旨在通過轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)獲得簡州大耳羊肌內(nèi)前體脂肪細胞成脂分化前后的差異表達基因,并經(jīng)生物信息學(xué)分析獲得相關(guān)信號通路及可能發(fā)揮作用的關(guān)鍵功能候選基因。本研究以7日齡的健康簡州大耳羊公羊為試驗動物（n=3）,采用膠原酶消化法分離獲得其肌內(nèi)前體脂肪細胞;利用Illumina平臺對肌內(nèi)前體脂肪細胞和誘導(dǎo)分化5 d的肌內(nèi)脂肪細胞cDNA樣品（n=3）進行高通量測序;以|log₂fold change|>0和P<0.05為閾值篩選獲得差異表達基因,并利用clusterProfiler R包對其進行GO功能和KEGG通路富集;最后利用實時熒光定量PCR（quantitative real-time PCR, qRT-PCR）技術(shù)檢測功能候選基因在細胞分化前后的表達量變化。結(jié)果顯示,共獲得差異表達基因7 916個,其中4 143個為表達上調(diào)基因,主要富集到氧化磷酸化、核糖體合成和三羧酸循環(huán)通路等305條通路;3 773個為表達下調(diào)基因,且主要富集到甲狀腺激素信號通路等303條通路;差異基因GO功能注釋中52.8%為生物過程、13.4%是細胞組成和33.8%是分子功能。... 

【文章來源】：畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2020,51(07)北大核心

【文章頁數(shù)】：12 頁

【部分圖文】：

肌內(nèi)脂肪細胞誘導(dǎo)分化形態(tài)圖

RNA凝膠電泳圖

以|log2fold change|>0和P<0.05(即-lg padj>1.301)為篩選條件共得到7 916個差異表達基因,其中4 143個為表達上調(diào)基因,3 773個為表達下調(diào)基因(圖4A)。圖4B則證明了組內(nèi)兩兩樣品的基因表達量近乎趨于一致,說明生物學(xué)重復(fù)的有效;組間樣品則存在顯著的基因表達變化。2.6 差異表達基因的GO功能分析

【參考文獻】：
期刊論文
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[2]基于轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)的山羊下丘腦組織繁殖相關(guān)信號通路及候選基因的篩選[J]. 施會彬,王玉琴,張小輝,吳至博,楊芳.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2019(07)
[3]山羊肌內(nèi)前體脂肪細胞誘導(dǎo)分化過程中內(nèi)參基因的表達穩(wěn)定性分析[J]. 許晴,林森,朱江江,王永,林亞秋.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2018(05)
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[5]簡州大耳羊產(chǎn)肉性能世代選育進展及肉品質(zhì)研究[J]. 俄木曲者,熊朝瑞,范景勝,王永,陳天寶,張紅平.  中國草食動物科學(xué). 2014(03)
[6]絨山羊肌內(nèi)脂肪細胞成熟前后比較轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 杜琛,付紹印,高鴻雁,鄭竹清,孟憲然,阿娜,薩仁,張文廣,李金泉.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2014(05)

博士論文
[1]杜寒雜交羊與小尾寒羊背最長肌全基因組甲基化與轉(zhuǎn)錄組比較分析[D]. 曹陽.吉林大學(xué) 2017

碩士論文
[1]湖羊羔羊不同部位肌肉肌內(nèi)脂肪沉積相關(guān)基因表達的發(fā)育性變化研究[D]. 喬永.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007



本文編號：3060800