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豬繁殖與呼吸綜合征病毒NADC30-like毒株的分離鑒定

發(fā)布時(shí)間:2021-03-07 22:17
  對(duì)河南漯河地區(qū)某養(yǎng)殖場(chǎng)檢出的豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)陽性病料進(jìn)行處理,接種到原代豬肺泡巨噬細(xì)胞中,經(jīng)細(xì)胞盲傳成功分離出1株P(guān)RRSV毒株,命名為HeNLH2017株,并測(cè)定了該分離株在原代豬肺泡巨噬細(xì)胞上的生長(zhǎng)曲線。為進(jìn)一步分析該分離株的遺傳進(jìn)化特點(diǎn),擴(kuò)增測(cè)定了ORF5基因和部分Nsp2基因的核酸序列。核酸同源性分析顯示,該分離毒株ORF5基因和Nsp2序列與NADC30毒株同源性最高,分別為93.4%和93.8%。遺傳進(jìn)化樹分析顯示,該分離株與我國(guó)2013年以來流行的NADC30-like(Lineage1)毒株處于同一進(jìn)化分支。氨基酸序列比對(duì)分析顯示,ORF5基因和Nsp2序列與NADC30-like毒株具有相似的遺傳變異特點(diǎn),且Nsp2序列存在特征性的131個(gè)不連續(xù)的氨基酸缺失。成功分離到1株NADC30-like毒株,有助于進(jìn)一步認(rèn)識(shí)NADC30-like毒株在河南地區(qū)的流行情況和臨床致病特點(diǎn)。 

【文章來源】:動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2020,41(03)北大核心

【文章頁數(shù)】:5 頁

【部分圖文】:

豬繁殖與呼吸綜合征病毒NADC30-like毒株的分離鑒定


圖2 分離毒株鑒定結(jié)果

熒光,毒株,來源


表2 PRRSV參考毒株信息Table 2 Information of PRRSV reference strains 參考毒株Reference strain 登陸號(hào)Accession no 來源Origin 參考毒株Reference strain 登陸號(hào)Accession no 來源Origin VR-2332 AY150564.1 USA,1995 JL580 KR706343.1 China,2015 CH-1a AY032626.1 China,1996 FJY04 KP860910.1 China,2015 BJ-4 AF331831.1 China,2001 15SC3 KX815428.1 China,2015 RespPRRS MLV AF066183.4 USA,2005 15LN3 KX815425.1 China,2015 JXA1 EF112445.1 China,2007 HN07-1 KX766378.1 China,2016 NADC30 JN654459.1 USA,2008 HN-HW FJ797690.1 China,2016 CH-1R EU807840.1 China,2008 FJWQ16 KX758249.1 China,2016 FJ1402 KX169191.1 China,2014 SCN17 MH078490.1 China,2017 HENXX-1 KU950372.1 China,2014 SD17-38 MH068878.1 China,2017 HENXC-4 KU950371.1 China,2015圖2 分離毒株鑒定結(jié)果

生長(zhǎng)曲線,生長(zhǎng)曲線,毒株,氨基酸序列


氨基酸序列比對(duì)結(jié)果顯示,HeNLH2017株ORF5基因氨基酸序列有3個(gè)位點(diǎn)不同于其他毒株的氨基酸位點(diǎn),分別為T30、N57和R104 (圖5)。HeNLH2017株Nsp2基因氨基酸序列缺失位置與NADC30-like毒株相比基本一致。與BJ-4、VR-2332等經(jīng)典毒株相比總計(jì)有131個(gè)不連續(xù)的氨基酸缺失,分別位于第322-432位、第483位和第504-522位氨基酸(圖6),說明HeNLH2017株具有NADC30-like毒株特有的分子遺傳標(biāo)志。3 討論

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
[1]豬繁殖與呼吸綜合征病毒遺傳變異分析及DNA疫苗的初步研究[D]. 王雅蘭.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013



本文編號(hào):3069897

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