研究[D]. 李志行.上海師范大學 2019
[3]犬源毛滴蟲的分離鑒定及其生物學特性研究[D]. 孟瑩.吉林大學 2013
本文編號:3139616
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