PCV3貴州流行株基因組分析及其Cap蛋白的原核表達(dá)研究
發(fā)布時(shí)間:2021-03-07 19:34
豬圓環(huán)病毒(PCV)是圓環(huán)病毒科圓環(huán)病毒屬單股環(huán)狀DNA病毒。根據(jù)抗原性和基因型的不同,分為PCV1、PCV2和PCV3三種血清型。PCV1最早于1974年被發(fā)現(xiàn),認(rèn)為是傳代細(xì)胞PK-15培養(yǎng)的污染物,對(duì)豬不具有致病作用,在很多國(guó)家的豬體內(nèi)普遍存在,而不產(chǎn)生臨床癥狀。PCV2常引起以斷奶仔豬多系統(tǒng)衰竭綜合征(PMWS)為代表的豬圓環(huán)病毒相關(guān)疾病(PCVAD),給養(yǎng)殖業(yè)帶來巨大的危害。2016年,美國(guó)的Phan T和Palinski R幾乎同一時(shí)間在不同地區(qū)的農(nóng)場(chǎng)中檢測(cè)出新型圓環(huán)病毒(PCV3)。隨后,PCV3在中國(guó)、韓國(guó)、巴西等10多個(gè)國(guó)家相繼被檢出并報(bào)道,現(xiàn)已成世界性分布,給養(yǎng)豬業(yè)帶來了極大的威脅。貴州省關(guān)于PCV3的流行病學(xué)調(diào)查及相關(guān)基因研究尚未見詳細(xì)報(bào)道。本研究對(duì)貴州省PCV3的流行情況進(jìn)行了分子流行病學(xué)調(diào)查,基于基因組序列進(jìn)行了遺傳進(jìn)化分析,并對(duì)PCV3唯一結(jié)構(gòu)蛋白,即主要免疫原性蛋白Cap進(jìn)行了原核表達(dá)研究,為血清學(xué)檢測(cè)方法ELISA試劑盒的研究奠定了基礎(chǔ)。1.貴州省豬圓環(huán)病毒3型病毒分子流行病學(xué)調(diào)查及流行株基因組分析針對(duì)PCV3 ORF2區(qū)域設(shè)計(jì)特異性引物,應(yīng)用PCR擴(kuò)增技...
【文章來源】:貴州大學(xué)貴州省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:78 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
1份PCV3陽性PCR產(chǎn)物凝膠電泳結(jié)果
3.2 陽性病料統(tǒng)計(jì)與結(jié)果分析通過設(shè)計(jì)特異性 PCV3 檢測(cè)引物進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增,對(duì)貴州省 9 個(gè)地州市 2012年至 2018 年實(shí)驗(yàn)室收集的 427 份樣品進(jìn)行 PCV3 的病原篩查,結(jié)果發(fā)現(xiàn) 427 份樣品中有 91 份樣品 PCV3 呈陽性,樣品總的陽性率為 21.3%(91/427),各地州市收集的樣品中均有檢測(cè)到 PCV3 感染的情況。3.2.1 不同豬群 PCV3 陽性數(shù)和陽性率分析結(jié)果根據(jù)不同豬群(母豬、公豬、仔豬、保育豬、育肥豬、流產(chǎn)胎兒)進(jìn)行分類比較分析,發(fā)現(xiàn) 91 份 PCV3 陽性樣品中不同豬群的陽性數(shù)分別為母豬 11 份、公豬 3 份、仔豬 28 份、保育豬 35 份、育肥豬 12 份、流產(chǎn)胎兒 2 份,陽性率分別為母豬 18.3%(11/60)、公豬 17.6%(3/17)、仔豬 23.3%(28/120)、保育豬25%(35/140)、育肥豬 15%(12/80)、流產(chǎn)胎兒 20%(2/10),其中保育豬的陽性數(shù)和陽性率最高。如圖 2.2 所示。
圖 2.3 不同類型樣品 PCV3 陽性數(shù)和陽性率分析結(jié)果Figure 2.3 Analysis results of positive and positive rate of PCV3 in different types of samples3.2.3 不同年份 PCV3 陽性數(shù)和陽性率分析結(jié)果對(duì)于 PCV3 陽性樣品根據(jù)樣品收集的年份不同進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,發(fā)現(xiàn)不同年份收集的樣品陽性數(shù)分別為 2012~2015 年 10 份、2016 年 15 份、2017 年 31 份、2018年 35 份,各年限的陽性率分別為 2012~2015 年 12.5%(10/80)、2016 年 16.3%(15/92)、2017 年 22.9%(31/135)、2018 年 29.2%(35/120)。結(jié)果顯示隨著時(shí)間的推移,樣品陽性數(shù)和陽性率呈逐年上升,見圖 2.4 所示。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]豬圓環(huán)病毒3型夾心ELISA診斷方法的建立[J]. 于俊楠,陳媛,彭堯舜,金宜順,羅莉妍,陳梅芳. 福建畜牧獸醫(yī). 2019(02)
[2]豫北新發(fā)豬圓環(huán)病毒3型的鑒定及全基因序列分析[J]. 連凱琪,周玲玲,張明亮,張慢,王英杰,宋玉偉,關(guān)現(xiàn)軍. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2019(05)
[3]廣西地區(qū)豬圓環(huán)病毒2型和豬圓環(huán)病毒3型基因型監(jiān)測(cè)及遺傳進(jìn)化分析[J]. 李金鳳,哈卓,辛佳亮,李卓昕,張涵,郭影成,鄭敏,那少龍,魯會(huì)軍,金寧一. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2019(05)
[4]基于PCV3-Cap蛋白間接ELISA檢測(cè)方法的建立及臨床應(yīng)用[J]. 王俊偉,陳芳洲,庫(kù)旭鋼,李暢,何啟蓋. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(02)
[5]豬圓環(huán)病毒3型全基因克隆及遺傳演化分析[J]. 金宏凱,馬宇馳,孫莉,樊瓊,董媛媛,馬鳴瀟. 畜牧與獸醫(yī). 2019(02)
[6]豬圓環(huán)病毒3型7個(gè)ORFs不能誘導(dǎo)PK-15細(xì)胞凋亡[J]. 柳迦鵬,劉鑫宇,胡勝云,王陽,石玉佩,周雙海. 北京農(nóng)學(xué)院學(xué)報(bào). 2019(02)
[7]豬圓環(huán)病毒3型套式PCR檢測(cè)方法的建立及應(yīng)用[J]. 楊永寧,任宜家,申祿昌. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2019(02)
[8]豬圓環(huán)病毒2型和3型雙重PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 徐朋麗,趙宇,張宇,韓昊瑩,張鴻鑫,鄭慧華,田潤(rùn)博,陳紅英. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(01)
[9]豬圓環(huán)病毒3型感染的流行情況與檢測(cè)方法研究進(jìn)展[J]. 劉穎昳,周智,關(guān)婕葳,原霖,侯伯,趙柏林,王傳彬,楊林. 畜牧與獸醫(yī). 2019(01)
[10]豬圓環(huán)病毒3型微滴數(shù)字PCR定量檢測(cè)方法的建立[J]. 石磊,劉雨琦,李麗麗. 現(xiàn)代食品科技. 2019(02)
碩士論文
[1]豬圓環(huán)病毒3型抗體ELISA方法的建立及初步應(yīng)用[D]. 鄭志強(qiáng).河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]豬圓環(huán)病毒3型回顧性調(diào)查與cap蛋白單克隆抗體的研制[D]. 趙冬.揚(yáng)州大學(xué) 2018
[3]我國(guó)14個(gè)省市豬圓環(huán)病毒3型PCR檢測(cè)及部分陽性樣品的全基因組序列測(cè)定與分析[D]. 邢廣源.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[4]攜帶遺傳標(biāo)記的PCV1-2嵌合病毒感染性克隆質(zhì)粒的構(gòu)建[D]. 代振江.貴州大學(xué) 2017
本文編號(hào):3069683
【文章來源】:貴州大學(xué)貴州省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:78 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
1份PCV3陽性PCR產(chǎn)物凝膠電泳結(jié)果
3.2 陽性病料統(tǒng)計(jì)與結(jié)果分析通過設(shè)計(jì)特異性 PCV3 檢測(cè)引物進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增,對(duì)貴州省 9 個(gè)地州市 2012年至 2018 年實(shí)驗(yàn)室收集的 427 份樣品進(jìn)行 PCV3 的病原篩查,結(jié)果發(fā)現(xiàn) 427 份樣品中有 91 份樣品 PCV3 呈陽性,樣品總的陽性率為 21.3%(91/427),各地州市收集的樣品中均有檢測(cè)到 PCV3 感染的情況。3.2.1 不同豬群 PCV3 陽性數(shù)和陽性率分析結(jié)果根據(jù)不同豬群(母豬、公豬、仔豬、保育豬、育肥豬、流產(chǎn)胎兒)進(jìn)行分類比較分析,發(fā)現(xiàn) 91 份 PCV3 陽性樣品中不同豬群的陽性數(shù)分別為母豬 11 份、公豬 3 份、仔豬 28 份、保育豬 35 份、育肥豬 12 份、流產(chǎn)胎兒 2 份,陽性率分別為母豬 18.3%(11/60)、公豬 17.6%(3/17)、仔豬 23.3%(28/120)、保育豬25%(35/140)、育肥豬 15%(12/80)、流產(chǎn)胎兒 20%(2/10),其中保育豬的陽性數(shù)和陽性率最高。如圖 2.2 所示。
圖 2.3 不同類型樣品 PCV3 陽性數(shù)和陽性率分析結(jié)果Figure 2.3 Analysis results of positive and positive rate of PCV3 in different types of samples3.2.3 不同年份 PCV3 陽性數(shù)和陽性率分析結(jié)果對(duì)于 PCV3 陽性樣品根據(jù)樣品收集的年份不同進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,發(fā)現(xiàn)不同年份收集的樣品陽性數(shù)分別為 2012~2015 年 10 份、2016 年 15 份、2017 年 31 份、2018年 35 份,各年限的陽性率分別為 2012~2015 年 12.5%(10/80)、2016 年 16.3%(15/92)、2017 年 22.9%(31/135)、2018 年 29.2%(35/120)。結(jié)果顯示隨著時(shí)間的推移,樣品陽性數(shù)和陽性率呈逐年上升,見圖 2.4 所示。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]豬圓環(huán)病毒3型夾心ELISA診斷方法的建立[J]. 于俊楠,陳媛,彭堯舜,金宜順,羅莉妍,陳梅芳. 福建畜牧獸醫(yī). 2019(02)
[2]豫北新發(fā)豬圓環(huán)病毒3型的鑒定及全基因序列分析[J]. 連凱琪,周玲玲,張明亮,張慢,王英杰,宋玉偉,關(guān)現(xiàn)軍. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2019(05)
[3]廣西地區(qū)豬圓環(huán)病毒2型和豬圓環(huán)病毒3型基因型監(jiān)測(cè)及遺傳進(jìn)化分析[J]. 李金鳳,哈卓,辛佳亮,李卓昕,張涵,郭影成,鄭敏,那少龍,魯會(huì)軍,金寧一. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2019(05)
[4]基于PCV3-Cap蛋白間接ELISA檢測(cè)方法的建立及臨床應(yīng)用[J]. 王俊偉,陳芳洲,庫(kù)旭鋼,李暢,何啟蓋. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(02)
[5]豬圓環(huán)病毒3型全基因克隆及遺傳演化分析[J]. 金宏凱,馬宇馳,孫莉,樊瓊,董媛媛,馬鳴瀟. 畜牧與獸醫(yī). 2019(02)
[6]豬圓環(huán)病毒3型7個(gè)ORFs不能誘導(dǎo)PK-15細(xì)胞凋亡[J]. 柳迦鵬,劉鑫宇,胡勝云,王陽,石玉佩,周雙海. 北京農(nóng)學(xué)院學(xué)報(bào). 2019(02)
[7]豬圓環(huán)病毒3型套式PCR檢測(cè)方法的建立及應(yīng)用[J]. 楊永寧,任宜家,申祿昌. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2019(02)
[8]豬圓環(huán)病毒2型和3型雙重PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 徐朋麗,趙宇,張宇,韓昊瑩,張鴻鑫,鄭慧華,田潤(rùn)博,陳紅英. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(01)
[9]豬圓環(huán)病毒3型感染的流行情況與檢測(cè)方法研究進(jìn)展[J]. 劉穎昳,周智,關(guān)婕葳,原霖,侯伯,趙柏林,王傳彬,楊林. 畜牧與獸醫(yī). 2019(01)
[10]豬圓環(huán)病毒3型微滴數(shù)字PCR定量檢測(cè)方法的建立[J]. 石磊,劉雨琦,李麗麗. 現(xiàn)代食品科技. 2019(02)
碩士論文
[1]豬圓環(huán)病毒3型抗體ELISA方法的建立及初步應(yīng)用[D]. 鄭志強(qiáng).河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]豬圓環(huán)病毒3型回顧性調(diào)查與cap蛋白單克隆抗體的研制[D]. 趙冬.揚(yáng)州大學(xué) 2018
[3]我國(guó)14個(gè)省市豬圓環(huán)病毒3型PCR檢測(cè)及部分陽性樣品的全基因組序列測(cè)定與分析[D]. 邢廣源.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[4]攜帶遺傳標(biāo)記的PCV1-2嵌合病毒感染性克隆質(zhì)粒的構(gòu)建[D]. 代振江.貴州大學(xué) 2017
本文編號(hào):3069683
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