河南奶山羊線粒體D-loop區(qū)遺傳多態(tài)性和遺傳分化研究
發(fā)布時(shí)間:2021-02-09 02:38
為了解河南奶山羊遺傳資源現(xiàn)狀,對(duì)河南奶山羊、薩能奶山羊、關(guān)中奶山羊和伏牛白山羊線粒體DNA D-loop區(qū)全序列遺傳多態(tài)性和遺傳關(guān)系進(jìn)行分析。結(jié)果表明,共存在16種單倍型,各品種單倍型多樣度范圍為0.391~0.814,核苷酸多樣度的范圍為0.000 35~0.004 64,核苷酸平均差異數(shù)范圍為9.333 33~13.666 67,核苷酸岐異度變異范圍為0.008 33~0.012 19,遺傳分化系數(shù)范圍為0.135 65~0.360 10,固定系數(shù)范圍為0.583 23~0.935 50。山羊品種間系統(tǒng)發(fā)育樹表明,河南奶山羊首先與伏牛白山羊聚為一支,其次河南奶山羊與薩能奶山羊聚類,最后與關(guān)中奶山羊聚類。系統(tǒng)發(fā)育樹聚類結(jié)果與遺傳距離分析、遺傳分化分析結(jié)果相符,從遺傳角度證實(shí)了河南奶山羊是以薩能奶山羊?yàn)楦副?以河南地方品種為母本經(jīng)雜交選育而成。
【文章來源】:河南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,54(04)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【部分圖文】:
4個(gè)山羊品種D-loop序列PCR結(jié)果檢測(cè)
表1 4個(gè)山羊品種遺傳多樣度及單倍型Table 1 Genetic diversity of four goat breeds 品種 Breed 單倍型數(shù)目No. of h 單倍型h 單倍型多樣度±標(biāo)準(zhǔn)差Hd±SD 核苷酸多樣度±標(biāo)準(zhǔn)差Pi±SD 核苷酸平均差異數(shù)k 中性檢驗(yàn)Tajima’s D 顯著性Significance 河南奶山羊Henan dairy goat 9 Hap 4~12 0.814±0.045 0.004 64±0.000 32 5.219 0.190 07 P<0.05 薩能奶山羊Saanen dairy goat 3 Hap 1~3 0.594±0.054 0.002 93±0.000 18 3.290 2.359 87 P>0.1 關(guān)中奶山羊Guanzhong dairy goat 2 Hap 13~14 0.429±0.169 0.001 14±0.000 45 1.286 0.457 66 P>0.1 伏牛白山羊Funiu white goat 2 Hap 15~16 0.391±0.091 0.000 35±0.000 08 0.391 0.776 32 P>0.1 總和Total 16 Hap 1~16 0.903±0.013 0.007 50±0.000 24 8.402 0.086 86 P>0.12.3 基因流與遺傳分化分析
4個(gè)山羊品種間系統(tǒng)發(fā)育樹(圖3)表明,河南奶山羊首先與伏牛白山羊聚為一支,其遺傳距離為0.008 553 6;接著河南奶山羊與薩能奶山羊聚類,其遺傳距離為0.009 136 8;最后與關(guān)中奶山羊聚類,其遺傳距離為0.010 649 1。系統(tǒng)發(fā)育樹聚類結(jié)果與遺傳距離分析結(jié)果相符(表3),證明了河南奶山羊與伏牛白山羊遺傳關(guān)系最近,接著是薩能奶山羊,離關(guān)中奶山羊最遠(yuǎn)。該結(jié)果與遺傳分化分析結(jié)果一致。3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于線粒體D-loop序列的長(zhǎng)江口中華鱘幼魚遺傳多樣性分析[J]. 孫麗婷,趙峰,張濤,紀(jì)嚴(yán),莊平. 海洋漁業(yè). 2019(01)
[2]基于線粒體標(biāo)記的淮南麻黃雞遺傳結(jié)構(gòu)及其遺傳多樣性分析[J]. 黃勝海,賈曉旭,陸俊賢,唐修君,樊艷鳳,葛慶聯(lián),高玉時(shí). 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(03)
[3]云南山羊線粒體DNA遺傳多樣性與聚類分析[J]. 王國(guó)華,郝榮超,楊國(guó)忠. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2016(09)
[4]川渝黔地區(qū)山羊起源于A和B兩母系遺傳譜系[J]. 蔡欣,澤讓東科,茍興能,董紹森,劉暢,王雪. 四川大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2012(04)
[5]新批準(zhǔn)的西南地區(qū)5個(gè)山羊遺傳資源mtDNA D-loop遺傳多樣性與親緣關(guān)系研究[J]. 趙中權(quán),劉小艷,張旭剛,李周權(quán),趙永聚,張家驊. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2011(19)
[6]黃河下游同域山羊種群mtDNA D-環(huán)多態(tài)性及系統(tǒng)發(fā)育[J]. 侯磊,王建民,李培培,李玨,邢鳳. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2008(12)
[7]貴州山羊遺傳多樣性及其起源研究[J]. 楊忠誠(chéng),吳蕓,滕尚輝,劉若余,毛鳳顯. 山地農(nóng)業(yè)生物學(xué)報(bào). 2006(05)
[8]4個(gè)引進(jìn)山羊品種mtDNA控制區(qū)序列變異和系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系研究[J]. 張紅平,李利,李學(xué)偉. 中國(guó)畜牧雜志. 2006(09)
[9]動(dòng)物線粒體DNA多態(tài)性的研究概況[J]. 張亞平,施立明. 動(dòng)物學(xué)研究. 1992(03)
博士論文
[1]中國(guó)11個(gè)山羊品種遺傳多樣性與起源分化研究[D]. 王杰.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2007
[2]采用mtDNA序列研究中國(guó)家養(yǎng)山羊的遺傳多樣性與起源分化[D]. 張紅平.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
碩士論文
[1]中國(guó)奶山羊線粒體DNA D-loop區(qū)遺傳多樣性與起源進(jìn)化研究[D]. 皮秀霜.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]川渝黔6個(gè)山羊品種mtDNA D-loop遺傳多樣性與系統(tǒng)進(jìn)化研究[D]. 劉小艷.西南大學(xué) 2008
[3]中國(guó)部分家養(yǎng)山羊mtDNA D環(huán)區(qū)遺傳多樣性與進(jìn)化[D]. 郝榮超.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2008
本文編號(hào):3024907
【文章來源】:河南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,54(04)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【部分圖文】:
4個(gè)山羊品種D-loop序列PCR結(jié)果檢測(cè)
表1 4個(gè)山羊品種遺傳多樣度及單倍型Table 1 Genetic diversity of four goat breeds 品種 Breed 單倍型數(shù)目No. of h 單倍型h 單倍型多樣度±標(biāo)準(zhǔn)差Hd±SD 核苷酸多樣度±標(biāo)準(zhǔn)差Pi±SD 核苷酸平均差異數(shù)k 中性檢驗(yàn)Tajima’s D 顯著性Significance 河南奶山羊Henan dairy goat 9 Hap 4~12 0.814±0.045 0.004 64±0.000 32 5.219 0.190 07 P<0.05 薩能奶山羊Saanen dairy goat 3 Hap 1~3 0.594±0.054 0.002 93±0.000 18 3.290 2.359 87 P>0.1 關(guān)中奶山羊Guanzhong dairy goat 2 Hap 13~14 0.429±0.169 0.001 14±0.000 45 1.286 0.457 66 P>0.1 伏牛白山羊Funiu white goat 2 Hap 15~16 0.391±0.091 0.000 35±0.000 08 0.391 0.776 32 P>0.1 總和Total 16 Hap 1~16 0.903±0.013 0.007 50±0.000 24 8.402 0.086 86 P>0.12.3 基因流與遺傳分化分析
4個(gè)山羊品種間系統(tǒng)發(fā)育樹(圖3)表明,河南奶山羊首先與伏牛白山羊聚為一支,其遺傳距離為0.008 553 6;接著河南奶山羊與薩能奶山羊聚類,其遺傳距離為0.009 136 8;最后與關(guān)中奶山羊聚類,其遺傳距離為0.010 649 1。系統(tǒng)發(fā)育樹聚類結(jié)果與遺傳距離分析結(jié)果相符(表3),證明了河南奶山羊與伏牛白山羊遺傳關(guān)系最近,接著是薩能奶山羊,離關(guān)中奶山羊最遠(yuǎn)。該結(jié)果與遺傳分化分析結(jié)果一致。3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于線粒體D-loop序列的長(zhǎng)江口中華鱘幼魚遺傳多樣性分析[J]. 孫麗婷,趙峰,張濤,紀(jì)嚴(yán),莊平. 海洋漁業(yè). 2019(01)
[2]基于線粒體標(biāo)記的淮南麻黃雞遺傳結(jié)構(gòu)及其遺傳多樣性分析[J]. 黃勝海,賈曉旭,陸俊賢,唐修君,樊艷鳳,葛慶聯(lián),高玉時(shí). 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(03)
[3]云南山羊線粒體DNA遺傳多樣性與聚類分析[J]. 王國(guó)華,郝榮超,楊國(guó)忠. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2016(09)
[4]川渝黔地區(qū)山羊起源于A和B兩母系遺傳譜系[J]. 蔡欣,澤讓東科,茍興能,董紹森,劉暢,王雪. 四川大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2012(04)
[5]新批準(zhǔn)的西南地區(qū)5個(gè)山羊遺傳資源mtDNA D-loop遺傳多樣性與親緣關(guān)系研究[J]. 趙中權(quán),劉小艷,張旭剛,李周權(quán),趙永聚,張家驊. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2011(19)
[6]黃河下游同域山羊種群mtDNA D-環(huán)多態(tài)性及系統(tǒng)發(fā)育[J]. 侯磊,王建民,李培培,李玨,邢鳳. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2008(12)
[7]貴州山羊遺傳多樣性及其起源研究[J]. 楊忠誠(chéng),吳蕓,滕尚輝,劉若余,毛鳳顯. 山地農(nóng)業(yè)生物學(xué)報(bào). 2006(05)
[8]4個(gè)引進(jìn)山羊品種mtDNA控制區(qū)序列變異和系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系研究[J]. 張紅平,李利,李學(xué)偉. 中國(guó)畜牧雜志. 2006(09)
[9]動(dòng)物線粒體DNA多態(tài)性的研究概況[J]. 張亞平,施立明. 動(dòng)物學(xué)研究. 1992(03)
博士論文
[1]中國(guó)11個(gè)山羊品種遺傳多樣性與起源分化研究[D]. 王杰.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2007
[2]采用mtDNA序列研究中國(guó)家養(yǎng)山羊的遺傳多樣性與起源分化[D]. 張紅平.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
碩士論文
[1]中國(guó)奶山羊線粒體DNA D-loop區(qū)遺傳多樣性與起源進(jìn)化研究[D]. 皮秀霜.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]川渝黔6個(gè)山羊品種mtDNA D-loop遺傳多樣性與系統(tǒng)進(jìn)化研究[D]. 劉小艷.西南大學(xué) 2008
[3]中國(guó)部分家養(yǎng)山羊mtDNA D環(huán)區(qū)遺傳多樣性與進(jìn)化[D]. 郝榮超.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2008
本文編號(hào):3024907
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/3024907.html
最近更新
教材專著