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2013—2018年廣西地區(qū)豬偽狂犬病病毒gB、gE與TK基因遺傳變異分析

發(fā)布時間:2021-03-10 16:45
  為了解廣西近年豬偽狂犬病(PR)流行情況及豬偽狂犬病病毒(PRV)流行株gB、gE、TK基因的遺傳變異特點,于2013—2018年采集廣西各地區(qū)疑似PR發(fā)病豬靶組織714份,進行PRV的PCR檢測及病毒分離鑒定,并運用DNAStar、MEGA 6.0等生物學(xué)軟件對分離毒株gB、gE、TK基因進行遺傳變異分析。結(jié)果顯示:樣品檢測陽性率為24.5%(175/714),共分離獲得PRV流行株38株。受檢豬群普遍存在PRV感染,經(jīng)典毒株及變異毒株并存,而且以變異毒株為主。廣西流行株不同亞群PRV在gB、gE、TK基因上均存在相同的氨基酸變異特點,與國內(nèi)變異株親緣關(guān)系較近。推測廣西流行株存在兩種不同重組變異形式產(chǎn)生的PRV重組毒株,分別為疫苗株gB基因和變異株gE基因重組產(chǎn)生的重組毒株,以及經(jīng)典株的TK基因被疫苗株(HB98)的TK基因替換而產(chǎn)生的重組毒株。近年廣西受檢豬場較普遍存在PRV感染,而且PRV流行株以變異毒株為主,可能存在兩種不同重組變異形式產(chǎn)生的重組毒株,豬場需重視及實施針對性PR免疫防控計劃。 

【文章來源】:畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2020,51(04)北大核心

【文章頁數(shù)】:10 頁

【部分圖文】:

2013—2018年廣西地區(qū)豬偽狂犬病病毒gB、gE與TK基因遺傳變異分析


PRV廣西分離株gE基因系統(tǒng)進化樹

基因系,進化樹,廣西,毒株


相關(guān)研究表明,gB、gE和TK基因分別對于PRV的感染和復(fù)制、細(xì)胞融合以及病毒的侵染能力具有極為重要的作用[12, 16, 26]。研究這三個基因的遺傳變異特點對于分析PRV流行株變異具有重要意義。為進一步較全面了解廣西地區(qū)不同時空PRV流行株流行特點、基因變異與遺傳演化特點,課題組對2013—2018年于廣西各地區(qū)采集的疑似PR發(fā)病豬靶組織進行PRV檢測以及病毒分離鑒定,并對分離流行株gB、gE和TK基因進行克隆測序及遺傳變異分析。分離獲得38株地方流行毒株,對gB、gE基因的同源性及遺傳進化樹分析結(jié)果表明,廣西地區(qū)PRV主要流行毒株為變異株且不同亞型毒株之間存在相同的氨基酸變化特點,這些氨基酸位點的變化可以作為區(qū)分PRV不同亞型的毒株的分子特征,這與已有的研究結(jié)果相符[27-28]。其中,變異株所具有的獨特氨基酸位點的變化,其對病毒毒力的改變以及病毒的免疫逃避是否產(chǎn)生影響需要進一步研究驗證。對廣西PRV流行株的gB、gE基因系統(tǒng)分析研究發(fā)現(xiàn),PRV分離株中2015-LB-2及2015-LB-3毒株的gB基因與疫苗株gB基因相似性較高,而gE基因與變異株gE基因相似性較高,推測其屬于國內(nèi)變異株與疫苗株發(fā)生重組產(chǎn)生的變異重組毒株,表明在廣西地區(qū)PRV變異毒株可能是在疫苗免疫壓力的作用下產(chǎn)生的病毒重組毒株,對此需進一步深入研究加以證實。

基因,樣品,陽性率,同源性


表3 疑似PR病料組織樣品PRV檢測結(jié)果Table 3 Detection results of tissue samples from suspected clinical specimen 采集時間Time 檢測樣品數(shù)/份Number of samples 陽性樣品數(shù)/份Number of positive samples 陽性率/%Positive rate 2013 91 23 25.27 2014 130 34 26.15 2015 156 28 17.95 2016 153 53 34.64 2017 184 37 20.11 2018 89 33 37.082.3.1 gB、gE、TK基因的同源性分析

【參考文獻】:
期刊論文
[1]一株分離自免疫豬場的偽狂犬病病毒的鑒定與變異分析[J]. 王一鵬,王亞文,徐瑞濤,林依丹,李潭清,宋勤葉.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2019(10)
[2]豬偽狂犬病免疫抗體及感染抗體消長規(guī)律研究[J]. 趙雪麗,班付國,馬震原,王東方,王淑娟,閆若潛.  現(xiàn)代牧業(yè). 2019(01)
[3]江西省豬偽狂犬病原流行病學(xué)調(diào)查及其gB、gE及TK基因遺傳變異分析[J]. 李海琴,康昭風(fēng),譚美芳,曾艷兵,季華員.  江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2019(02)
[4]江山地區(qū)豬偽狂犬的流行現(xiàn)狀與防控措施[J]. 王國棟.  畜禽業(yè). 2019(03)
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[6]2014—2016年豫南地區(qū)規(guī);i場豬主要病毒性傳染病流行病學(xué)調(diào)查分析[J]. 劉濤,王瑞,曲哲會,董建國,趙瑜,左春生,易本馳,焦鳳超,馬超鋒.  黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(20)
[7]豬偽狂犬病病毒流行株遺傳進化及序列比對分析[J]. 高澤文,范桂芳,趙婷婷,徐守興,吳斌.  中國獸醫(yī)學(xué)報. 2018(01)
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博士論文
[1]Bartha-k61株疫苗對豬偽狂犬病病毒變異株的免疫保護及變異株生物學(xué)特性的初步研究[D]. 周金柱.揚州大學(xué) 2018

碩士論文
[1]豬偽狂犬病毒GXLB-2015和GXGG-2016毒株的全基因組序列分析和生物學(xué)特性研究[D]. 秦樹英.廣西大學(xué) 2017
[2]豬偽狂犬病病毒HeN1株全基因組測序與病毒遺傳變異分析[D]. 葉超.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[3]山東省免疫豬場豬偽狂犬病毒分離鑒定及gE、gC、gD和TK基因的序列分析[D]. 陳超.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[4]豬偽狂犬病病毒變異株的分離鑒定及其生物學(xué)特性的研究[D]. 趙鴻遠(yuǎn).中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[5]變異豬偽狂犬病毒的分離鑒定及生物學(xué)特性分析[D]. 張青占.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013



本文編號:3074951

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