為了解福建地區(qū)豬圓環(huán)病毒2型（PCV2）感染病變及分子遺傳演化情況,采集來自不同豬場29份臨床疑似感染PCV2的組織病料,進行了病理學觀察、PCR檢測、全基因測序及分析。結果表明,淋巴小結及淋巴細胞數量減少,肺泡腔內炎性細胞浸潤;29份病料檢出20份PCV2陽性,陽性率為68.9%;獲得20株完整PCV2全基因序列,同源性為96.0%～99.9%;進化樹分析,1株為PCV2a（占5%）,11株為PCV2b（占55%）,8株為PCV2d（占40%）;ORF2變異性分析,發(fā)現(xiàn)PCV2b和PCV2d分別存在1個和3個區(qū)別于其他基因型的獨特氨基酸位點,PCV2b為210（E）,PCV2d為53（I）、68（N）和133-134（AN）。研究結果充實了PCV2分子流行病學數據,為疫苗選擇及基因型鑒別提供參考。 

【文章來源】：動物醫(yī)學進展. 2020,41(10)北大核心

【文章頁數】：9 頁

【部分圖文】：

病例剖檢病變

將本研究的20株PCV2全基因組序列與國內外其他22株構建分子遺傳進化樹,引入PCV1和PCV3作為外源基因(圖4)。結果顯示,整個進化樹分成10個分支群(Group1-10),本次20株主要集中在2個分支上,其中12株(FZ02、YX01、NP04、YT01、CL01、SX01、NP05、CL02、FZ01、LY01、CL03和FQ01)為Group1,歸屬于3個PCV2b基因型參考株(EF524535、GU799576和MK347411)分支;另外8株(MH01、MH02、NP02、YX02、FQ02、SM01、NP01和NP03)為Group3,歸屬于3個PCV2d基因型參考株(KJ187306、KY940543和MK347389)分支,但與Group2中的2個PCV2g基因型參考株(KP420197和JX099786)最近,屬于同一個大分支。全基因組序列同源性比較,發(fā)現(xiàn)本研究20株PCV2毒株之間核苷酸保守性高,同源性為96.0%～99.9%,與國內外其他PCV2參考株同源性為92.4%～99.9%,其中與MK347389(中國株)同源性最高為99.9%,與KT870146(美國株)最低為92.4%,親緣性高低與地域遠近沒有明顯相關。圖3 臨床病料PCR檢測及全基因擴增

臨床病料PCR檢測及全基因擴增


本文編號：3003884