大熊貓輪狀病毒實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立與初步應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2021-04-02 03:43
大熊貓(Ailuropoda melanoleuca)屬于我國(guó)獨(dú)有且瀕危珍稀的野生物種,受制于大面積棲息地碎片化和隔離小種群導(dǎo)致無法自然繁殖,大熊貓遷地保護(hù)工作因此尤為重要。大熊貓輪狀病毒(Giant Panda Rotavirus,GPRV)感染常引起幼獸的腹瀉,甚至死亡,是一種嚴(yán)重危害大熊貓遷地保護(hù)的疾病。輪狀病毒診斷方法多樣,各具優(yōu)缺點(diǎn),對(duì)于發(fā)生腹瀉性疾病的大熊貓而言,快速且準(zhǔn)確的區(qū)分是否輪狀病毒感染所致,能為臨床處置贏得寶貴的時(shí)間和提供方向性指導(dǎo)。近年來,實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)(Real-time Fuorescence Quantitative PCR,qPCR)在人類重大公共衛(wèi)生疫病的診斷中發(fā)揮了重大作用,被認(rèn)為是極其高效的診斷方法。本研究依據(jù)GenBank中登錄的GPRV VP4基因序列設(shè)計(jì)1對(duì)引物,通過對(duì)引物濃度、退火溫度和循環(huán)數(shù)的優(yōu)化,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,建立一種能快速準(zhǔn)確定量檢測(cè)樣品中的GPRV實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法,使本方法敏感度達(dá)1.0×100拷貝/μL;同時(shí)通過對(duì)重組質(zhì)粒各稀釋度核酸樣品進(jìn)行常規(guī)RT-PCR檢測(cè),其敏感度可達(dá)1.0×1...
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:50 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
GPRV目的片斷PCR擴(kuò)增Fig.2-1ThetargetgeneofGPRVamplificationsbyPCR
實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR對(duì)不同濃度質(zhì)粒的檢測(cè)
以該試驗(yàn)優(yōu)化的條件進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR反應(yīng)并繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,橫坐標(biāo)為不同稀釋度的標(biāo)準(zhǔn)陽性模板的對(duì)數(shù),縱坐標(biāo)為實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR 反應(yīng)過程中出現(xiàn)熒光信號(hào)的初始循環(huán)數(shù)Cq(圖2-3)。標(biāo)準(zhǔn)曲線的直線方程為:y=-3.142x+52.254。結(jié)果顯示實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR在6.4×1013拷貝/μL~6.4×109拷貝/μL范圍內(nèi),r2=0.999,具有良好的線性關(guān)系。圖 2-3 標(biāo)準(zhǔn)曲線Fig.2-3 The standard curve
本文編號(hào):3114518
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:50 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
GPRV目的片斷PCR擴(kuò)增Fig.2-1ThetargetgeneofGPRVamplificationsbyPCR
實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR對(duì)不同濃度質(zhì)粒的檢測(cè)
以該試驗(yàn)優(yōu)化的條件進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR反應(yīng)并繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,橫坐標(biāo)為不同稀釋度的標(biāo)準(zhǔn)陽性模板的對(duì)數(shù),縱坐標(biāo)為實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR 反應(yīng)過程中出現(xiàn)熒光信號(hào)的初始循環(huán)數(shù)Cq(圖2-3)。標(biāo)準(zhǔn)曲線的直線方程為:y=-3.142x+52.254。結(jié)果顯示實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR在6.4×1013拷貝/μL~6.4×109拷貝/μL范圍內(nèi),r2=0.999,具有良好的線性關(guān)系。圖 2-3 標(biāo)準(zhǔn)曲線Fig.2-3 The standard curve
本文編號(hào):3114518
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