青島地區(qū)禽源E.coli毒力因子和耐藥性調(diào)查與分析
發(fā)布時間:2021-03-21 22:40
禽源大腸桿菌(E.coli)作為條件致病菌不僅直接影響?zhàn)B禽業(yè)生產(chǎn),而且其攜帶的耐藥基因和毒力基因可隨著食物鏈問接對公眾健康造成危害。耐藥性和毒力的結(jié)合可造成該類細菌引發(fā)的疾病更加難以預(yù)防和治療。因此,本研究對2010~2012年青島地區(qū)的249株表觀健康禽源E.coli的耐藥表型、ESBLs表型與基因型、Ⅰ型與Ⅱ整合子和24種毒力基因進行了檢測以及系統(tǒng)進化群分析,探討了耐藥、毒力、系統(tǒng)進化群之間的相關(guān)性。旨在了解青島地區(qū)禽源E.coli耐藥性和毒力基因的流行分布情況以及兩者之間的相互關(guān)系,為生產(chǎn)上有效控制此類高毒高耐菌株的流行和傳播提供依據(jù)。本研究采用PCR法進行了E.coli菌株毒力因子調(diào)查與系統(tǒng)進化群分析。結(jié)果顯示:11種毒力因子的24種毒力基因均有檢出,毒力因子在青島地區(qū)健康家禽E.coli中廣泛分布和流行,且呈組合形式存在并協(xié)同發(fā)揮致病作用,攜帶基因組合fimH+iucD+iutA+iroN+iss+vat+colBM+traT的菌株致病力最強;健康家禽中高致病群D群和B2群E.coli菌株的檢出率高于其他國家;E.coli菌株毒力基因的種類和數(shù)量、系統(tǒng)進化群與其致病能力的強弱...
【文章來源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:110 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 前言
1.1 大腸桿菌對畜牧業(yè)生產(chǎn)和公共衛(wèi)生健康的影響
1.2 禽源大腸埃希菌毒力基因的研究進展
1.2.1 毒力因子的主要種類
1.2.2 毒力因子的毒力特性
1.2.3 毒力因子的分子流行病學(xué)
1.3 超廣譜B-內(nèi)酰胺酶的研究進展
1.3.1 ESBLs的定義和來源
1.3.2 ESBLs的分類
1.3.3 ESBLS的流行病學(xué)調(diào)查
1.4 整合子的研究進展
1.4.1 整合子的結(jié)構(gòu)
1.4.2 整合子的分類
1.4.3 耐藥基因盒
1.4.4 整合子-基因盒系統(tǒng)的流行病學(xué)
1.5 選題的目的和意義
1.6 本試驗的創(chuàng)新點
2 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 試驗菌株
2.1.2 主要試劑
2.1.3 主要儀器與設(shè)備
2.1.4 試驗動物
2.2 方法
2.2.1 細菌基因組模板的制備
2.2.2 毒力因子的檢測
2.2.3 系統(tǒng)進化群分析
2.2.4 動物致病性試驗
2.2.5 最小抑菌濃度測定
2.2.6 超廣譜β內(nèi)酰胺酶的表型檢測
2.2.7 質(zhì)粒模板的提取
2.2.8 超廣譜β-內(nèi)酰胺酶基因型和基因亞型的檢測
2.2.9 Ⅰ型和Ⅱ型整合子的檢測
2.2.10 序列測定
2.2.11 統(tǒng)計分析
3 結(jié)果與分析
3.1 毒力因子的檢測結(jié)果
3.1.1 24種毒力基因的檢測結(jié)果
3.1.2 毒力基因組合分析
3.2 系統(tǒng)進化群分析結(jié)果
3.2.1 系統(tǒng)進化群分群結(jié)果
3.2.2 不同系統(tǒng)進化群的毒力基因攜帶情況
3.3 動物致病性試驗結(jié)果
3.3.1 試驗組
3.3.2 對照組
3.3.3 系統(tǒng)進化群菌株致病結(jié)果
3.4 系統(tǒng)進化群與毒力基因的相關(guān)性分析
3.5 禽源大腸桿菌耐藥測定結(jié)果
3.6 超廣譜B-內(nèi)酰胺酶的表型檢測結(jié)果
3.7 產(chǎn)ESBLS和非產(chǎn)ESBLS菌株的耐藥情況比較
3.7.1 耐藥率比較
3.7.2 多重耐藥比較
3.8 超廣譜B-內(nèi)酰胺酶基因型的檢測結(jié)果
3.8.1 四種常見基因型的檢測結(jié)果
3.8.2 基因亞型的檢測
3.8.3 ESBLs基因型和基因亞型的組合形式分析
3.9 Ⅰ型和Ⅱ型整合子的檢測結(jié)果
3.9.1 Ⅰ型和Ⅱ型整合酶的檢測結(jié)果
3.9.2 Ⅰ型和Ⅱ型整合子基因盒的檢測結(jié)果
3.9.3 Ⅰ型整合子的酶切反應(yīng)結(jié)果
3.9.4 整合子基因盒的測序結(jié)果
3.10 各類整合子及其攜帶耐藥基因盒的流行情況
3.11 耐藥表型與毒力之間的相關(guān)性
3.11.1 耐藥表型與毒力基因的相關(guān)性
3.11.2 耐藥表型與系統(tǒng)進化群的相關(guān)性
3.11.3 多重耐藥與毒力的相關(guān)性
3.11.4 多重耐藥與系統(tǒng)進化群的相關(guān)性
3.12 超廣譜β-內(nèi)酰胺酶與毒力的相關(guān)性
3.12.1 ESBLs表型與毒力基因的相關(guān)性
3.12.2 ESBLs表型與系統(tǒng)進化群的相關(guān)性
3.12.3 ESBLs基因亞型與系統(tǒng)進化群的相關(guān)性
3.13 整合子與毒力之間的相關(guān)性
3.13.1 整合子與毒力基因的相關(guān)性
3.13.2 整合子-基因盒與系統(tǒng)進化群的相關(guān)性
4 討論
4.1 24種毒力基因流行分布情況
4.2 系統(tǒng)進化群分析
4.3 毒力基因、系統(tǒng)進化群與致病性的關(guān)系
4.4 禽源大腸桿菌耐藥性的流行情況
4.5 超廣譜B-內(nèi)酰胺酶表型流行情況
4.6 超廣譜B-內(nèi)酰胺酶基因型的流行分布
4.7 超廣譜B-內(nèi)酰胺酶基因亞型的流行分布
4.7.1 TEM基因亞型
4.7.2 OXA基因亞型
4.7.3 CTX-M基因亞型
4.7.4 關(guān)于CTX-M-1組和CTX-M-9組組合的討論
4.8 Ⅰ型整合子流行分布及與耐藥性的關(guān)系
4.9 Ⅱ型整合子流行分布及與耐藥性的關(guān)系
4.10 耐藥表型與毒力基因的相關(guān)性
4.11 耐藥表型與系統(tǒng)進化群的相關(guān)性
4.12 超廣譜B-內(nèi)酰胺酶與毒力基因的相關(guān)性
4.13 ESBLS基因型與系統(tǒng)進化群的相關(guān)性
4.14 整合子-基因盒與系統(tǒng)進化群、毒力基因的相關(guān)性
5 結(jié)論
致謝
參考文獻
英文縮寫詞表
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
【參考文獻】:
期刊論文
[1]西藏地區(qū)藏雞大腸桿菌超廣譜β-內(nèi)酰胺酶檢測及藥物敏感性分析[J]. 劉保光,世洪勛,格桑頓旦,彭措曲珍,尼夏羅布,頓珠. 家畜生態(tài)學(xué)報. 2013(03)
[2]雞、豬大腸桿菌ESBLs基因型檢測及耐藥性分析[J]. 曲志娜,張穎,李玉清,李梁梁,王娟,黃秀梅,劉煥奇. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2013(08)
[3]禽致病性大腸桿菌研究進展[J]. 馬興樹,范翠蝶,夏玉龍. 中國畜牧獸醫(yī). 2013(02)
[4]動物源大腸桿菌整合子攜帶氨基糖苷類耐藥基因盒的研究[J]. 林居純,曹三杰,張輝建,鐘青卿,魏峰,文心田. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2011(11)
[5]雞源大腸桿菌ESBLs基因型檢測及其耐藥性分析[J]. 薛原,陳建飛,張秀英,華育平,趙樹臣. 中國獸醫(yī)雜志. 2011(04)
[6]豬源大腸桿菌耐藥性與Ⅰ型整合子關(guān)系研究[J]. 曲志娜,李偉臣,王娟,趙思俊,黃秀梅,鄭增忍. 中國動物檢疫. 2010(12)
[7]K-B紙片擴散法藥敏試驗[J]. 譚瑤,趙清,舒為群,陳浩. 檢驗醫(yī)學(xué)與臨床. 2010(20)
[8]雞大腸桿菌TEM和CTX-M型超廣譜β-內(nèi)酰胺酶基因分型研究[J]. 苑麗,劉建華,胡功政,潘玉善,莫娟,魏永俊,裴亞玲. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(20)
[9]禽源大腸桿菌多重耐藥性與Ⅰ類整合子的關(guān)系[J]. 范建華,卜仕金,徐步,劉學(xué)賢,趙寶華,王曉泉. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(05)
[10]大腸埃希菌毒力因子ColBM質(zhì)粒和轉(zhuǎn)錄反終止子研究進展[J]. 夏夢蕓,湯文,岳華. 動物醫(yī)學(xué)進展. 2010(05)
博士論文
[1]禽大腸桿菌病的診斷及大腸桿菌的耐藥機制研究[D]. Muhammad Yaqoob.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[2]雞源分離菌超廣譜β-內(nèi)酰胺酶基因分型和整合子分子特征[D]. 苑麗.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[3]禽病原性大腸桿菌與尿道致病性大腸桿菌毒力基因相關(guān)性與體內(nèi)外表達差異及其ftsk突變株的研究[D]. 趙李祥.揚州大學(xué) 2008
[4]產(chǎn)超廣譜β-內(nèi)酰胺酶革蘭陰性菌分子耐藥機制研究[D]. 倪朝輝.吉林大學(xué) 2007
[5]2004-2006年長春市醫(yī)院內(nèi)細菌耐藥監(jiān)測及產(chǎn)超廣譜β內(nèi)酰氨酶基因型特征的研究[D]. 黃晶.吉林大學(xué) 2007
[6]禽病原性大腸桿菌的生物學(xué)特性及其可能毒力相關(guān)基因的鑒定[D]. 陳祥.揚州大學(xué) 2006
[7]禽致病性大腸桿菌耐藥基因和毒力因子的分子流行病學(xué)及HPI Irp1細胞表位作用的研究[D]. 金文杰.揚州大學(xué) 2006
碩士論文
[1]雞源致病性大腸埃希菌耐藥基因及毒力基因檢測研究[D]. 王利勤.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2012
[2]畜禽腸道大腸桿菌耐藥性及整合子—基因盒檢測[D]. 張輝建.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[3]雞源禽致病性大腸桿菌分離鑒定及其毒力相關(guān)基因分布特征分析[D]. 蘇志新.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]1800株G-桿菌插入序列共同區(qū)和整合子的耐藥機制研究[D]. 王鳳平.南方醫(yī)科大學(xué) 2010
[5]雞源大腸桿菌ESBLs基因型檢測[D]. 裴亞玲.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[6]禽致病性大腸桿菌流行病學(xué)調(diào)查及三株大腸桿菌對磷霉素耐藥機制的初探[D]. 鄭志明.揚州大學(xué) 2007
[7]健康人腸道大腸埃希菌耐藥性與Ⅰ類整合子關(guān)系的研究[D]. 方梅.四川大學(xué) 2006
本文編號:3093641
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【文章頁數(shù)】:110 頁
【學(xué)位級別】:碩士
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摘要
Abstract
1 前言
1.1 大腸桿菌對畜牧業(yè)生產(chǎn)和公共衛(wèi)生健康的影響
1.2 禽源大腸埃希菌毒力基因的研究進展
1.2.1 毒力因子的主要種類
1.2.2 毒力因子的毒力特性
1.2.3 毒力因子的分子流行病學(xué)
1.3 超廣譜B-內(nèi)酰胺酶的研究進展
1.3.1 ESBLs的定義和來源
1.3.2 ESBLs的分類
1.3.3 ESBLS的流行病學(xué)調(diào)查
1.4 整合子的研究進展
1.4.1 整合子的結(jié)構(gòu)
1.4.2 整合子的分類
1.4.3 耐藥基因盒
1.4.4 整合子-基因盒系統(tǒng)的流行病學(xué)
1.5 選題的目的和意義
1.6 本試驗的創(chuàng)新點
2 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 試驗菌株
2.1.2 主要試劑
2.1.3 主要儀器與設(shè)備
2.1.4 試驗動物
2.2 方法
2.2.1 細菌基因組模板的制備
2.2.2 毒力因子的檢測
2.2.3 系統(tǒng)進化群分析
2.2.4 動物致病性試驗
2.2.5 最小抑菌濃度測定
2.2.6 超廣譜β內(nèi)酰胺酶的表型檢測
2.2.7 質(zhì)粒模板的提取
2.2.8 超廣譜β-內(nèi)酰胺酶基因型和基因亞型的檢測
2.2.9 Ⅰ型和Ⅱ型整合子的檢測
2.2.10 序列測定
2.2.11 統(tǒng)計分析
3 結(jié)果與分析
3.1 毒力因子的檢測結(jié)果
3.1.1 24種毒力基因的檢測結(jié)果
3.1.2 毒力基因組合分析
3.2 系統(tǒng)進化群分析結(jié)果
3.2.1 系統(tǒng)進化群分群結(jié)果
3.2.2 不同系統(tǒng)進化群的毒力基因攜帶情況
3.3 動物致病性試驗結(jié)果
3.3.1 試驗組
3.3.2 對照組
3.3.3 系統(tǒng)進化群菌株致病結(jié)果
3.4 系統(tǒng)進化群與毒力基因的相關(guān)性分析
3.5 禽源大腸桿菌耐藥測定結(jié)果
3.6 超廣譜B-內(nèi)酰胺酶的表型檢測結(jié)果
3.7 產(chǎn)ESBLS和非產(chǎn)ESBLS菌株的耐藥情況比較
3.7.1 耐藥率比較
3.7.2 多重耐藥比較
3.8 超廣譜B-內(nèi)酰胺酶基因型的檢測結(jié)果
3.8.1 四種常見基因型的檢測結(jié)果
3.8.2 基因亞型的檢測
3.8.3 ESBLs基因型和基因亞型的組合形式分析
3.9 Ⅰ型和Ⅱ型整合子的檢測結(jié)果
3.9.1 Ⅰ型和Ⅱ型整合酶的檢測結(jié)果
3.9.2 Ⅰ型和Ⅱ型整合子基因盒的檢測結(jié)果
3.9.3 Ⅰ型整合子的酶切反應(yīng)結(jié)果
3.9.4 整合子基因盒的測序結(jié)果
3.10 各類整合子及其攜帶耐藥基因盒的流行情況
3.11 耐藥表型與毒力之間的相關(guān)性
3.11.1 耐藥表型與毒力基因的相關(guān)性
3.11.2 耐藥表型與系統(tǒng)進化群的相關(guān)性
3.11.3 多重耐藥與毒力的相關(guān)性
3.11.4 多重耐藥與系統(tǒng)進化群的相關(guān)性
3.12 超廣譜β-內(nèi)酰胺酶與毒力的相關(guān)性
3.12.1 ESBLs表型與毒力基因的相關(guān)性
3.12.2 ESBLs表型與系統(tǒng)進化群的相關(guān)性
3.12.3 ESBLs基因亞型與系統(tǒng)進化群的相關(guān)性
3.13 整合子與毒力之間的相關(guān)性
3.13.1 整合子與毒力基因的相關(guān)性
3.13.2 整合子-基因盒與系統(tǒng)進化群的相關(guān)性
4 討論
4.1 24種毒力基因流行分布情況
4.2 系統(tǒng)進化群分析
4.3 毒力基因、系統(tǒng)進化群與致病性的關(guān)系
4.4 禽源大腸桿菌耐藥性的流行情況
4.5 超廣譜B-內(nèi)酰胺酶表型流行情況
4.6 超廣譜B-內(nèi)酰胺酶基因型的流行分布
4.7 超廣譜B-內(nèi)酰胺酶基因亞型的流行分布
4.7.1 TEM基因亞型
4.7.2 OXA基因亞型
4.7.3 CTX-M基因亞型
4.7.4 關(guān)于CTX-M-1組和CTX-M-9組組合的討論
4.8 Ⅰ型整合子流行分布及與耐藥性的關(guān)系
4.9 Ⅱ型整合子流行分布及與耐藥性的關(guān)系
4.10 耐藥表型與毒力基因的相關(guān)性
4.11 耐藥表型與系統(tǒng)進化群的相關(guān)性
4.12 超廣譜B-內(nèi)酰胺酶與毒力基因的相關(guān)性
4.13 ESBLS基因型與系統(tǒng)進化群的相關(guān)性
4.14 整合子-基因盒與系統(tǒng)進化群、毒力基因的相關(guān)性
5 結(jié)論
致謝
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攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
【參考文獻】:
期刊論文
[1]西藏地區(qū)藏雞大腸桿菌超廣譜β-內(nèi)酰胺酶檢測及藥物敏感性分析[J]. 劉保光,世洪勛,格桑頓旦,彭措曲珍,尼夏羅布,頓珠. 家畜生態(tài)學(xué)報. 2013(03)
[2]雞、豬大腸桿菌ESBLs基因型檢測及耐藥性分析[J]. 曲志娜,張穎,李玉清,李梁梁,王娟,黃秀梅,劉煥奇. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2013(08)
[3]禽致病性大腸桿菌研究進展[J]. 馬興樹,范翠蝶,夏玉龍. 中國畜牧獸醫(yī). 2013(02)
[4]動物源大腸桿菌整合子攜帶氨基糖苷類耐藥基因盒的研究[J]. 林居純,曹三杰,張輝建,鐘青卿,魏峰,文心田. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2011(11)
[5]雞源大腸桿菌ESBLs基因型檢測及其耐藥性分析[J]. 薛原,陳建飛,張秀英,華育平,趙樹臣. 中國獸醫(yī)雜志. 2011(04)
[6]豬源大腸桿菌耐藥性與Ⅰ型整合子關(guān)系研究[J]. 曲志娜,李偉臣,王娟,趙思俊,黃秀梅,鄭增忍. 中國動物檢疫. 2010(12)
[7]K-B紙片擴散法藥敏試驗[J]. 譚瑤,趙清,舒為群,陳浩. 檢驗醫(yī)學(xué)與臨床. 2010(20)
[8]雞大腸桿菌TEM和CTX-M型超廣譜β-內(nèi)酰胺酶基因分型研究[J]. 苑麗,劉建華,胡功政,潘玉善,莫娟,魏永俊,裴亞玲. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(20)
[9]禽源大腸桿菌多重耐藥性與Ⅰ類整合子的關(guān)系[J]. 范建華,卜仕金,徐步,劉學(xué)賢,趙寶華,王曉泉. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(05)
[10]大腸埃希菌毒力因子ColBM質(zhì)粒和轉(zhuǎn)錄反終止子研究進展[J]. 夏夢蕓,湯文,岳華. 動物醫(yī)學(xué)進展. 2010(05)
博士論文
[1]禽大腸桿菌病的診斷及大腸桿菌的耐藥機制研究[D]. Muhammad Yaqoob.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[2]雞源分離菌超廣譜β-內(nèi)酰胺酶基因分型和整合子分子特征[D]. 苑麗.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[3]禽病原性大腸桿菌與尿道致病性大腸桿菌毒力基因相關(guān)性與體內(nèi)外表達差異及其ftsk突變株的研究[D]. 趙李祥.揚州大學(xué) 2008
[4]產(chǎn)超廣譜β-內(nèi)酰胺酶革蘭陰性菌分子耐藥機制研究[D]. 倪朝輝.吉林大學(xué) 2007
[5]2004-2006年長春市醫(yī)院內(nèi)細菌耐藥監(jiān)測及產(chǎn)超廣譜β內(nèi)酰氨酶基因型特征的研究[D]. 黃晶.吉林大學(xué) 2007
[6]禽病原性大腸桿菌的生物學(xué)特性及其可能毒力相關(guān)基因的鑒定[D]. 陳祥.揚州大學(xué) 2006
[7]禽致病性大腸桿菌耐藥基因和毒力因子的分子流行病學(xué)及HPI Irp1細胞表位作用的研究[D]. 金文杰.揚州大學(xué) 2006
碩士論文
[1]雞源致病性大腸埃希菌耐藥基因及毒力基因檢測研究[D]. 王利勤.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2012
[2]畜禽腸道大腸桿菌耐藥性及整合子—基因盒檢測[D]. 張輝建.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[3]雞源禽致病性大腸桿菌分離鑒定及其毒力相關(guān)基因分布特征分析[D]. 蘇志新.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]1800株G-桿菌插入序列共同區(qū)和整合子的耐藥機制研究[D]. 王鳳平.南方醫(yī)科大學(xué) 2010
[5]雞源大腸桿菌ESBLs基因型檢測[D]. 裴亞玲.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[6]禽致病性大腸桿菌流行病學(xué)調(diào)查及三株大腸桿菌對磷霉素耐藥機制的初探[D]. 鄭志明.揚州大學(xué) 2007
[7]健康人腸道大腸埃希菌耐藥性與Ⅰ類整合子關(guān)系的研究[D]. 方梅.四川大學(xué) 2006
本文編號:3093641
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