綿羊Lpin1基因的克
發(fā)布時(shí)間:2021-03-15 08:50
脂素助in1基因在機(jī)體的脂肪代謝中發(fā)揮著重要的作用,不僅可以作為磷脂酸磷酸酶(phosphatidate phosphatase, PAP)直接參與甘油脂類和磷脂的合成,而且可以作為轉(zhuǎn)錄輔活化因子,間接調(diào)節(jié)脂類代謝相關(guān)基因的表達(dá)。通過(guò)研究LpinI基因的結(jié)構(gòu)、遺傳變異、表達(dá)及其與相關(guān)性狀的相關(guān)性,有利于深入的了解機(jī)體內(nèi)脂肪代謝的機(jī)制。不同尾脂型綿羊機(jī)體脂肪代謝的途徑可能不同。但是,目前關(guān)于綿羊Lpinl基因的核酸序列、分子結(jié)構(gòu)、遺傳變異和表達(dá)的研究未見(jiàn)報(bào)道。本研究從DNA.mRNA和蛋白質(zhì)3個(gè)水平對(duì)綿羊Lpinl基因的結(jié)構(gòu)、多態(tài)性、mRNA及蛋白質(zhì)的表達(dá)及其與性狀的關(guān)聯(lián)進(jìn)行了研究。利用RT-PCR技術(shù)克隆綿羊Lpinl基因的編碼區(qū)序列(coding sequence, CDS),并對(duì)CDS及編碼的氨基酸序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析。以不同脂尾型綿羊(廣靈大尾羊和小尾寒羊)共96個(gè)個(gè)體為研究對(duì)象,利用PCR-SSCP技術(shù)檢測(cè)綿羊Lpinl基因的5’調(diào)控區(qū)序列的多態(tài)性,并將其基因型與兩品種綿羊的尾型性狀及屠宰性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)研究。利用Real-time PCR技術(shù)和Western blotting技...
【文章來(lái)源】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省
【文章頁(yè)數(shù)】:110 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
Lipins蛋白的結(jié)構(gòu)和功能序列(自文獻(xiàn)[24bStructureandfunctionsequenceofLipinsprotein(Afterliterature[20})
數(shù)的酶都分布在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜或線粒體上129],但是通過(guò)對(duì)HeLaM、3T3-U和HEK293等各種細(xì)胞的研究發(fā)現(xiàn),Lipinl蛋白可以分布于細(xì)胞裝、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜及細(xì)胞核3個(gè)區(qū)室中…5],且Lipinl在胞衆(zhòng)/內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜及胞菜/細(xì)胞核間的易位受蛋白質(zhì)翻譯后修飾、原核定位信號(hào)序列以及蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)間互作的影響l3G]。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾能夠影響Lipinl蛋白的亞細(xì)胞定位(圖1-2)。胰島素和氨基酸可以分別通過(guò)磷脂醜肌醇-3-激酵(phosphatidyl inositol - 3 - kinase activity, P13K)和哺乳動(dòng)物類雷帕霉素蛋0 (mammalian target of rapamycin, mTOR)信號(hào)途徑誘導(dǎo)Lipinl發(fā)生憐酸化作用,從而使Lipinl從細(xì)胞衆(zhòng)轉(zhuǎn)移至內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上執(zhí)行其PAP的功能。油酸和腎上腺素則具有相反的作用,能夠使Lipin-]發(fā)生脫憐酸化作用,進(jìn)而脫離內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜t27-3、有絲分裂也可以誘導(dǎo)Lipinl蛋白憐酸化進(jìn)而由細(xì)胞衆(zhòng)易位至內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上述這些研究表明,Lipinl的憐酸化修飾可以影響其在胞裝內(nèi)與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜間的易位。Lipinl的小泛素相關(guān)修飾(small ubiquitin-related modifier, SUMO)能夠誘導(dǎo)該蛋白從細(xì)胞衆(zhòng)轉(zhuǎn)移至細(xì)胞核中,發(fā)揮其轉(zhuǎn)錄輔活化因子的作用。進(jìn)一步的研究表明,Lipinl的該效應(yīng)主要是由Lipinl-a的SUMO化修飾引起的,而Lipinl-p SUMO化修飾的具體功能未知132]。
和 NetPhos 2_0[丨(http://www.cbs.dtu. dk/services/)在線軟件預(yù)測(cè)用 NCBI 的 CDD (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Stmcture/cdd/wrpsb.c結(jié)構(gòu)域118]。列相似性通過(guò)NCBI中的BLAST功能進(jìn)行比對(duì)。MEGA5軟件II9]的基于遺傳距離的鄰接法對(duì)13個(gè)不同物種基進(jìn)化樹。13個(gè)物種Z/7//7/基因的蛋白質(zhì)和mRNA序列信息見(jiàn)表2-2。分析周脂肪組織總RNA的綿羊腎周脂肪組織的總RNA經(jīng)ND-100核酸蛋白測(cè)定儀測(cè)定后,700ng/^iL,OD26o/28()均在1.8?2.0之間,表明RNA濃度及純度較的要求。另取5 [iL進(jìn)行電泳檢測(cè),28S rRNA和18S rRNA的泳帶取的脂肪組織的RNA質(zhì)量較好(圖2-〗),可用作后續(xù)cDNA第
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]LIPIN1基因的結(jié)構(gòu)、功能與表達(dá)調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 束剛,蔡晗,江青艷. 畜牧與獸醫(yī). 2012(S1)
[2]雞Lpin1基因3′-UTR遺傳變異及其對(duì)miRNA結(jié)合位點(diǎn)的潛在效應(yīng)[J]. 李素雅,張建宏,陳文,黃艷群,孫桂榮,韓瑞麗,康相濤. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(08)
[3]Lpin1基因多態(tài)性與黃牛經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)研究[J]. 衛(wèi)利選,常振華,何誠(chéng),郭本玲,藍(lán)賢勇,陳宏,雷初朝. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2012(01)
[4]蛋白質(zhì)翻譯后修飾研究進(jìn)展[J]. 郭會(huì)燦. 生物技術(shù)通報(bào). 2011(07)
[5]Western blot檢測(cè)家兔動(dòng)脈組織蛋白質(zhì)表達(dá)條件的優(yōu)化[J]. 馬艷琴,孫子龍,王彬,郭超,陳鵬曉. 農(nóng)學(xué)學(xué)報(bào). 2011(06)
[6]6個(gè)豬群Lpin1基因多態(tài)性分析[J]. 戈新,邢晉祎,劉忠琛,王建華,李培培,張寶. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2011(01)
[7]PCR-SSCP技術(shù)在微生物檢測(cè)中的應(yīng)用[J]. 顧真慶,馮志新,王占偉,劉茂軍,王海燕,白昀,邵國(guó)青. 生物技術(shù)通報(bào). 2011(02)
[8]雞Lpin1基因c.1727C>T位點(diǎn)遺傳變異及其與脂肪沉積性狀的關(guān)聯(lián)分析[J]. 王伯君,孫玲,黎紹波,朱志明,劉榜. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2010(09)
[9]PCR-SSCP技術(shù)在基因多態(tài)分析中的應(yīng)用[J]. 湯賢春,路健,李學(xué)英. 中國(guó)西部科技. 2010(06)
[10]如何正確估計(jì)蛋白質(zhì)SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳的樣品加樣量[J]. 高重天,孫群. 生物學(xué)通報(bào). 2009(03)
碩士論文
[1]雞Lpin2基因的時(shí)空表達(dá)特性及其遺傳變異與性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 張彩霞.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[2]雞LPIN1基因多態(tài)與固始雞資源群性狀的關(guān)聯(lián)研究[D]. 王潤(rùn)之.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
本文編號(hào):3083905
【文章來(lái)源】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省
【文章頁(yè)數(shù)】:110 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
Lipins蛋白的結(jié)構(gòu)和功能序列(自文獻(xiàn)[24bStructureandfunctionsequenceofLipinsprotein(Afterliterature[20})
數(shù)的酶都分布在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜或線粒體上129],但是通過(guò)對(duì)HeLaM、3T3-U和HEK293等各種細(xì)胞的研究發(fā)現(xiàn),Lipinl蛋白可以分布于細(xì)胞裝、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜及細(xì)胞核3個(gè)區(qū)室中…5],且Lipinl在胞衆(zhòng)/內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜及胞菜/細(xì)胞核間的易位受蛋白質(zhì)翻譯后修飾、原核定位信號(hào)序列以及蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)間互作的影響l3G]。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾能夠影響Lipinl蛋白的亞細(xì)胞定位(圖1-2)。胰島素和氨基酸可以分別通過(guò)磷脂醜肌醇-3-激酵(phosphatidyl inositol - 3 - kinase activity, P13K)和哺乳動(dòng)物類雷帕霉素蛋0 (mammalian target of rapamycin, mTOR)信號(hào)途徑誘導(dǎo)Lipinl發(fā)生憐酸化作用,從而使Lipinl從細(xì)胞衆(zhòng)轉(zhuǎn)移至內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上執(zhí)行其PAP的功能。油酸和腎上腺素則具有相反的作用,能夠使Lipin-]發(fā)生脫憐酸化作用,進(jìn)而脫離內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜t27-3、有絲分裂也可以誘導(dǎo)Lipinl蛋白憐酸化進(jìn)而由細(xì)胞衆(zhòng)易位至內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上述這些研究表明,Lipinl的憐酸化修飾可以影響其在胞裝內(nèi)與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜間的易位。Lipinl的小泛素相關(guān)修飾(small ubiquitin-related modifier, SUMO)能夠誘導(dǎo)該蛋白從細(xì)胞衆(zhòng)轉(zhuǎn)移至細(xì)胞核中,發(fā)揮其轉(zhuǎn)錄輔活化因子的作用。進(jìn)一步的研究表明,Lipinl的該效應(yīng)主要是由Lipinl-a的SUMO化修飾引起的,而Lipinl-p SUMO化修飾的具體功能未知132]。
和 NetPhos 2_0[丨(http://www.cbs.dtu. dk/services/)在線軟件預(yù)測(cè)用 NCBI 的 CDD (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Stmcture/cdd/wrpsb.c結(jié)構(gòu)域118]。列相似性通過(guò)NCBI中的BLAST功能進(jìn)行比對(duì)。MEGA5軟件II9]的基于遺傳距離的鄰接法對(duì)13個(gè)不同物種基進(jìn)化樹。13個(gè)物種Z/7//7/基因的蛋白質(zhì)和mRNA序列信息見(jiàn)表2-2。分析周脂肪組織總RNA的綿羊腎周脂肪組織的總RNA經(jīng)ND-100核酸蛋白測(cè)定儀測(cè)定后,700ng/^iL,OD26o/28()均在1.8?2.0之間,表明RNA濃度及純度較的要求。另取5 [iL進(jìn)行電泳檢測(cè),28S rRNA和18S rRNA的泳帶取的脂肪組織的RNA質(zhì)量較好(圖2-〗),可用作后續(xù)cDNA第
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]LIPIN1基因的結(jié)構(gòu)、功能與表達(dá)調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 束剛,蔡晗,江青艷. 畜牧與獸醫(yī). 2012(S1)
[2]雞Lpin1基因3′-UTR遺傳變異及其對(duì)miRNA結(jié)合位點(diǎn)的潛在效應(yīng)[J]. 李素雅,張建宏,陳文,黃艷群,孫桂榮,韓瑞麗,康相濤. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(08)
[3]Lpin1基因多態(tài)性與黃牛經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)研究[J]. 衛(wèi)利選,常振華,何誠(chéng),郭本玲,藍(lán)賢勇,陳宏,雷初朝. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2012(01)
[4]蛋白質(zhì)翻譯后修飾研究進(jìn)展[J]. 郭會(huì)燦. 生物技術(shù)通報(bào). 2011(07)
[5]Western blot檢測(cè)家兔動(dòng)脈組織蛋白質(zhì)表達(dá)條件的優(yōu)化[J]. 馬艷琴,孫子龍,王彬,郭超,陳鵬曉. 農(nóng)學(xué)學(xué)報(bào). 2011(06)
[6]6個(gè)豬群Lpin1基因多態(tài)性分析[J]. 戈新,邢晉祎,劉忠琛,王建華,李培培,張寶. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2011(01)
[7]PCR-SSCP技術(shù)在微生物檢測(cè)中的應(yīng)用[J]. 顧真慶,馮志新,王占偉,劉茂軍,王海燕,白昀,邵國(guó)青. 生物技術(shù)通報(bào). 2011(02)
[8]雞Lpin1基因c.1727C>T位點(diǎn)遺傳變異及其與脂肪沉積性狀的關(guān)聯(lián)分析[J]. 王伯君,孫玲,黎紹波,朱志明,劉榜. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2010(09)
[9]PCR-SSCP技術(shù)在基因多態(tài)分析中的應(yīng)用[J]. 湯賢春,路健,李學(xué)英. 中國(guó)西部科技. 2010(06)
[10]如何正確估計(jì)蛋白質(zhì)SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳的樣品加樣量[J]. 高重天,孫群. 生物學(xué)通報(bào). 2009(03)
碩士論文
[1]雞Lpin2基因的時(shí)空表達(dá)特性及其遺傳變異與性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 張彩霞.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[2]雞LPIN1基因多態(tài)與固始雞資源群性狀的關(guān)聯(lián)研究[D]. 王潤(rùn)之.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
本文編號(hào):3083905
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