家雞在人們的社會文化生活中起著重要的作用,如作為娛樂、食物和祭祀等。但其馴化起源和擴散路線等問題一直是考古學(xué)和進化生物學(xué)的熱門議題。近幾十年來,線粒體DNA（Mitochondria DNA;mtDNA）成為研究家雞馴化地、馴化時間和演化歷史的重要分子標(biāo)記。測定部分地區(qū)167份家雞的線粒體控制區(qū)（control region;D-loop）數(shù)據(jù),分析揭示西南地區(qū)家雞母系遺傳。新收集并測定的1692份家雞和88份紅原雞（Gallus gallus）樣品的控制區(qū)序列,基于Ion Torrent PGM測序平臺的二代測序方法選取部分具有代表性的61份家雞和紅原雞樣品進行線粒體基因組序列測定。結(jié)合已發(fā)表的數(shù)據(jù)并開展了一系列家雞群體遺傳學(xué)分析,揭示中國家雞的群體歷史。西南部分地區(qū)家雞控制區(qū)的分析結(jié)果表明西南山區(qū)的家雞遺傳多樣性比較豐富,存在著明顯的遺傳分化和母系遺傳。我們對已發(fā)表的大量家雞線粒體DNA進行分析,發(fā)現(xiàn)單倍型亞類群C1（sub-haplogroup）可作為追溯中國北方家雞馴化問題的候選標(biāo)記群體。為了更清楚地了解單倍型亞類群C1的起源,我們利用MitoToolPy得到了每個樣品所屬的單... 

【文章來源】：云南大學(xué)云南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：69 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

mtDNA基因組序列單倍型類群世系樹（a，b）（Miaoetal.2013）

西南山區(qū)樣品分布圖

西南山區(qū)中介網(wǎng)絡(luò)圖

【參考文獻】：
期刊論文
[1]A cryptic mitochondrial DNA link between North European and West African dogs[J]. Adeniyi C.Adeola,Sheila C.Ommeh,Jiao-Jiao Song,S.Charles Olaogun,Oscar J.Sanke,Ting-Ting Yin,Guo-Dong Wang,Shi-Fang Wu,Zhong-Yin Zhou,Jacqueline K.Lichoti,Bernard R.Agwanda,Philip M.Dawuda,Robert W.Murphy,Min-Sheng Peng,Ya-Ping Zhang.  Journal of Genetics and Genomics. 2017(03)
[2]中國古代家養(yǎng)動物的動物考古學(xué)研究[J]. 袁靖.  第四紀(jì)研究. 2010 (02)
[3]原雞線粒體DNA部分序列多態(tài)性分析[J]. 劉益平,朱慶,曾凡同,邱祥聘.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2004(02)



本文編號：3076157