2018年偽狂犬病病毒的流行特征及其遺傳變異分析
發(fā)布時(shí)間:2021-03-08 09:57
為了了解當(dāng)前偽狂犬病病毒(PRV)在我國豬群中的流行現(xiàn)狀及其遺傳變異情況,本研究利用PCR的方法對2018年1—12月來源于我國28個省、市、自治區(qū)的1 328份疑似豬偽狂犬病發(fā)病豬的組織樣品開展了PRV-gE的檢測及病毒的分離鑒定,同時(shí)針對所分離的病毒的gB、gC和gE基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增和DNA測序,并展開遺傳變異分析。結(jié)果顯示,共有92份樣品為PRV-gE基因檢測陽性,陽性檢出率為6.93%。從92份PRV-gE陽性樣品分離到13株P(guān)RV。分別基于gB基因部分片段、gC和gE基因進(jìn)行遺傳變異分析發(fā)現(xiàn)13株P(guān)RV與我國2012年以后流行的毒株(如HeN1等變異株)親緣關(guān)系較近,而與2012年以前所分離的毒株(如Ea等經(jīng)典毒株)的親緣關(guān)系較遠(yuǎn);此外,絕大多數(shù)中國分離株與國外分離毒株(如NIA-3、Bartha、Kaplan等)在遺傳進(jìn)化樹中位于不同的進(jìn)化分支;相對于國外分離株及國內(nèi)早期流行的經(jīng)典毒株而言,13株P(guān)RV分離株的gB、gC和gE蛋白中均存在許多特征性的氨基酸位點(diǎn)變異。本研究對于了解我國PRV流行現(xiàn)狀及當(dāng)前流行的PRV毒株的生物學(xué)特征具有十分重要的意義。
【文章來源】:畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020,51(03)北大核心
【文章頁數(shù)】:10 頁
【部分圖文】:
不同PRV毒株間的遺傳進(jìn)化分析
經(jīng)PCR檢測PRV-gE基因發(fā)現(xiàn),1 328份臨床樣品中有92份為PRV-gE基因陽性,陽性檢出率為6.93%。就不同月份而言,所有月份PRV-gE的陽性檢出率均低于15%,其中7月份PRV-gE的陽性檢出率最高,為12.63%;12月份PRV-gE的陽性檢出率最低,為零檢出(圖1A)。就不同季節(jié)而言,不同季度PRV-gE陽性檢出率位于5.28%~8.41%,其中夏季最高,為8.41%,而冬季最低,為5.28%(圖1B)。就不同地區(qū)而言,東北(遼寧/黑龍江/吉林)、華南(廣東/廣西/海南)、華北(天津/北京/山西/河北/內(nèi)蒙古)、華中(湖北/湖南/河南)、西南(云南/貴州/重慶/四川)、華東(安徽/山東/江蘇/浙江/福建/上海/江西)和西北(陜西/甘肅/新疆)陽性檢出率分別為12.20%(5/41)、11.58%(11/95)、10.48%(11/105)、8.66%(46/531)、7.69%(4/52)、3.42%(14/409)和1.05%(1/95),所有地區(qū)的陽性檢出率均低于20%,東北地區(qū)陽性檢出率(12.20%)最高,西北地區(qū)陽性檢出率(1.05%)最低(表3)。表3 2018年我國不同地區(qū)PRV的陽性檢出率Table 3 Positive rate of PRV detection in different regions of China in 2018 地區(qū)Regions 樣品總數(shù)Total samples for detection 陽性樣品數(shù)Positive samples 陽性檢出率/%Positive rate 東北 41 5 12.20 華北 105 11 10.48 華東 409 14 3.42 華南 95 11 11.58 華中 531 46 8.66 西南 52 4 7.69 西北 95 1 1.05
PRV gB基因氨基酸序列結(jié)果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]一株分離自免疫豬場的偽狂犬病病毒的鑒定與變異分析[J]. 王一鵬,王亞文,徐瑞濤,林依丹,李潭清,宋勤葉. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(10)
[2]豬偽狂犬病基因缺失疫苗的制備、安全性、免疫原性、保存期測定及區(qū)域試驗(yàn)[J]. 何啟蓋,方六榮,吳斌,劉正飛,吳美洲,肖少波,金梅林,陳煥春. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2005(10)
[3]偽狂犬病流行現(xiàn)狀及我國應(yīng)采取的防制措施[J]. 童光志,陳煥春. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 1999(01)
本文編號:3070861
【文章來源】:畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020,51(03)北大核心
【文章頁數(shù)】:10 頁
【部分圖文】:
不同PRV毒株間的遺傳進(jìn)化分析
經(jīng)PCR檢測PRV-gE基因發(fā)現(xiàn),1 328份臨床樣品中有92份為PRV-gE基因陽性,陽性檢出率為6.93%。就不同月份而言,所有月份PRV-gE的陽性檢出率均低于15%,其中7月份PRV-gE的陽性檢出率最高,為12.63%;12月份PRV-gE的陽性檢出率最低,為零檢出(圖1A)。就不同季節(jié)而言,不同季度PRV-gE陽性檢出率位于5.28%~8.41%,其中夏季最高,為8.41%,而冬季最低,為5.28%(圖1B)。就不同地區(qū)而言,東北(遼寧/黑龍江/吉林)、華南(廣東/廣西/海南)、華北(天津/北京/山西/河北/內(nèi)蒙古)、華中(湖北/湖南/河南)、西南(云南/貴州/重慶/四川)、華東(安徽/山東/江蘇/浙江/福建/上海/江西)和西北(陜西/甘肅/新疆)陽性檢出率分別為12.20%(5/41)、11.58%(11/95)、10.48%(11/105)、8.66%(46/531)、7.69%(4/52)、3.42%(14/409)和1.05%(1/95),所有地區(qū)的陽性檢出率均低于20%,東北地區(qū)陽性檢出率(12.20%)最高,西北地區(qū)陽性檢出率(1.05%)最低(表3)。表3 2018年我國不同地區(qū)PRV的陽性檢出率Table 3 Positive rate of PRV detection in different regions of China in 2018 地區(qū)Regions 樣品總數(shù)Total samples for detection 陽性樣品數(shù)Positive samples 陽性檢出率/%Positive rate 東北 41 5 12.20 華北 105 11 10.48 華東 409 14 3.42 華南 95 11 11.58 華中 531 46 8.66 西南 52 4 7.69 西北 95 1 1.05
PRV gB基因氨基酸序列結(jié)果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]一株分離自免疫豬場的偽狂犬病病毒的鑒定與變異分析[J]. 王一鵬,王亞文,徐瑞濤,林依丹,李潭清,宋勤葉. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(10)
[2]豬偽狂犬病基因缺失疫苗的制備、安全性、免疫原性、保存期測定及區(qū)域試驗(yàn)[J]. 何啟蓋,方六榮,吳斌,劉正飛,吳美洲,肖少波,金梅林,陳煥春. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2005(10)
[3]偽狂犬病流行現(xiàn)狀及我國應(yīng)采取的防制措施[J]. 童光志,陳煥春. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 1999(01)
本文編號:3070861
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