試驗(yàn)旨在探究晉汾白豬載脂蛋白A5（apolipoprotein A5,ApoA5）基因的單倍型與體重和肉質(zhì)性狀的相關(guān)性。選取180頭晉汾白豬為研究群體,利用PCR技術(shù)檢測(cè)ApoA5基因的單核苷酸多態(tài)性（single nucleotide polymorphism,SNP）,并采用Haploview軟件分析這些SNP位點(diǎn)的連鎖不平衡程度;篩選非完全連鎖的SNP位點(diǎn),構(gòu)建不同的ApoA5基因單倍型,統(tǒng)計(jì)不同單倍型的基因頻率,并通過(guò)SPSS軟件分析不同ApoA5基因單倍型與晉汾白豬體重和肉質(zhì)性狀的相關(guān)性,鑒定優(yōu)良性狀的ApoA5基因單倍型。結(jié)果顯示,晉汾白豬ApoA5基因共檢測(cè)到21個(gè)SNPs位點(diǎn),其中5個(gè)完全連鎖單倍型塊,分別包含5、2、3、4和2個(gè)SNPs位點(diǎn);另外10個(gè)非完全連鎖的標(biāo)簽SNP組合成不同的ApoA5基因單倍型,其中Hap 1的基因頻率最高,達(dá)到46.7%,遠(yuǎn)高于其他單倍型;ApoA5基因單倍型與晉汾白豬的初生重、斷奶重、6月齡體重、肌內(nèi)脂肪含量、剪切力和滴水損失均具有明顯的相關(guān)性,而與pH_{24 h}沒(méi)有明顯的相關(guān)性;ApoA5基因Hap 11晉汾白豬的... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2020,47(11)北大核心

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【部分圖文】：

引物P2(A)和P6(B)的PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖

表2 SNPs檢測(cè)結(jié)果Table 2 Detection results of SNPs SNPs 位點(diǎn)Loci 變化Change 位置Area SNPs 位點(diǎn)Loci 變化Change 位置Area SNP 1 -2247 T>A 顛換 5′-UTR SNP 12 174 G>T 顛換 5′-UTR SNP 2 -2225 C>T 轉(zhuǎn)換 5′-UTR SNP 13 873 A>G 轉(zhuǎn)換 內(nèi)含子2 SNP 3 -2219 G>T 顛換 5′-UTR SNP 14 914 C>T 轉(zhuǎn)換 內(nèi)含子2 SNP 4 -2130 T>C 轉(zhuǎn)換 5′-UTR SNP 15 1018 C>T 轉(zhuǎn)換 內(nèi)含子2 SNP 5 -2125 T>C 轉(zhuǎn)換 5′-UTR SNP 16 2280 T>C 轉(zhuǎn)換 外顯子3 SNP 6 -2066 C>T 轉(zhuǎn)換 5′-UTR SNP 17 2281 A>T 顛換 外顯子3 SNP 7 -1051 A>G 轉(zhuǎn)換 5′-UTR SNP 18 2316 C>T 轉(zhuǎn)換 外顯子3 SNP 8 -568 A>T 顛換 5′-UTR SNP 19 2394 G>A 轉(zhuǎn)換 外顯子3 SNP 9 -530 T>C 轉(zhuǎn)換 5′-UTR SNP 20 2802 C>T 轉(zhuǎn)換 3′-UTR SNP 10 -529 C>G 顛換 5′-UTR SNP 21 2842 T>G 顛換 3′-UTR SNP 11 153 G>C 顛換 5′-UTR表3 單倍型的標(biāo)簽SNPsTable 3 Tag SNPs of haplotypes 單倍型Haplotypes 標(biāo)簽SNPsTag SNPs 數(shù)量Number/頭 頻率Frequency Hap 1 GCAATCGCTT 84 0.467 Hap 2 GCAACCGCTT 10 0.056 Hap 3 GTGTCGGCTT 9 0.050 Hap 4 GTATTCGCTT 9 0.050 Hap 5 TCGATCCCTT 7 0.039 Hap 6 GCAACGGCTT 6 0.033 Hap 7 GCAATCGTTT 6 0.033 Hap 8 GTAATCGCTT 5 0.028 Hap 9 GCATTCGCTT 5 0.028 Hap 10 GTGACGGCTT 4 0.022 Hap 11 TCGACCCTCT 4 0.022 Hap 12 GCGTCGCTCT 4 0.022 Hap 13 TCAACCCTCG 3 0.017 Hap 14 GCAACGGTCG 3 0.017 合計(jì) Total 159 0.883

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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