雞肝臟表達(dá)譜數(shù)據(jù)分析篩選脂肪沉積相關(guān)基因
發(fā)布時(shí)間:2021-03-31 03:01
雞是高質(zhì)量動(dòng)物蛋白來源,也是肥胖研究中的重要模式生物,雞脂肪沉積機(jī)理研究尤為重要。本研究利用GEO數(shù)據(jù)庫(GSE3867)表達(dá)譜數(shù)據(jù),16個(gè)樣本包括8個(gè)低脂肪品系雞(≤1%)的肝臟樣品(LF)和8個(gè)高脂肪品系(≥3.2%)肝臟樣本(HF),屠宰周齡為8周;雞基因組注釋文件來源于NCBI,韋恩圖部分?jǐn)?shù)據(jù)來源于NCBI生命科學(xué)期刊文獻(xiàn)數(shù)字化檔案庫。結(jié)合生物信息學(xué)技術(shù),挖掘高脂組和低脂組雞肝臟中表達(dá)差異顯著的基因。結(jié)果顯示:篩選出26個(gè)在肝臟中表達(dá)差異顯著的基因;GO分析和KEGG分析發(fā)現(xiàn)多數(shù)顯著基因參與脂代謝和糖代謝的調(diào)節(jié),其中,關(guān)鍵基因CYP2C45、FASN、SCD和FADS2均與不飽和脂肪酸的合成有關(guān)。
【文章來源】:中國畜牧雜志. 2020,56(10)北大核心
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
表達(dá)量數(shù)據(jù)的箱線圖
顯著基因的互作分析圖
FASN互作基因
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]惠陽胡須雞LPL、FASN基因多態(tài)性的研究[J]. 李紅偉,陳圓,鮑淼,田慶慶,賀揚(yáng),蘇耀輝,鄒志冠. 福建農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2016(07)
本文編號(hào):3110653
【文章來源】:中國畜牧雜志. 2020,56(10)北大核心
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
表達(dá)量數(shù)據(jù)的箱線圖
顯著基因的互作分析圖
FASN互作基因
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]惠陽胡須雞LPL、FASN基因多態(tài)性的研究[J]. 李紅偉,陳圓,鮑淼,田慶慶,賀揚(yáng),蘇耀輝,鄒志冠. 福建農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2016(07)
本文編號(hào):3110653
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