基于SSR標(biāo)記建立家兔種質(zhì)資源遺傳評(píng)價(jià)方法
發(fā)布時(shí)間:2021-02-28 11:02
目前我國(guó)現(xiàn)有家兔品種很多,但因缺乏優(yōu)良家兔種質(zhì)資源遺傳評(píng)價(jià)的技術(shù)標(biāo)準(zhǔn),出現(xiàn)了優(yōu)良品種保種效果欠佳等系列問題。微衛(wèi)星(SSR)標(biāo)記在不同家兔群體遺傳結(jié)構(gòu)中已經(jīng)有一些應(yīng)用,但在標(biāo)記數(shù)選用上尚存在著較大的隨機(jī)性,且樣本容量大小缺乏明確的標(biāo)準(zhǔn)。為了有效地保護(hù)家兔的種質(zhì)資源,開發(fā)、完善種質(zhì)評(píng)價(jià)的各種遺傳指標(biāo),本研究選取45個(gè)SSR標(biāo)記,通過設(shè)立樣本量和標(biāo)記數(shù)的不同梯度,分析對(duì)群體遺傳參數(shù)的影響,建立了家兔種質(zhì)資源遺傳評(píng)價(jià)方法,并以不同世代的家兔模型,利用該評(píng)價(jià)方法檢測(cè)保種效果。該方法不僅為家兔優(yōu)良種質(zhì)的評(píng)估與建立提供一種快速、有效的參考,還為開發(fā)家兔優(yōu)良種質(zhì)評(píng)價(jià)提供技術(shù)和標(biāo)準(zhǔn),促進(jìn)我國(guó)家兔產(chǎn)業(yè)健康穩(wěn)定、可持續(xù)發(fā)展。主要研究結(jié)果如下:1、利用45個(gè)SSR標(biāo)記分析新西蘭白兔種群的遺傳多樣性,尋找SSR標(biāo)記最佳組合。在樣本量和標(biāo)記數(shù)上設(shè)置不同梯度,分析各種遺傳參數(shù)(平均有效等位基因數(shù)Ae、平均期望雜合度ExpHe、平均多態(tài)信息含量PIC)變化趨勢(shì)。首先對(duì)45個(gè)SSR位點(diǎn)進(jìn)行哈迪-溫伯格平衡檢驗(yàn),結(jié)果發(fā)現(xiàn)其中顯著或極顯著偏離平衡的位點(diǎn)有33個(gè);通過連鎖不平衡方法計(jì)算有效群體大小為56.5。進(jìn)一步分析得出...
【文章來源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:60 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
英文縮寫詞匯表
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 我國(guó)家兔種質(zhì)資源基本概況
1.1 兩引入家兔品種概述
1.2 我國(guó)家兔種質(zhì)資源概況
2 家兔種質(zhì)資源遺傳多樣性研究方法
2.1 形態(tài)學(xué)研究方法
2.2 細(xì)胞學(xué)研究方法
2.3 生化標(biāo)記研究方法
2.4 分子標(biāo)記研究方法
3 SSR標(biāo)記及其在家兔研究中的進(jìn)展
3.1 SSR的發(fā)展歷史及原理
3.2 SSR標(biāo)記的優(yōu)缺點(diǎn)
3.3 SSR在家兔遺傳育種研究中的應(yīng)用
3.4 利用SSR建立家兔遺傳評(píng)價(jià)方法
4 家兔種質(zhì)資源合理利用方法
4.1 促進(jìn)家兔種質(zhì)資源合理利用
4.2 加強(qiáng)家兔種質(zhì)資源研究
5 本研究的目的與意義
第二章 遺傳評(píng)價(jià)方法的構(gòu)建
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 試驗(yàn)方法
1.3 軟件分析與數(shù)據(jù)處理
1.4 數(shù)據(jù)分析
1.5 遺傳評(píng)價(jià)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 基因組DNA提取及PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)結(jié)果
2.2 毛細(xì)管電泳檢測(cè)SSR熒光標(biāo)記多樣性
2.3 Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)和有效群體大小計(jì)算
2.4 不同樣本量下新西蘭白兔遺傳多樣性統(tǒng)計(jì)分析
2.5 不同標(biāo)記位點(diǎn)數(shù)下新西蘭白兔遺傳多樣性統(tǒng)計(jì)分析
2.6 最佳標(biāo)記數(shù)下不同組合遺傳多樣性統(tǒng)計(jì)分析
3 討論
3.1 群體遺傳多樣性與樣本量、標(biāo)記數(shù)的關(guān)系
3.2 所需樣本量的優(yōu)化
3.3 標(biāo)記位點(diǎn)數(shù)的優(yōu)化
3.4 家兔最佳標(biāo)記位點(diǎn)組合的確定
4 小結(jié)
第三章 評(píng)價(jià)方法監(jiān)測(cè)與應(yīng)用
1 材料方法
1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
1.2 試驗(yàn)設(shè)備與試劑
1.3 試驗(yàn)方法
1.4 數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)處理
1.5 家兔遺傳評(píng)價(jià)體系監(jiān)測(cè)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 基因組DNA提取及PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)結(jié)果
2.2 毛細(xì)管電泳檢測(cè)SSR熒光標(biāo)記多樣性
2.3 家兔遺傳評(píng)價(jià)方法監(jiān)測(cè)
2.4 家兔遺傳評(píng)價(jià)方法應(yīng)用
3 討論
3.1 家兔評(píng)價(jià)方法監(jiān)測(cè)評(píng)價(jià)
3.2 家兔保種效果評(píng)價(jià)
4 小結(jié)
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表學(xué)術(shù)論文目錄
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]萬(wàn)載黑兔微衛(wèi)星標(biāo)記的遺傳多樣性分析[J]. 黃江南,劉林秀,季華員,謝金防,周泉勇,熊立根,韋啟鵬. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2016(04)
[2]WHBE兔、日本大耳白兔和新西蘭兔遺傳多樣性的RAPD分析[J]. 蔡月琴,陳民利,潘永明,朱亮,徐劍欽,屠玨,王德軍,徐孝平. 中國(guó)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)報(bào). 2014(04)
[3]實(shí)驗(yàn)兔三個(gè)封閉群微衛(wèi)星DNA多態(tài)性遺傳分析[J]. 高子淇,劉先菊,榮蓉,高進(jìn)權(quán),佟巍,張麗芳,王艷蓉,向志光,劉云波. 中國(guó)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)報(bào). 2012(02)
[4]縊蟶群體微衛(wèi)星分析中樣本量對(duì)遺傳多樣性指標(biāo)的影響[J]. 牛東紅,陳慧,林國(guó)文,李家樂. 海洋科學(xué)進(jìn)展. 2010(02)
[5]草魚種群SSR分析中樣本量及標(biāo)記數(shù)量對(duì)遺傳多度的影響[J]. 李鷗,趙瑩瑩,郭娜,魯翠云,孫效文. 動(dòng)物學(xué)研究. 2009(02)
[6]德化黑毛福建兔的保種與利用[J]. 賴玉瓊. 中國(guó)養(yǎng)兔雜志. 2008(09)
[7]樣本容量對(duì)養(yǎng)殖群體內(nèi)主要遺傳結(jié)構(gòu)分析參數(shù)的影響[J]. 魯翠云,金萬(wàn)昆,孫效文,李大宇,朱曉東,馬海濤,于東梅,楊建新. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2008(05)
[8]家兔遺傳多樣性及系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系的微衛(wèi)星分析[J]. 孫紅梅,邢秀梅,榮敏,叢波. 生物多樣性. 2008(05)
[9]利用微衛(wèi)星分析中國(guó)家兔的遺傳多樣性[J]. 榮敏,樊兆斌,馬雪峰,邢秀梅,孫紅梅,趙家平,楊福合. 家畜生態(tài)學(xué)報(bào). 2008(01)
[10]洛陽(yáng)地區(qū)八點(diǎn)黑獺兔染色體核型與G-帶研究[J]. 趙淑娟,薛幫群,龐有志,董發(fā)明,楊又兵. 中國(guó)養(yǎng)兔雜志. 2007(06)
碩士論文
[1]微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)鯉的兩個(gè)育成品種遺傳背景分析和遺傳評(píng)價(jià)體系建立[D]. 趙新春.上海海洋大學(xué) 2015
[2]利用AFLP和SSR標(biāo)記研究六個(gè)肉兔群體的遺傳多樣性[D]. 東金華.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[3]利用微衛(wèi)星標(biāo)記分析中國(guó)家兔的遺傳多樣性[D]. 榮敏.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2006
[4]利用微衛(wèi)星分析家兔遺傳多樣性[D]. 李鷹.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
本文編號(hào):3055757
【文章來源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
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ABSTRACT
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第一章 文獻(xiàn)綜述
1 我國(guó)家兔種質(zhì)資源基本概況
1.1 兩引入家兔品種概述
1.2 我國(guó)家兔種質(zhì)資源概況
2 家兔種質(zhì)資源遺傳多樣性研究方法
2.1 形態(tài)學(xué)研究方法
2.2 細(xì)胞學(xué)研究方法
2.3 生化標(biāo)記研究方法
2.4 分子標(biāo)記研究方法
3 SSR標(biāo)記及其在家兔研究中的進(jìn)展
3.1 SSR的發(fā)展歷史及原理
3.2 SSR標(biāo)記的優(yōu)缺點(diǎn)
3.3 SSR在家兔遺傳育種研究中的應(yīng)用
3.4 利用SSR建立家兔遺傳評(píng)價(jià)方法
4 家兔種質(zhì)資源合理利用方法
4.1 促進(jìn)家兔種質(zhì)資源合理利用
4.2 加強(qiáng)家兔種質(zhì)資源研究
5 本研究的目的與意義
第二章 遺傳評(píng)價(jià)方法的構(gòu)建
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 試驗(yàn)方法
1.3 軟件分析與數(shù)據(jù)處理
1.4 數(shù)據(jù)分析
1.5 遺傳評(píng)價(jià)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 基因組DNA提取及PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)結(jié)果
2.2 毛細(xì)管電泳檢測(cè)SSR熒光標(biāo)記多樣性
2.3 Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)和有效群體大小計(jì)算
2.4 不同樣本量下新西蘭白兔遺傳多樣性統(tǒng)計(jì)分析
2.5 不同標(biāo)記位點(diǎn)數(shù)下新西蘭白兔遺傳多樣性統(tǒng)計(jì)分析
2.6 最佳標(biāo)記數(shù)下不同組合遺傳多樣性統(tǒng)計(jì)分析
3 討論
3.1 群體遺傳多樣性與樣本量、標(biāo)記數(shù)的關(guān)系
3.2 所需樣本量的優(yōu)化
3.3 標(biāo)記位點(diǎn)數(shù)的優(yōu)化
3.4 家兔最佳標(biāo)記位點(diǎn)組合的確定
4 小結(jié)
第三章 評(píng)價(jià)方法監(jiān)測(cè)與應(yīng)用
1 材料方法
1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
1.2 試驗(yàn)設(shè)備與試劑
1.3 試驗(yàn)方法
1.4 數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)處理
1.5 家兔遺傳評(píng)價(jià)體系監(jiān)測(cè)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 基因組DNA提取及PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)結(jié)果
2.2 毛細(xì)管電泳檢測(cè)SSR熒光標(biāo)記多樣性
2.3 家兔遺傳評(píng)價(jià)方法監(jiān)測(cè)
2.4 家兔遺傳評(píng)價(jià)方法應(yīng)用
3 討論
3.1 家兔評(píng)價(jià)方法監(jiān)測(cè)評(píng)價(jià)
3.2 家兔保種效果評(píng)價(jià)
4 小結(jié)
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表學(xué)術(shù)論文目錄
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]萬(wàn)載黑兔微衛(wèi)星標(biāo)記的遺傳多樣性分析[J]. 黃江南,劉林秀,季華員,謝金防,周泉勇,熊立根,韋啟鵬. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2016(04)
[2]WHBE兔、日本大耳白兔和新西蘭兔遺傳多樣性的RAPD分析[J]. 蔡月琴,陳民利,潘永明,朱亮,徐劍欽,屠玨,王德軍,徐孝平. 中國(guó)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)報(bào). 2014(04)
[3]實(shí)驗(yàn)兔三個(gè)封閉群微衛(wèi)星DNA多態(tài)性遺傳分析[J]. 高子淇,劉先菊,榮蓉,高進(jìn)權(quán),佟巍,張麗芳,王艷蓉,向志光,劉云波. 中國(guó)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)報(bào). 2012(02)
[4]縊蟶群體微衛(wèi)星分析中樣本量對(duì)遺傳多樣性指標(biāo)的影響[J]. 牛東紅,陳慧,林國(guó)文,李家樂. 海洋科學(xué)進(jìn)展. 2010(02)
[5]草魚種群SSR分析中樣本量及標(biāo)記數(shù)量對(duì)遺傳多度的影響[J]. 李鷗,趙瑩瑩,郭娜,魯翠云,孫效文. 動(dòng)物學(xué)研究. 2009(02)
[6]德化黑毛福建兔的保種與利用[J]. 賴玉瓊. 中國(guó)養(yǎng)兔雜志. 2008(09)
[7]樣本容量對(duì)養(yǎng)殖群體內(nèi)主要遺傳結(jié)構(gòu)分析參數(shù)的影響[J]. 魯翠云,金萬(wàn)昆,孫效文,李大宇,朱曉東,馬海濤,于東梅,楊建新. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2008(05)
[8]家兔遺傳多樣性及系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系的微衛(wèi)星分析[J]. 孫紅梅,邢秀梅,榮敏,叢波. 生物多樣性. 2008(05)
[9]利用微衛(wèi)星分析中國(guó)家兔的遺傳多樣性[J]. 榮敏,樊兆斌,馬雪峰,邢秀梅,孫紅梅,趙家平,楊福合. 家畜生態(tài)學(xué)報(bào). 2008(01)
[10]洛陽(yáng)地區(qū)八點(diǎn)黑獺兔染色體核型與G-帶研究[J]. 趙淑娟,薛幫群,龐有志,董發(fā)明,楊又兵. 中國(guó)養(yǎng)兔雜志. 2007(06)
碩士論文
[1]微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)鯉的兩個(gè)育成品種遺傳背景分析和遺傳評(píng)價(jià)體系建立[D]. 趙新春.上海海洋大學(xué) 2015
[2]利用AFLP和SSR標(biāo)記研究六個(gè)肉兔群體的遺傳多樣性[D]. 東金華.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[3]利用微衛(wèi)星標(biāo)記分析中國(guó)家兔的遺傳多樣性[D]. 榮敏.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2006
[4]利用微衛(wèi)星分析家兔遺傳多樣性[D]. 李鷹.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
本文編號(hào):3055757
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