豬繁殖與呼吸綜合征病毒NADC30-like毒株的分離鑒定
發(fā)布時(shí)間:2021-03-07 22:17
對(duì)河南漯河地區(qū)某養(yǎng)殖場(chǎng)檢出的豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)陽性病料進(jìn)行處理,接種到原代豬肺泡巨噬細(xì)胞中,經(jīng)細(xì)胞盲傳成功分離出1株P(guān)RRSV毒株,命名為HeNLH2017株,并測(cè)定了該分離株在原代豬肺泡巨噬細(xì)胞上的生長(zhǎng)曲線。為進(jìn)一步分析該分離株的遺傳進(jìn)化特點(diǎn),擴(kuò)增測(cè)定了ORF5基因和部分Nsp2基因的核酸序列。核酸同源性分析顯示,該分離毒株ORF5基因和Nsp2序列與NADC30毒株同源性最高,分別為93.4%和93.8%。遺傳進(jìn)化樹分析顯示,該分離株與我國(guó)2013年以來流行的NADC30-like(Lineage1)毒株處于同一進(jìn)化分支。氨基酸序列比對(duì)分析顯示,ORF5基因和Nsp2序列與NADC30-like毒株具有相似的遺傳變異特點(diǎn),且Nsp2序列存在特征性的131個(gè)不連續(xù)的氨基酸缺失。成功分離到1株NADC30-like毒株,有助于進(jìn)一步認(rèn)識(shí)NADC30-like毒株在河南地區(qū)的流行情況和臨床致病特點(diǎn)。
【文章來源】:動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2020,41(03)北大核心
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
圖2 分離毒株鑒定結(jié)果
表2 PRRSV參考毒株信息Table 2 Information of PRRSV reference strains 參考毒株Reference strain 登陸號(hào)Accession no 來源Origin 參考毒株Reference strain 登陸號(hào)Accession no 來源Origin VR-2332 AY150564.1 USA,1995 JL580 KR706343.1 China,2015 CH-1a AY032626.1 China,1996 FJY04 KP860910.1 China,2015 BJ-4 AF331831.1 China,2001 15SC3 KX815428.1 China,2015 RespPRRS MLV AF066183.4 USA,2005 15LN3 KX815425.1 China,2015 JXA1 EF112445.1 China,2007 HN07-1 KX766378.1 China,2016 NADC30 JN654459.1 USA,2008 HN-HW FJ797690.1 China,2016 CH-1R EU807840.1 China,2008 FJWQ16 KX758249.1 China,2016 FJ1402 KX169191.1 China,2014 SCN17 MH078490.1 China,2017 HENXX-1 KU950372.1 China,2014 SD17-38 MH068878.1 China,2017 HENXC-4 KU950371.1 China,2015圖2 分離毒株鑒定結(jié)果
氨基酸序列比對(duì)結(jié)果顯示,HeNLH2017株ORF5基因氨基酸序列有3個(gè)位點(diǎn)不同于其他毒株的氨基酸位點(diǎn),分別為T30、N57和R104 (圖5)。HeNLH2017株Nsp2基因氨基酸序列缺失位置與NADC30-like毒株相比基本一致。與BJ-4、VR-2332等經(jīng)典毒株相比總計(jì)有131個(gè)不連續(xù)的氨基酸缺失,分別位于第322-432位、第483位和第504-522位氨基酸(圖6),說明HeNLH2017株具有NADC30-like毒株特有的分子遺傳標(biāo)志。3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2015-2016年川南地區(qū)豬繁殖與呼吸綜合征病毒遺傳進(jìn)化分析[J]. 周英順,謝波,陳敏,王光西,任定強(qiáng). 西南大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(01)
[2]中國(guó)豬繁殖與呼吸綜合征病毒流行歷史及現(xiàn)狀[J]. 郭振華,陳鑫鑫,李睿,喬松林,郭軍慶,張改平. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(01)
[3]河南地區(qū)NADC30-like PRRSV毒株的增殖特性與遺傳進(jìn)化分析[J]. 王林建,郭振華,喬松林,陳鑫鑫,張改平. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(03)
[4]20142015年河南地區(qū)PRRSV的分子檢測(cè)及NSP2、ORF5基因變異分析[J]. 郭天準(zhǔn),常洪濤,崔丹丹,王新港,周峰,趙軍,楊霞,李永濤,陳陸,王川慶. 病毒學(xué)報(bào). 2016(03)
[5]豬繁殖與呼吸綜合征病毒的遺傳變異與演化[J]. 楊漢春,周磊. 生命科學(xué). 2016(03)
[6]PRRSV廣西分離株GXYL-1403全基因克隆與序列分析[J]. 林思遠(yuǎn),洪紹鋒,黃加濱,韋瑩,陳櫻,黃偉堅(jiān),韋祖樟. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2016(02)
[7]2014年豬病流行情況與2015年流行趨勢(shì)及防控對(duì)策[J]. 楊漢春. 豬業(yè)科學(xué). 2015(02)
[8]2012―2013年豬繁殖與呼吸綜合征病毒河南流行株的分離鑒定及分子流行病學(xué)調(diào)查[J]. 周峰,常洪濤,趙軍,陳陸,王新衛(wèi),劉紅英,姚慧霞,王川慶,楊霞. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2014(09)
[9]豬繁殖與呼吸綜合征診斷方法與疫苗研究進(jìn)展[J]. 郎廣平,郭敏,韓盈盈,馮嬌,李彬,付云云,單悅,高英杰. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2013(06)
博士論文
[1]豬繁殖與呼吸綜合征病毒遺傳變異分析及DNA疫苗的初步研究[D]. 王雅蘭.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
本文編號(hào):3069897
【文章來源】:動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2020,41(03)北大核心
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
圖2 分離毒株鑒定結(jié)果
表2 PRRSV參考毒株信息Table 2 Information of PRRSV reference strains 參考毒株Reference strain 登陸號(hào)Accession no 來源Origin 參考毒株Reference strain 登陸號(hào)Accession no 來源Origin VR-2332 AY150564.1 USA,1995 JL580 KR706343.1 China,2015 CH-1a AY032626.1 China,1996 FJY04 KP860910.1 China,2015 BJ-4 AF331831.1 China,2001 15SC3 KX815428.1 China,2015 RespPRRS MLV AF066183.4 USA,2005 15LN3 KX815425.1 China,2015 JXA1 EF112445.1 China,2007 HN07-1 KX766378.1 China,2016 NADC30 JN654459.1 USA,2008 HN-HW FJ797690.1 China,2016 CH-1R EU807840.1 China,2008 FJWQ16 KX758249.1 China,2016 FJ1402 KX169191.1 China,2014 SCN17 MH078490.1 China,2017 HENXX-1 KU950372.1 China,2014 SD17-38 MH068878.1 China,2017 HENXC-4 KU950371.1 China,2015圖2 分離毒株鑒定結(jié)果
氨基酸序列比對(duì)結(jié)果顯示,HeNLH2017株ORF5基因氨基酸序列有3個(gè)位點(diǎn)不同于其他毒株的氨基酸位點(diǎn),分別為T30、N57和R104 (圖5)。HeNLH2017株Nsp2基因氨基酸序列缺失位置與NADC30-like毒株相比基本一致。與BJ-4、VR-2332等經(jīng)典毒株相比總計(jì)有131個(gè)不連續(xù)的氨基酸缺失,分別位于第322-432位、第483位和第504-522位氨基酸(圖6),說明HeNLH2017株具有NADC30-like毒株特有的分子遺傳標(biāo)志。3 討論
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[7]2014年豬病流行情況與2015年流行趨勢(shì)及防控對(duì)策[J]. 楊漢春. 豬業(yè)科學(xué). 2015(02)
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[9]豬繁殖與呼吸綜合征診斷方法與疫苗研究進(jìn)展[J]. 郎廣平,郭敏,韓盈盈,馮嬌,李彬,付云云,單悅,高英杰. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2013(06)
博士論文
[1]豬繁殖與呼吸綜合征病毒遺傳變異分析及DNA疫苗的初步研究[D]. 王雅蘭.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
本文編號(hào):3069897
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