原始生殖細(xì)胞關(guān)鍵基因CC2EIP的生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-03-27 14:47
為了對(duì)前期高通量測(cè)序結(jié)果篩選獲得的雞原始生殖細(xì)胞(PGCs)特異表達(dá)的未知轉(zhuǎn)錄本(C2EIP)進(jìn)行系統(tǒng)的功能注釋,試驗(yàn)通過(guò)PCR技術(shù)克隆C2EIP全長(zhǎng),并結(jié)合生物信息學(xué)技術(shù)對(duì)C2EIP的理化性質(zhì)進(jìn)行系統(tǒng)分析。結(jié)果顯示:通過(guò)PCR成功克隆C2EIP全長(zhǎng),為714 bp,測(cè)序比對(duì)結(jié)果準(zhǔn)確。生物信息學(xué)分析表明:C2EIP主要在細(xì)胞質(zhì)中表達(dá),存在磷酸化和糖基化位點(diǎn),在生物進(jìn)化過(guò)程中物種間保守性較差,禽類中保守性較高;C2EIP具有泛素化連接酶E3和磷酸化雷帕霉素靶蛋白復(fù)合體功能。試驗(yàn)結(jié)果為進(jìn)一步研究C2EIP的功能和分子機(jī)制奠定了理論基礎(chǔ)。
【文章來(lái)源】:中國(guó)家禽. 2020,42(10)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【部分圖文】:
C2EIP蛋白二級(jí)、三級(jí)結(jié)構(gòu)分析
C2EIP疏水性預(yù)測(cè)結(jié)果
蛋白功能結(jié)構(gòu)域是蛋白行使功能的基礎(chǔ)和前提,為了進(jìn)一步預(yù)測(cè)C2EIP蛋白可能行使的功能,通過(guò)Smart軟件對(duì)C2EIP蛋白進(jìn)行功能結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè),預(yù)測(cè)結(jié)果發(fā)現(xiàn)C2EIP在第23~76位氨基酸處存在泛素化酶Cμllin功能域,推測(cè)C2EIP具有泛素化連接酶E3功能,調(diào)節(jié)相關(guān)蛋白泛素化修飾;同時(shí)在第106~183位氨基酸存在磷酸化雷帕霉素靶蛋白復(fù)合體,具有調(diào)節(jié)相關(guān)蛋白磷酸化修飾功能(見(jiàn)圖5)。圖5 C2EIP蛋白功能結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]豬EGFL6基因生物信息學(xué)分析[J]. 孫彩霞,李明,喬瑞敏,韓雪蕾,李新建. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(04)
[2]組氨酸對(duì)體外培養(yǎng)奶牛乳腺上皮細(xì)胞β-酪蛋白及酪氨酸激酶2-信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)與轉(zhuǎn)錄激活子5/哺乳動(dòng)物雷帕霉素靶蛋白信號(hào)通路相關(guān)磷酸化蛋白表達(dá)的影響[J]. 王珊珊,高海娜,趙圣國(guó),鄭楠,張養(yǎng)東,王加啟,閆素梅. 動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)學(xué)報(bào). 2016(03)
[3]雞胚原始生殖細(xì)胞定向誘導(dǎo)分化為脂肪和神經(jīng)元樣細(xì)胞[J]. 李碧春,葛劍輝,徐琪,秦潔,包文斌,趙文明,吳信生,蔡琳琳,陳國(guó)宏. 解剖學(xué)報(bào). 2008(04)
[4]雞胚胎原始生殖細(xì)胞的體外培養(yǎng)[J]. 秦潔,蔡琳琳,李碧春,韓威,周冠月,吳宏,孫思宇. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2006(04)
[5]雞胚胎性腺發(fā)生發(fā)育的研究[J]. 李碧春,陳國(guó)宏,王克華,錢(qián)菊汾. 中國(guó)家禽. 2001(08)
本文編號(hào):3103690
【文章來(lái)源】:中國(guó)家禽. 2020,42(10)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【部分圖文】:
C2EIP蛋白二級(jí)、三級(jí)結(jié)構(gòu)分析
C2EIP疏水性預(yù)測(cè)結(jié)果
蛋白功能結(jié)構(gòu)域是蛋白行使功能的基礎(chǔ)和前提,為了進(jìn)一步預(yù)測(cè)C2EIP蛋白可能行使的功能,通過(guò)Smart軟件對(duì)C2EIP蛋白進(jìn)行功能結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè),預(yù)測(cè)結(jié)果發(fā)現(xiàn)C2EIP在第23~76位氨基酸處存在泛素化酶Cμllin功能域,推測(cè)C2EIP具有泛素化連接酶E3功能,調(diào)節(jié)相關(guān)蛋白泛素化修飾;同時(shí)在第106~183位氨基酸存在磷酸化雷帕霉素靶蛋白復(fù)合體,具有調(diào)節(jié)相關(guān)蛋白磷酸化修飾功能(見(jiàn)圖5)。圖5 C2EIP蛋白功能結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]豬EGFL6基因生物信息學(xué)分析[J]. 孫彩霞,李明,喬瑞敏,韓雪蕾,李新建. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(04)
[2]組氨酸對(duì)體外培養(yǎng)奶牛乳腺上皮細(xì)胞β-酪蛋白及酪氨酸激酶2-信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)與轉(zhuǎn)錄激活子5/哺乳動(dòng)物雷帕霉素靶蛋白信號(hào)通路相關(guān)磷酸化蛋白表達(dá)的影響[J]. 王珊珊,高海娜,趙圣國(guó),鄭楠,張養(yǎng)東,王加啟,閆素梅. 動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)學(xué)報(bào). 2016(03)
[3]雞胚原始生殖細(xì)胞定向誘導(dǎo)分化為脂肪和神經(jīng)元樣細(xì)胞[J]. 李碧春,葛劍輝,徐琪,秦潔,包文斌,趙文明,吳信生,蔡琳琳,陳國(guó)宏. 解剖學(xué)報(bào). 2008(04)
[4]雞胚胎原始生殖細(xì)胞的體外培養(yǎng)[J]. 秦潔,蔡琳琳,李碧春,韓威,周冠月,吳宏,孫思宇. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2006(04)
[5]雞胚胎性腺發(fā)生發(fā)育的研究[J]. 李碧春,陳國(guó)宏,王克華,錢(qián)菊汾. 中國(guó)家禽. 2001(08)
本文編號(hào):3103690
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