中國和尼日利亞棘球絳蟲流行株的遺傳變異研究
發(fā)布時(shí)間:2021-04-14 15:27
囊型棘球蚴病(cystic echinococcosis,CE)俗稱囊型包蟲病,是一種世界范圍內(nèi)分布的人畜共患寄生蟲病,在亞洲、南美洲、歐洲和非洲(尤其是北非和東非)高度流行。因受包蟲感染的器官被廢棄和包蟲病患者的治療費(fèi)用,CE造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。在人類和家畜,CE主要由細(xì)粒棘球絳蟲廣義種(Echinococcus granulosus sensu lato)引起;诰粒體(mitochondrial,mt)基因(組)的多態(tài)性研究是將一系列遺傳關(guān)系相近的蟲種(蟲株)歸為“基因型”。線粒體基因遺傳差異或多態(tài)性影響蟲種/基因型對宿主的偏好性及其感染性等。因此,了解某一特定地點(diǎn)寄生宿主的蟲種及其基因型的特性,對于理解和預(yù)測疫病的發(fā)展動態(tài)是非常有價(jià)值的,并且可以指導(dǎo)有效防控方案的制定。本研究調(diào)查了中國西藏自治區(qū)(Tibet Autonomous Region,TAR)4個(gè)縣細(xì)粒棘球絳蟲廣義種的蟲種多樣性和遺傳變異特點(diǎn),并首次對導(dǎo)致尼日利亞CE的細(xì)粒棘球絳蟲廣義種的蟲種/基因型進(jìn)行了研究與分析。本項(xiàng)研究還篩選了用于棘球絳蟲蟲種鑒定的微衛(wèi)星標(biāo)記,這對進(jìn)一步分析棘球絳蟲種內(nèi)和種間遺傳變異規(guī)律有潛...
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:125 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
細(xì)粒棘球絳蟲的生活史Fig.1-1LifecycleofEchinococcusgranulosussensulato(https://www.cdc.gov/dpdx/echinococcosis/index.html)
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院博士學(xué)位論文CHAPTERIGeneralIntroductionandReviewofLiterature8圖1-2中間宿主家畜中的泡型棘球蚴病的全球分布Fig.1-2Globaldistributionofcysticechinococcosisinthemaindomesticintermediatehosts(CEcausedbythecervidgenotypesofEchinococcuscanadensisandEchinococcusequinusarenotincluded)(Deplazesetal.,2017)
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院博士學(xué)位論文CHAPTERIIGeneticdiversityofEchinococcusinTAR,China25designedprimers(Wuetal.,2018)andnewlydesignedcomplementaryprimers(AppendixB:TableB-1).EachPCRreactionyieldedasinglebanddetectedina1.5%(w/v)agarosegelstainedwithGelRed(Biotium,Fremont,USA)(seeAppendixA,Fig.A-1,A-2).FivemicrolitersoftheampliconwereusedforvisualizationwhiletherestwereusedforsequencinginanABI3730XlDNAAnalyser(TsinqkeBiologicalTechnology,Beijing,China).圖2-1中國西藏自治區(qū)的研究區(qū)域Fig.2-1MapoftheTibetAutonomousRegionofChinashowingthestudyarea2.2.4MolecularandphylogeneticanalysisFollowingsequencing,thenucleotidesequenceswereviewedandmanuallycorrectedforanymisreadnucleotidebycomparingthechromatogramfilewiththeresultingsequencesusingUniproUGENEv1.29.0softwareandBioEdit(Hall,1999).ThesequencesofthecompletemtgenomewereassembledstepwisewiththehelpofDNAStarv7.1program,BioEdit,andUniproUGENEv1.29.0softwarewhilemakingsurethattheoverlapsequenceswereidentical.ThefinalsequenceswerealignedwithBioEdit(Hall,1999).Theprotein-encodinggenesandrRNAsofthecompletemtgenomewereannotatedusingGeSeq(Tillichetal.,2017);tRNAswereidentifiedusingtRNAscan-SEv2.0.3and/orbyaBLASTsearchagainstanE.canadensisgenotypeG6mtgenomesequenceavailableinGenBank(GenBank:AB208063).Theidentityoftheisolatesviatheirnucleotidesequenceswasassessedusingthe
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]新疆14地州2014年家畜棘球蚴病感染調(diào)查報(bào)告[J]. 努斯來提,馬力克,閆浩,祖力胡馬爾. 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2016(02)
[2]西藏地區(qū)526例肝包蟲病的外科治療[J]. 鄭建偉,杜富波,王得春,萬晨光,楊智煒,張海斌. 肝膽外科雜志. 2014(06)
[3]2005-2013年新疆棘球蚴病手術(shù)病例回顧分析[J]. 伊斯拉音·烏斯曼,侯巖巖,趙江山,亞里坤·買買提依明. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2014(05)
[4]2011年我國網(wǎng)絡(luò)直報(bào)棘球蚴病病例分析[J]. 李軍建,陳海棠,伍衛(wèi)平. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2013(01)
[5]甘肅省肅南裕固族自治縣包蟲病流行病學(xué)調(diào)查研究[J]. 牛鳴,安永貴. 臨床合理用藥雜志. 2012(14)
[6]青海省兒童棘球蚴病的地域分布[J]. 蔡輝霞,官亞宜,王虎,伍衛(wèi)平,韓秀敏,馬霄,王立英,李俊. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2012(02)
[7]四川省家畜包蟲病流行病學(xué)調(diào)查報(bào)告[J]. 郭莉,陽愛國,張壯志,侯巍,陳冬,文豪,毛光瓊,周建玉,吳宣. 中國獸醫(yī)雜志. 2012(02)
[8]2004-2008年全國包蟲病疫情分析[J]. 王立英,伍衛(wèi)平,朱雪花. 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2010(07)
[9]甘南藏族自治州動物棘球絳蟲感染狀況調(diào)查[J]. 趙玉敏,童蘇祥,景濤,種世桂,才學(xué)鵬,景志忠,韓儉. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2009(01)
[10]四川西部藏區(qū)包蟲病流行病學(xué)研究Ⅱ.牲畜及野生動物兩型包蟲病感染狀況調(diào)查[J]. 何金戈,邱加閩,劉鳳潔,陳興旺,劉大倫,陳衛(wèi)東,張奕,Schantz Peter. 中國人獸共患病雜志. 2000(05)
本文編號:3137560
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:125 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
細(xì)粒棘球絳蟲的生活史Fig.1-1LifecycleofEchinococcusgranulosussensulato(https://www.cdc.gov/dpdx/echinococcosis/index.html)
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院博士學(xué)位論文CHAPTERIGeneralIntroductionandReviewofLiterature8圖1-2中間宿主家畜中的泡型棘球蚴病的全球分布Fig.1-2Globaldistributionofcysticechinococcosisinthemaindomesticintermediatehosts(CEcausedbythecervidgenotypesofEchinococcuscanadensisandEchinococcusequinusarenotincluded)(Deplazesetal.,2017)
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院博士學(xué)位論文CHAPTERIIGeneticdiversityofEchinococcusinTAR,China25designedprimers(Wuetal.,2018)andnewlydesignedcomplementaryprimers(AppendixB:TableB-1).EachPCRreactionyieldedasinglebanddetectedina1.5%(w/v)agarosegelstainedwithGelRed(Biotium,Fremont,USA)(seeAppendixA,Fig.A-1,A-2).FivemicrolitersoftheampliconwereusedforvisualizationwhiletherestwereusedforsequencinginanABI3730XlDNAAnalyser(TsinqkeBiologicalTechnology,Beijing,China).圖2-1中國西藏自治區(qū)的研究區(qū)域Fig.2-1MapoftheTibetAutonomousRegionofChinashowingthestudyarea2.2.4MolecularandphylogeneticanalysisFollowingsequencing,thenucleotidesequenceswereviewedandmanuallycorrectedforanymisreadnucleotidebycomparingthechromatogramfilewiththeresultingsequencesusingUniproUGENEv1.29.0softwareandBioEdit(Hall,1999).ThesequencesofthecompletemtgenomewereassembledstepwisewiththehelpofDNAStarv7.1program,BioEdit,andUniproUGENEv1.29.0softwarewhilemakingsurethattheoverlapsequenceswereidentical.ThefinalsequenceswerealignedwithBioEdit(Hall,1999).Theprotein-encodinggenesandrRNAsofthecompletemtgenomewereannotatedusingGeSeq(Tillichetal.,2017);tRNAswereidentifiedusingtRNAscan-SEv2.0.3and/orbyaBLASTsearchagainstanE.canadensisgenotypeG6mtgenomesequenceavailableinGenBank(GenBank:AB208063).Theidentityoftheisolatesviatheirnucleotidesequenceswasassessedusingthe
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]新疆14地州2014年家畜棘球蚴病感染調(diào)查報(bào)告[J]. 努斯來提,馬力克,閆浩,祖力胡馬爾. 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2016(02)
[2]西藏地區(qū)526例肝包蟲病的外科治療[J]. 鄭建偉,杜富波,王得春,萬晨光,楊智煒,張海斌. 肝膽外科雜志. 2014(06)
[3]2005-2013年新疆棘球蚴病手術(shù)病例回顧分析[J]. 伊斯拉音·烏斯曼,侯巖巖,趙江山,亞里坤·買買提依明. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2014(05)
[4]2011年我國網(wǎng)絡(luò)直報(bào)棘球蚴病病例分析[J]. 李軍建,陳海棠,伍衛(wèi)平. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2013(01)
[5]甘肅省肅南裕固族自治縣包蟲病流行病學(xué)調(diào)查研究[J]. 牛鳴,安永貴. 臨床合理用藥雜志. 2012(14)
[6]青海省兒童棘球蚴病的地域分布[J]. 蔡輝霞,官亞宜,王虎,伍衛(wèi)平,韓秀敏,馬霄,王立英,李俊. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2012(02)
[7]四川省家畜包蟲病流行病學(xué)調(diào)查報(bào)告[J]. 郭莉,陽愛國,張壯志,侯巍,陳冬,文豪,毛光瓊,周建玉,吳宣. 中國獸醫(yī)雜志. 2012(02)
[8]2004-2008年全國包蟲病疫情分析[J]. 王立英,伍衛(wèi)平,朱雪花. 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2010(07)
[9]甘南藏族自治州動物棘球絳蟲感染狀況調(diào)查[J]. 趙玉敏,童蘇祥,景濤,種世桂,才學(xué)鵬,景志忠,韓儉. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2009(01)
[10]四川西部藏區(qū)包蟲病流行病學(xué)研究Ⅱ.牲畜及野生動物兩型包蟲病感染狀況調(diào)查[J]. 何金戈,邱加閩,劉鳳潔,陳興旺,劉大倫,陳衛(wèi)東,張奕,Schantz Peter. 中國人獸共患病雜志. 2000(05)
本文編號:3137560
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