旨在通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)獲得簡(jiǎn)州大耳羊肌內(nèi)前體脂肪細(xì)胞成脂分化前后的差異表達(dá)基因,并經(jīng)生物信息學(xué)分析獲得相關(guān)信號(hào)通路及可能發(fā)揮作用的關(guān)鍵功能候選基因。本研究以7日齡的健康簡(jiǎn)州大耳羊公羊?yàn)樵囼?yàn)動(dòng)物（n=3）,采用膠原酶消化法分離獲得其肌內(nèi)前體脂肪細(xì)胞;利用Illumina平臺(tái)對(duì)肌內(nèi)前體脂肪細(xì)胞和誘導(dǎo)分化5 d的肌內(nèi)脂肪細(xì)胞cDNA樣品（n=3）進(jìn)行高通量測(cè)序;以|log₂fold change|>0和P<0.05為閾值篩選獲得差異表達(dá)基因,并利用clusterProfiler R包對(duì)其進(jìn)行GO功能和KEGG通路富集;最后利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR（quantitative real-time PCR, qRT-PCR）技術(shù)檢測(cè)功能候選基因在細(xì)胞分化前后的表達(dá)量變化。結(jié)果顯示,共獲得差異表達(dá)基因7 916個(gè),其中4 143個(gè)為表達(dá)上調(diào)基因,主要富集到氧化磷酸化、核糖體合成和三羧酸循環(huán)通路等305條通路;3 773個(gè)為表達(dá)下調(diào)基因,且主要富集到甲狀腺激素信號(hào)通路等303條通路;差異基因GO功能注釋中52.8%為生物過程、13.4%是細(xì)胞組成和33.8%是分子功能。... 

【文章來源】：畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020,51(07)北大核心

【文章頁數(shù)】：12 頁

【部分圖文】：

肌內(nèi)脂肪細(xì)胞誘導(dǎo)分化形態(tài)圖

RNA凝膠電泳圖

以|log2fold change|>0和P<0.05(即-lg padj>1.301)為篩選條件共得到7 916個(gè)差異表達(dá)基因,其中4 143個(gè)為表達(dá)上調(diào)基因,3 773個(gè)為表達(dá)下調(diào)基因(圖4A)。圖4B則證明了組內(nèi)兩兩樣品的基因表達(dá)量近乎趨于一致,說明生物學(xué)重復(fù)的有效;組間樣品則存在顯著的基因表達(dá)變化。2.6 差異表達(dá)基因的GO功能分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
[1]杜寒雜交羊與小尾寒羊背最長(zhǎng)肌全基因組甲基化與轉(zhuǎn)錄組比較分析[D]. 曹陽.吉林大學(xué) 2017

碩士論文
[1]湖羊羔羊不同部位肌肉肌內(nèi)脂肪沉積相關(guān)基因表達(dá)的發(fā)育性變化研究[D]. 喬永.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007



本文編號(hào)：3060800