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小尾寒羊ADPN和IGF1基因多態(tài)性及其遺傳效應(yīng)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-03-01 22:57
  本研究以259只鄆城小尾寒羊?yàn)檠芯繉?duì)象,利用DNA混合池測(cè)序方法和直接測(cè)序技術(shù)檢測(cè)小尾寒羊脂聯(lián)素基因(ADPN)的內(nèi)含子2和外顯子3、3′UTR區(qū)多態(tài)性及類胰島素生長(zhǎng)因子1(IGF1)基因5′UTR和外顯子2和內(nèi)含子2多態(tài)性;用CodoncodeAligner4.0對(duì)測(cè)序結(jié)果判別純合子和雜合子情況;使用SHEsis軟件分析基因的連鎖不平衡狀態(tài);用Popgen3.2軟件統(tǒng)計(jì)基因突變位點(diǎn)的遺傳多態(tài)性;用Molkin3.0計(jì)算基因型頻率和群體多態(tài)信息含量(PIC)值等值;用SAS9.0軟件分析基因多態(tài)性與繁殖性狀、體尺體型指數(shù)、血液理化性狀間的關(guān)聯(lián)效應(yīng)。結(jié)果表明:(1)所研究群體中,在ADPN基因內(nèi)含子2和外顯子3部分序列中共檢測(cè)到6個(gè)SNPs,即10436位的G/A、10454位的A/G、10660位的T/C、10677位的C/T、10732位的C/T和10753位的C/T,均處于H-W平衡狀態(tài)(P>0.05),經(jīng)過連鎖不平衡分析發(fā)現(xiàn)10436位與10660位處于完全連鎖狀態(tài),10677位與10753位處于完全連鎖狀態(tài);在IGF1基因外顯子2及內(nèi)含子2檢測(cè)到2個(gè)SNPs,即4908C... 

【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省

【文章頁數(shù)】:80 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

小尾寒羊ADPN和IGF1基因多態(tài)性及其遺傳效應(yīng)分析


脂聯(lián)素、IGF1體內(nèi)信號(hào)傳導(dǎo)通路Fig.1-1signaltransductionpathwaysbetweenADPNandIGF1

序列,作用機(jī)制,結(jié)構(gòu)域,外顯子


圖 1-2 脂聯(lián)素調(diào)控通路(作用機(jī)制) 圖 1-3 脂聯(lián)素蛋白結(jié)構(gòu)Fig.1-2 Adiponectin acts through the indicated pathways to Fig 1-3 Adiponectin protein structureinfluence organs involved in male and female reproduction of hunman圖 1-1 :ACC=乙酰輔酶 A 羥化酶;AMPK=磷酸腺苷活化蛋白激酶;IGF=胰島素樣生長(zhǎng)因子;IL=白細(xì)胞MAPK=絲裂原活化蛋白激酶;PPAR=過氧化物酶體增殖物激活受體;SLC2A1 (GLUT1)= 可溶性載體家族 2(促萄糖轉(zhuǎn)運(yùn))的成員; SLC2A3(GLUT3)=可溶性載體家族 2(促進(jìn)葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn))成員 31.3.3.2 ADPN 基因的結(jié)構(gòu)和位置人類脂聯(lián)素基因被定位于染色體 3q27,長(zhǎng)約 17 kb,包含 3 個(gè)外顯子和 2 個(gè)內(nèi)含該基因轉(zhuǎn)錄從 5’端胞嘧啶開始,多肽編碼區(qū)域始于外顯子 2,止于外顯子 3,可編碼個(gè) 244 個(gè)氨基酸的分泌蛋白,有 4 個(gè)結(jié)構(gòu)域組成,分別為:氨基末端的信號(hào)序列、非同源序列、由 22 個(gè) Gly-X-Pro 或 Gly-X-X 重復(fù)單位組成的膠原結(jié)構(gòu)域和羧基端的形結(jié)構(gòu)域(見圖 1-3)。小鼠的脂聯(lián)素基因定位于 16 B3-B4,可編碼由 247 個(gè)氨基成 4 個(gè)區(qū)域,與人類脂聯(lián)素有 83 %的同源性,與補(bǔ)體 C1q 的 C 端有很大程度的同源

序列,蛋白結(jié)構(gòu),結(jié)構(gòu)域


圖 1-2 脂聯(lián)素調(diào)控通路(作用機(jī)制) 圖 1-3 脂聯(lián)素蛋白結(jié)構(gòu)Fig.1-2 Adiponectin acts through the indicated pathways to Fig 1-3 Adiponectin protein structureinfluence organs involved in male and female reproduction of hunman圖 1-1 :ACC=乙酰輔酶 A 羥化酶;AMPK=磷酸腺苷活化蛋白激酶;IGF=胰島素樣生長(zhǎng)因子;IL=白細(xì)胞MAPK=絲裂原活化蛋白激酶;PPAR=過氧化物酶體增殖物激活受體;SLC2A1 (GLUT1)= 可溶性載體家族 2(促萄糖轉(zhuǎn)運(yùn))的成員; SLC2A3(GLUT3)=可溶性載體家族 2(促進(jìn)葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn))成員 31.3.3.2 ADPN 基因的結(jié)構(gòu)和位置人類脂聯(lián)素基因被定位于染色體 3q27,長(zhǎng)約 17 kb,包含 3 個(gè)外顯子和 2 個(gè)內(nèi)含該基因轉(zhuǎn)錄從 5’端胞嘧啶開始,多肽編碼區(qū)域始于外顯子 2,止于外顯子 3,可編碼個(gè) 244 個(gè)氨基酸的分泌蛋白,有 4 個(gè)結(jié)構(gòu)域組成,分別為:氨基末端的信號(hào)序列、非同源序列、由 22 個(gè) Gly-X-Pro 或 Gly-X-X 重復(fù)單位組成的膠原結(jié)構(gòu)域和羧基端的形結(jié)構(gòu)域(見圖 1-3)。小鼠的脂聯(lián)素基因定位于 16 B3-B4,可編碼由 247 個(gè)氨基成 4 個(gè)區(qū)域,與人類脂聯(lián)素有 83 %的同源性,與補(bǔ)體 C1q 的 C 端有很大程度的同源

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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碩士論文
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[2]小尾寒羊FecB基因與體型結(jié)構(gòu)和血液理化性狀的關(guān)聯(lián)性分析[D]. 王勇.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[3]新疆山羊品種KAP13.1和IGF-1基因的遺傳變異及其與經(jīng)濟(jì)性狀的相關(guān)性研究[D]. 方毅.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
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本文編號(hào):3058142

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