雞CPT1A基因的生物信息學(xué)分析和組織表達(dá)譜構(gòu)建
發(fā)布時(shí)間:2021-04-05 06:30
旨在探索雞肉堿棕櫚酰轉(zhuǎn)移酶1A(CPT1A)基因的生物學(xué)特征,研究其表達(dá)的組織和時(shí)空差異。通過生物信息學(xué)軟件對CPT1A序列進(jìn)行分析和功能預(yù)測,利用熒光定量PCR技術(shù)檢測該基因在12周固始雞腹脂、皮脂、胸肌、腿肌和肝中的表達(dá)量,以及在不同時(shí)期(6周,12周,22周和30周)固始雞胸肌中的表達(dá)量。結(jié)果顯示,雞CPT1A蛋白無信號(hào)肽,有兩個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域。雞與斑馬魚CPT1A基因的親緣關(guān)系最遠(yuǎn),與小鼠、人、豬、山羊、奶牛的親緣關(guān)系較近。CPT1A基因在12周固始雞肝臟組織中表達(dá)量最高,胸肌和腿肌次之,腹脂和皮脂中表達(dá)量較低,在不同發(fā)育階段中固始雞胸肌中表達(dá)量相對較高的為12周和6周,22周次之,30周則表達(dá)量最低。試驗(yàn)結(jié)果為進(jìn)一步研究雞CPT1A基因調(diào)控雞脂質(zhì)代謝的分子機(jī)制提供理論基礎(chǔ)。
【文章來源】:畜牧與獸醫(yī). 2020,52(12)北大核心
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
雞CPT1A蛋白親/疏水性和跨膜結(jié)構(gòu)域分析
SPOMA預(yù)測結(jié)果見圖2A。雞CPT1A蛋白主要是由α-螺旋(49.48%),β-折疊(5.19 %),延伸鏈(11.56 %)和無規(guī)則卷曲(33.77 %)組成。通過Phyre 2預(yù)測該蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)結(jié)果見圖2B。2.3 雞CPT1A蛋白功能結(jié)構(gòu)域、蛋白互作以及代謝通路預(yù)測分析
蛋白互作圖見圖3B。雞CPT1A蛋白可能與長鏈脂酰輔酶A合成酶家族(ACSLs)、長鏈脂肪酸-輔酶A連接酶家族(ACSBGs)、CPT2以及脂酰輔酶A氧化酶1(ACOX1)存在相互作用;預(yù)測顯示該蛋白可能參與的代謝通路為脂肪酸代謝,PPAR信號(hào)通路和脂肪細(xì)胞因子信號(hào)通路。2.4 CPT1A基因系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]山羊CPT1A基因的克隆表達(dá)及肌內(nèi)脂肪含量的相關(guān)性分析[J]. 梁計(jì)峻,林亞秋,俞雨陽,王永,朱江江. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2019(05)
[2]牦牛和犏牛睪丸CPT1a和ETHE1基因mRNA水平比較研究[J]. 李方偉,黃林,金素鈺,雷杰雯,付偉,鄭玉才. 中國畜牧獸醫(yī). 2018(07)
[3]PTEN、CPT1A、COX4在高原鼠兔脂代謝相關(guān)組織中的表達(dá)和意義[J]. 李佳,白振忠,格日力. 中國高原醫(yī)學(xué)與生物學(xué)雜志. 2018(02)
[4]16S rRNA基因克隆文庫分析比較牙周炎患者和健康人口腔唾液微生物多樣性[J]. 吳芳,李俊平,汪珍珍,王譯彬,焦康禮,周建業(yè),李志強(qiáng),余占海. 微生物學(xué)通報(bào). 2016(06)
[5]貴州地方山羊CPT-1A基因在不同品種和組織中的表達(dá)差異[J]. 楊家大. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2015(06)
[6]外源肉堿對鯉魚背肌脂肪酸組成及其CPTI基因表達(dá)的影響[J]. 董婧,李林,于業(yè)輝,董曉慶,陳玉珂,裴懷全,王秋舉,張東鳴. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2014(01)
[7]肉毒堿棕櫚酰基轉(zhuǎn)移酶1A的研究進(jìn)展[J]. 魏婷,張永煜,張慶華. 生命科學(xué). 2013(06)
[8]日糧能量水平對烏金豬肝臟組織脂類代謝相關(guān)基因表達(dá)的影響[J]. 黃英,李永能,楊明華,潘洪彬,趙素梅,高士爭. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)). 2012(06)
[9]肉堿棕櫚酰轉(zhuǎn)移酶基因在綿羊和山羊不同肌肉組織中的表達(dá)分析[J]. 于寶莉,高愛琴,李金泉,張文廣. 中國畜牧獸醫(yī). 2012(10)
[10]脂聯(lián)素對犢牛肝細(xì)胞脂氧化關(guān)鍵酶表達(dá)的影響[J]. 陳灰,張良,李心慰,白鴿,劉兆喜,楊文濤,趙晨旭,鄧清華,王曉旭,王建國,劉國文,王哲. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2012(10)
博士論文
[1]肉毒堿棕櫚酰轉(zhuǎn)移酶1A在肝臟、胰腺和脂肪細(xì)胞中的功能研究[D]. 李快.中國科學(xué)技術(shù)大學(xué) 2012
[2]CPT1基因?qū)ωi脂肪沉積的影響及其調(diào)控機(jī)制的研究[D]. 張艷芳.浙江大學(xué) 2010
本文編號(hào):3119319
【文章來源】:畜牧與獸醫(yī). 2020,52(12)北大核心
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
雞CPT1A蛋白親/疏水性和跨膜結(jié)構(gòu)域分析
SPOMA預(yù)測結(jié)果見圖2A。雞CPT1A蛋白主要是由α-螺旋(49.48%),β-折疊(5.19 %),延伸鏈(11.56 %)和無規(guī)則卷曲(33.77 %)組成。通過Phyre 2預(yù)測該蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)結(jié)果見圖2B。2.3 雞CPT1A蛋白功能結(jié)構(gòu)域、蛋白互作以及代謝通路預(yù)測分析
蛋白互作圖見圖3B。雞CPT1A蛋白可能與長鏈脂酰輔酶A合成酶家族(ACSLs)、長鏈脂肪酸-輔酶A連接酶家族(ACSBGs)、CPT2以及脂酰輔酶A氧化酶1(ACOX1)存在相互作用;預(yù)測顯示該蛋白可能參與的代謝通路為脂肪酸代謝,PPAR信號(hào)通路和脂肪細(xì)胞因子信號(hào)通路。2.4 CPT1A基因系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]山羊CPT1A基因的克隆表達(dá)及肌內(nèi)脂肪含量的相關(guān)性分析[J]. 梁計(jì)峻,林亞秋,俞雨陽,王永,朱江江. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2019(05)
[2]牦牛和犏牛睪丸CPT1a和ETHE1基因mRNA水平比較研究[J]. 李方偉,黃林,金素鈺,雷杰雯,付偉,鄭玉才. 中國畜牧獸醫(yī). 2018(07)
[3]PTEN、CPT1A、COX4在高原鼠兔脂代謝相關(guān)組織中的表達(dá)和意義[J]. 李佳,白振忠,格日力. 中國高原醫(yī)學(xué)與生物學(xué)雜志. 2018(02)
[4]16S rRNA基因克隆文庫分析比較牙周炎患者和健康人口腔唾液微生物多樣性[J]. 吳芳,李俊平,汪珍珍,王譯彬,焦康禮,周建業(yè),李志強(qiáng),余占海. 微生物學(xué)通報(bào). 2016(06)
[5]貴州地方山羊CPT-1A基因在不同品種和組織中的表達(dá)差異[J]. 楊家大. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2015(06)
[6]外源肉堿對鯉魚背肌脂肪酸組成及其CPTI基因表達(dá)的影響[J]. 董婧,李林,于業(yè)輝,董曉慶,陳玉珂,裴懷全,王秋舉,張東鳴. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2014(01)
[7]肉毒堿棕櫚酰基轉(zhuǎn)移酶1A的研究進(jìn)展[J]. 魏婷,張永煜,張慶華. 生命科學(xué). 2013(06)
[8]日糧能量水平對烏金豬肝臟組織脂類代謝相關(guān)基因表達(dá)的影響[J]. 黃英,李永能,楊明華,潘洪彬,趙素梅,高士爭. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)). 2012(06)
[9]肉堿棕櫚酰轉(zhuǎn)移酶基因在綿羊和山羊不同肌肉組織中的表達(dá)分析[J]. 于寶莉,高愛琴,李金泉,張文廣. 中國畜牧獸醫(yī). 2012(10)
[10]脂聯(lián)素對犢牛肝細(xì)胞脂氧化關(guān)鍵酶表達(dá)的影響[J]. 陳灰,張良,李心慰,白鴿,劉兆喜,楊文濤,趙晨旭,鄧清華,王曉旭,王建國,劉國文,王哲. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2012(10)
博士論文
[1]肉毒堿棕櫚酰轉(zhuǎn)移酶1A在肝臟、胰腺和脂肪細(xì)胞中的功能研究[D]. 李快.中國科學(xué)技術(shù)大學(xué) 2012
[2]CPT1基因?qū)ωi脂肪沉積的影響及其調(diào)控機(jī)制的研究[D]. 張艷芳.浙江大學(xué) 2010
本文編號(hào):3119319
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