Ⅰ.兩種偽狂犬病病毒診斷檢測方法的建立 Ⅱ.影響豬瘟病毒復制的lncRNAs的篩選
發(fā)布時間:2021-04-05 04:01
偽狂犬病(Pseudorabies,PR)是由偽狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)感染引起的家畜和野生動物的烈性傳染病。從2011年底開始,我國多個省份免疫過Bartha-K61弱毒疫苗的豬場相繼爆發(fā)偽狂犬病,研究表明,此次疫情由PRV變異株引起。本研究建立了一種三重熒光定量PCR檢測方法,基于三種標記不同熒光信號的TaqMan探針,該方法可以鑒別檢測PRV經典株、變異株和Bartha-K61疫苗株。該方法對TJ株、SC株和Bartha-K61的檢測限分別為50、50和5拷貝。應用三重熒光定量PCR方法和病毒分離方法對234個樣品進行檢測,結果顯示,兩種方法的符合率分別為100%(經典株)、99.2%(變異株)和100%(Bartha-K61疫苗株)。以上結果表明,該方法具有良好的靈敏性和特異性,可以應用于PRV毒株的區(qū)別檢測。本研究還建立了一種交叉引物擴增—試紙條聯用法(CPA-strip)用于檢測PRV野毒。應用建立的檢測方法對PRV變異株進行檢測,最低檢測限為200個拷貝。特異性檢測結果顯示,該方法與一些常見的豬病病毒無交叉反應性。對293個臨床樣品進行檢...
【文章來源】:中國農業(yè)科學院北京市
【文章頁數】:79 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1.3功能性IncRNAs與靶mRNA的位置關系??Fig.?1.3?The?relative?positions?of?functional?long?non-coding?RNA?(IncRNAs)?and?target??protein-coding?messenger?RNA?(mRNA).??
factor?2)相互作用后,形成轉錄復合體,誘導ISGs的表達。研宄同樣??發(fā)現,hnRNPU?(heterogeneous?nuclear?ribonucleoproteinU)能夠結合并??穩(wěn)定lncRNA#32,并幫助lncRNA#32行使其功能(圖1.4)。??ISGs是宿主抵抗病毒的重要防線,但是其表達調控機制尚不完全清??楚。通過歸納和總結目前己知的研宄成果,我們確信IncRNAs是調控??ISGs表達的重要一環(huán)。IncRNAs調控ISGs作用機制的解析,同樣為揭??示病毒和宿主之間的相互作用提供基礎。??12??
時區(qū)分檢測PRV變異株和經典株,方案5可同時鑒別檢測三種PRV毒??株,同時CT值最低,敏感性最高(表2.4)。因此,將方案5種的引??物和探針應用于后續(xù)試驗中(圖2.1和圖2.2)。??表2.4引物和探針的選擇。??Table?2.4?Optimization?of?primers?and?probes.??Group?1?Group?2?Group?3?Group?4?Group?5?Group?6??FAM?(CT?value)?None?None?None?None?33.8?35.2??HEX?(CT?value)?32.4?33.5?None?None?32.0?35.3??Cy5?(CT?value)?22.1?21.5?21.3?22.2?22.8?28.9??PRV-F2?Cy5-PRV-Bar??Bartha-K61?,?>?<?■?■??/?,?、、'、?PRV-R2、、、、、??/?、、'、、?''??PRV?classical?or?/
【參考文獻】:
期刊論文
[1]豬偽狂犬病病毒變異株的分離鑒定及其gE基因的分子特征[J]. 趙鴻遠,彭金美,安同慶,李琳,冷超糧,陳家锃,王倩,常丹,張秋月,蔡雪輝,童光志,田志軍. 中國預防獸醫(yī)學報. 2014(07)
[2]豬偽狂犬病病毒新流行株的分離鑒定及抗原差異性分析[J]. 彭金美,安同慶,趙鴻遠,劉益民,陳家锃,冷超糧,孫艷,常丹,田志軍,童光志. 中國預防獸醫(yī)學報. 2013(01)
[3]豬偽狂犬病研究進展[J]. 李春華,王英,蔣鳳英,胡建華. 動物醫(yī)學進展. 2008(03)
[4]檢測偽狂犬病病毒雙抗體夾心間接ELISA方法的建立與應用[J]. 汪招雄,何啟蓋,劉麗娜,劉正飛,黃紅亮,陳煥春. 中國預防獸醫(yī)學報. 2006(02)
[5]偽狂犬病流行現狀及我國應采取的防制措施[J]. 童光志,陳煥春. 中國獸醫(yī)學報. 1999(01)
[6]應用微量中和試驗進行豬偽狂犬病血清學調查[J]. 方六榮,陳煥春,何啟蓋,吳斌,金梅林,吳美洲. 中國畜禽傳染病. 1998(03)
本文編號:3119097
【文章來源】:中國農業(yè)科學院北京市
【文章頁數】:79 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1.3功能性IncRNAs與靶mRNA的位置關系??Fig.?1.3?The?relative?positions?of?functional?long?non-coding?RNA?(IncRNAs)?and?target??protein-coding?messenger?RNA?(mRNA).??
factor?2)相互作用后,形成轉錄復合體,誘導ISGs的表達。研宄同樣??發(fā)現,hnRNPU?(heterogeneous?nuclear?ribonucleoproteinU)能夠結合并??穩(wěn)定lncRNA#32,并幫助lncRNA#32行使其功能(圖1.4)。??ISGs是宿主抵抗病毒的重要防線,但是其表達調控機制尚不完全清??楚。通過歸納和總結目前己知的研宄成果,我們確信IncRNAs是調控??ISGs表達的重要一環(huán)。IncRNAs調控ISGs作用機制的解析,同樣為揭??示病毒和宿主之間的相互作用提供基礎。??12??
時區(qū)分檢測PRV變異株和經典株,方案5可同時鑒別檢測三種PRV毒??株,同時CT值最低,敏感性最高(表2.4)。因此,將方案5種的引??物和探針應用于后續(xù)試驗中(圖2.1和圖2.2)。??表2.4引物和探針的選擇。??Table?2.4?Optimization?of?primers?and?probes.??Group?1?Group?2?Group?3?Group?4?Group?5?Group?6??FAM?(CT?value)?None?None?None?None?33.8?35.2??HEX?(CT?value)?32.4?33.5?None?None?32.0?35.3??Cy5?(CT?value)?22.1?21.5?21.3?22.2?22.8?28.9??PRV-F2?Cy5-PRV-Bar??Bartha-K61?,?>?<?■?■??/?,?、、'、?PRV-R2、、、、、??/?、、'、、?''??PRV?classical?or?/
【參考文獻】:
期刊論文
[1]豬偽狂犬病病毒變異株的分離鑒定及其gE基因的分子特征[J]. 趙鴻遠,彭金美,安同慶,李琳,冷超糧,陳家锃,王倩,常丹,張秋月,蔡雪輝,童光志,田志軍. 中國預防獸醫(yī)學報. 2014(07)
[2]豬偽狂犬病病毒新流行株的分離鑒定及抗原差異性分析[J]. 彭金美,安同慶,趙鴻遠,劉益民,陳家锃,冷超糧,孫艷,常丹,田志軍,童光志. 中國預防獸醫(yī)學報. 2013(01)
[3]豬偽狂犬病研究進展[J]. 李春華,王英,蔣鳳英,胡建華. 動物醫(yī)學進展. 2008(03)
[4]檢測偽狂犬病病毒雙抗體夾心間接ELISA方法的建立與應用[J]. 汪招雄,何啟蓋,劉麗娜,劉正飛,黃紅亮,陳煥春. 中國預防獸醫(yī)學報. 2006(02)
[5]偽狂犬病流行現狀及我國應采取的防制措施[J]. 童光志,陳煥春. 中國獸醫(yī)學報. 1999(01)
[6]應用微量中和試驗進行豬偽狂犬病血清學調查[J]. 方六榮,陳煥春,何啟蓋,吳斌,金梅林,吳美洲. 中國畜禽傳染病. 1998(03)
本文編號:3119097
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