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中國(guó)和尼日利亞棘球絳蟲(chóng)流行株的遺傳變異研究

發(fā)布時(shí)間:2021-04-14 15:27
  囊型棘球蚴。╟ystic echinococcosis,CE)俗稱囊型包蟲(chóng)病,是一種世界范圍內(nèi)分布的人畜共患寄生蟲(chóng)病,在亞洲、南美洲、歐洲和非洲(尤其是北非和東非)高度流行。因受包蟲(chóng)感染的器官被廢棄和包蟲(chóng)病患者的治療費(fèi)用,CE造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。在人類和家畜,CE主要由細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)廣義種(Echinococcus granulosus sensu lato)引起;诰粒體(mitochondrial,mt)基因(組)的多態(tài)性研究是將一系列遺傳關(guān)系相近的蟲(chóng)種(蟲(chóng)株)歸為“基因型”。線粒體基因遺傳差異或多態(tài)性影響蟲(chóng)種/基因型對(duì)宿主的偏好性及其感染性等。因此,了解某一特定地點(diǎn)寄生宿主的蟲(chóng)種及其基因型的特性,對(duì)于理解和預(yù)測(cè)疫病的發(fā)展動(dòng)態(tài)是非常有價(jià)值的,并且可以指導(dǎo)有效防控方案的制定。本研究調(diào)查了中國(guó)西藏自治區(qū)(Tibet Autonomous Region,TAR)4個(gè)縣細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)廣義種的蟲(chóng)種多樣性和遺傳變異特點(diǎn),并首次對(duì)導(dǎo)致尼日利亞CE的細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)廣義種的蟲(chóng)種/基因型進(jìn)行了研究與分析。本項(xiàng)研究還篩選了用于棘球絳蟲(chóng)蟲(chóng)種鑒定的微衛(wèi)星標(biāo)記,這對(duì)進(jìn)一步分析棘球絳蟲(chóng)種內(nèi)和種間遺傳變異規(guī)律有潛... 

【文章來(lái)源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁(yè)數(shù)】:125 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

中國(guó)和尼日利亞棘球絳蟲(chóng)流行株的遺傳變異研究


細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)的生活史Fig.1-1LifecycleofEchinococcusgranulosussensulato(https://www.cdc.gov/dpdx/echinococcosis/index.html)

中間宿主,棘球蚴病,家畜,全球


中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院博士學(xué)位論文CHAPTERIGeneralIntroductionandReviewofLiterature8圖1-2中間宿主家畜中的泡型棘球蚴病的全球分布Fig.1-2Globaldistributionofcysticechinococcosisinthemaindomesticintermediatehosts(CEcausedbythecervidgenotypesofEchinococcuscanadensisandEchinococcusequinusarenotincluded)(Deplazesetal.,2017)

西藏自治區(qū),中國(guó)農(nóng)業(yè),博士學(xué)位,科學(xué)院


中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院博士學(xué)位論文CHAPTERIIGeneticdiversityofEchinococcusinTAR,China25designedprimers(Wuetal.,2018)andnewlydesignedcomplementaryprimers(AppendixB:TableB-1).EachPCRreactionyieldedasinglebanddetectedina1.5%(w/v)agarosegelstainedwithGelRed(Biotium,Fremont,USA)(seeAppendixA,Fig.A-1,A-2).FivemicrolitersoftheampliconwereusedforvisualizationwhiletherestwereusedforsequencinginanABI3730XlDNAAnalyser(TsinqkeBiologicalTechnology,Beijing,China).圖2-1中國(guó)西藏自治區(qū)的研究區(qū)域Fig.2-1MapoftheTibetAutonomousRegionofChinashowingthestudyarea2.2.4MolecularandphylogeneticanalysisFollowingsequencing,thenucleotidesequenceswereviewedandmanuallycorrectedforanymisreadnucleotidebycomparingthechromatogramfilewiththeresultingsequencesusingUniproUGENEv1.29.0softwareandBioEdit(Hall,1999).ThesequencesofthecompletemtgenomewereassembledstepwisewiththehelpofDNAStarv7.1program,BioEdit,andUniproUGENEv1.29.0softwarewhilemakingsurethattheoverlapsequenceswereidentical.ThefinalsequenceswerealignedwithBioEdit(Hall,1999).Theprotein-encodinggenesandrRNAsofthecompletemtgenomewereannotatedusingGeSeq(Tillichetal.,2017);tRNAswereidentifiedusingtRNAscan-SEv2.0.3and/orbyaBLASTsearchagainstanE.canadensisgenotypeG6mtgenomesequenceavailableinGenBank(GenBank:AB208063).Theidentityoftheisolatesviatheirnucleotidesequenceswasassessedusingthe

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):3137560

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