為了解大理地區(qū)流行的豬流行性腹瀉病毒（Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV）S基因的核苷酸序列和氨基酸序列與目前商品化疫苗毒株的差異性,從大理市、賓川縣、洱源縣、祥云縣、鶴慶縣、劍川縣等6個(gè)地區(qū)采集疑似患豬流行性腹瀉（Porcine epidemic diarrhea,PED）仔豬的糞便樣品60份,采用RT-PCR方法進(jìn)行PEDV S基因的擴(kuò)增、測(cè)序分析。結(jié)果表明:在60份疑似感染PEDV糞便樣品中,祥云縣、鶴慶縣、劍川縣、洱源縣、大理市、賓川縣PEDV檢測(cè)陽(yáng)性率分別為30%、10%、20%、30%、10%、10%,平均陽(yáng)性率為18.33%。大理地區(qū)檢測(cè)到的PEDV的S基因的核苷酸序列與10個(gè)PEDV疫苗參考毒株同源性在94.6%～98.7%之間,與CV777疫苗株（瑞士）同源性最低（94.6%）,與AJ1102疫苗株（湖北）同源性最高（98.7%）;S基因的氨基酸存在突變,其57位氨基酸N→T,86位氨基酸N→D,107位氨基酸T→K,171位氨基酸F→S,192位氨基酸F→L,214位氨基酸L→V,223位氨基酸V→F。說(shuō)明大理地區(qū)流行的PEDV... 

【文章來(lái)源】：上海畜牧獸醫(yī)通訊. 2020,(06)

【文章頁(yè)數(shù)】：4 頁(yè)

【部分圖文】：

PEDV S基因RT-PCR擴(kuò)增結(jié)果

根據(jù)核苷酸系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)(圖2)分析可以看出:大理地區(qū)流行的毒株Dali 2020與國(guó)內(nèi)外流行的毒株相似。系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)一共有3個(gè)分支,大理地區(qū)流行的毒株與AJ1102、GD-B、XJ-DB2、KPEDV-9、CV777-AF353511、virulent DR13、attenuated DR13等疫苗株都在一個(gè)分支上,特別與AJ1102疫苗株遺傳進(jìn)化最接近;與CV777-JN599150、83P-5、P-5V疫苗株處于不同分支。2.4 S基因推導(dǎo)的氨基酸序列分析結(jié)果

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]我國(guó)部分省份豬流行性腹瀉病毒S基因分子特征及遺傳演化分析[J]. 李嵐,段綱,楊春艷,李曉成.  養(yǎng)殖與飼料. 2020(03)
[2]豬流行性腹瀉的流行特點(diǎn)及流行現(xiàn)狀淺析[J]. 何輝.  農(nóng)民致富之友. 2019(13)
[3]云南部分地區(qū)豬流行性腹瀉病毒S基因克隆與序列分析[J]. 周玉照,張小苗,趙天智,普星星,張以芳.  上海畜牧獸醫(yī)通訊. 2019(01)
[4]豬流行性腹瀉病毒CH/JLDH/2016株分離鑒定及S基因序列分析[J]. 曹東梅,張雙,朱俊輝,郭夢(mèng)茹,陸偉,劉岸,何浩,王開(kāi),胡桂學(xué).  黑龍江畜牧獸醫(yī). 2019(01)



本文編號(hào)：3057690