沙門菌是家禽生產(chǎn)系統(tǒng)中報(bào)道最多的食源性致病菌之一,受污染的家禽和家禽產(chǎn)品被認(rèn)為是人類沙門菌病的重要來源。沙門菌存在于家禽生產(chǎn)的不同階段,有些血清型可以在腸道定植并遷移至其他器官,如輸卵管、消化道等,并且可在環(huán)境中持續(xù)存在,從而導(dǎo)致垂直傳播和水平傳播,沿生產(chǎn)線污染食品工業(yè)。因此,了解沙門菌在家禽生產(chǎn)過程的分布變化及其特征,對減少沙門菌傳播的有效干預(yù)措施等研究極為重要。本研究聚焦某禽蛋全產(chǎn)業(yè)鏈企業(yè),通過對不同環(huán)節(jié)沙門菌流行病學(xué)調(diào)查和分子分型等研究,揭示該生產(chǎn)鏈沙門菌的流行規(guī)律、耐藥性和遺傳特征,旨在探明沙門菌沿蛋雞生產(chǎn)鏈的傳播方式及關(guān)鍵控制點(diǎn),為家禽產(chǎn)業(yè)中沙門菌的防控提供必要的數(shù)據(jù)支撐。1蛋雞生產(chǎn)鏈中沙門菌的流行狀況及其耐藥性分析本研究選擇江蘇地區(qū)某禽蛋全產(chǎn)業(yè)鏈企業(yè),于2017年9月至2019年11月采集703份種雞血清和1,249份病原學(xué)樣品。采樣環(huán)節(jié)包括飼料場、養(yǎng)殖場、孵化中心、集蛋中心和蛋業(yè)公司,樣品類型為飼料原材料、弱雛、病死雞、雞蛋、死亡胚蛋、蛋制品以及環(huán)境樣品。抗體檢測結(jié)果顯示,血清中沙門菌O9抗體平均陽性率為22.2%。病原學(xué)樣品中有132份呈沙門菌陽性,平均分離率為10.6... 

【文章來源】：揚(yáng)州大學(xué)江蘇省

【文章頁數(shù)】：61 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖２－ｌ?３５株腸炎沙門菌ＰＦＧＥ聚類結(jié)果??Ｆｉｇ．?２－ｌ?Ｐｕｌｓｅｄ－ｆｉｅｌｄ?ｇｅｌ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ?（ＰＦＧＥ）?ｐ?

ＡＬ?，ＶＭＰ?ＡＭＣ??ＨＨＵ?ＹＺＨ４６７?Ｓｉｌｌ?ＴＥＴ?ＳＴＲ?ＮＡＬ?ＡＭＰ??■■■■?ＹＺｌ?１４６８?ＳＴ?１１?ＴＥＴ?ＳＴＲ?ＮＡＬ?ＡＭＰ??Ｙ２１１?＂６６?ＳＴＵ?ＴＥＴ?ＳＴＲ?ＮＡＬ?，ＶＭＰ?ＡＭＣ??麵■圓■?＼?Ｚ１１４７２?ＳＴ?１１?ＴＥＴＳＴＲ?ＮＡＬ?ＡＭＰ?ＡＭＣ??—■■■■?ＹＺＵ１４７０?ＳＴＵ?ＴＥＴ?ＳＴＲ、ＡＬ?ＡＭＰ??ＶＺｉ?１４７１?ＳＴ?１１?ＴＥＴ?ＳＩＲ?ＮＡＬ?ＡＭＰ????ＹＺｌ?１４７６?ＳＴｌｌ??圖２－２腸炎沙門菌分離株的耐藥基因分析結(jié)果??Ｆｉｇ．?２－２?Ｒｅｓｕｌｔｓ?ｏｆ?ｄｒｕｇ?ｒｅｓｉｓｔａｎｃｅ?ｇｅｎｅ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ?Ｅｎｔｅｒｉｔｉｄｉｓ?ｉｓｏｌａｔｅｓ??２．１．２．３腸炎沙門菌分離株核心基因組進(jìn)化樹分析??根據(jù)基因組差異，構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹，如圖２－３，結(jié)果顯示２２株腸炎沙門菌菌株可??分為４個(gè)進(jìn)化分支，將其命名為分支Ｉ、分支ＩＩ、分支ＩＩＩ和分支ＩＶ。其中ＹＺＵ１４６９單??獨(dú)形成一個(gè)分支Ｉ，該菌株分離自蛋業(yè)公司的蛋白液樣品，在耐藥譜分析中也是單獨(dú)??分布于一個(gè)分支，與耐藥譜的分析結(jié)果相一致。ＹＺＵ１４７０和ＹＺＵ１４７１位于分支ＩＩ，??均來自于蛋業(yè)公司的蛋白液樣品。分支ＩＩＩ包含３株細(xì)菌，ＹＺＵ１４６６、ＹＺＵ１４７５和??ＹＺＵ１４７２，分別來自于孵化中心的死胚樣品、蛋業(yè)公司的蛋白液和蛋業(yè)公司的環(huán)境樣??品。其余１６株分離株分布于分支ＩＶ，細(xì)菌的來源包括養(yǎng)殖場的病死雞樣品（ＹＺＵ１４５９，??ＹＺＵ１４６０和ＹＺＵ１４６１）、環(huán)境樣品（ＹＺＵ１４７４）和雞蛋樣品（ＹＺＵ１４５２

ｒｅｅ?ｓｃａｌｅ：?０．１?？—ｉ???ＹＺＵ１４６９??ｊ?ＹＺＵＵ７０??Ｐ?ＹＺＵＵ７１??｜?ＹＺＵ１４６６??ｌ?ＹＺＵ１４７５???＾?ＹＺＵ１４７２??ＹＺＵ１４６７??ＹＺＵ１４５９??ＹＺＵ１４５７??ＹＺＵＵ５２??ＹＺＵ１４６１??ＹＺＵ１４６２??ＹＺＵ１４７４??ＹＺＵ１４５５??ＹＺＵ１４５６??ＹＺＵ１４６８??ＹＺＵ１４７３??ＹＺＵ１４６５??ＹＺＵ１４６４??ＹＺＵ１４５８??ＹＺＵ１４６３??ＹＺＵ１４６０??圖２－３腸炎沙門菌分離株的ＷＧＳ分型結(jié)果??Ｆｉｇ．?２－３?ＷＧＳ?ｔｙｐｉｎｇ?ｏｆ?Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ?Ｅｎｔｅｒｉｔｉｄｉｓ?ｉｓｏｌａｔｅｓ??２．２嬰兒沙門菌分離株ＷＧＳ分析結(jié)果??２．２．１嬰兒沙門菌分離株ＭＬＳＴ分析??通過與ＭＬＳＴ數(shù)據(jù)庫中的７個(gè)管家基因進(jìn)行對比發(fā)現(xiàn)，在被測的１３株嬰兒沙門菌??分離株中，所有嬰兒沙門菌的ＳＴ型均為ＳＴ３２。??２．２．２嬰兒沙門菌分離株耐藥基因譜分析??通過ＷＧＳ分析可知，１００％的菌株攜帶如ｃ（７５：Ｍａａ基因（氨基糖苷類）和外排泵??⑷基因（喹諾酮類）。查閱資料發(fā)現(xiàn)單獨(dú)攜帶如咻７－Ｉａａ基因不會(huì)產(chǎn)生氨基糖苷類??抗生素耐藥，與前期抗生素耐藥性實(shí)驗(yàn)的耐藥表型相一致。此外，菌株對所選喹諾酮??類抗生素均不耐藥。??２．２．３嬰兒沙門菌分離株核心基因組進(jìn)化樹分析??根據(jù)基因組差異構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹，如圖２－４。結(jié)果顯示１３株嬰兒沙門菌在基因組??上差異不大，相似性很高。所選擇的１３株菌株中兩株（編號為ＨＡ１２２和ＨＡ１２６）來??３１??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3009259