為了解陜西地區(qū)豬流行性腹瀉病毒（PEDV）的遺傳進(jìn)化方向及為疫苗的研發(fā)奠定基礎(chǔ),采集陜西省部分地區(qū)腹瀉仔豬的腸道及內(nèi)容物,利用Vero細(xì)胞進(jìn)行病原分離,擴(kuò)增M基因和N基因序列并測序。結(jié)果顯示病毒盲傳5代,細(xì)胞出現(xiàn)收縮變圓直至脫落的細(xì)胞病變;序列分析結(jié)果表明,分離出的PEDV陜西地方株與其他參考毒株M基因核苷酸序列相似性為97.8%～99.7%,氨基酸序列相似性為97.3%～100%;N基因核苷酸序列相似性為95.7%～99.8%,氨基酸序列相似性為99.3%～100%。PEDV陜西分離株與CV777等經(jīng)典株的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),與變異株的親緣關(guān)系較近。表明成功分離出PEDV陜西地方株,且均為變異株。 

【文章來源】：動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2020,41(08)北大核心

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

不同地區(qū)病料中PEDV的RT-PCR結(jié)果

圖1 不同地區(qū)病料中PEDV的RT-PCR結(jié)果通過M基因的系統(tǒng)發(fā)育樹可以看出,分離的3株P(guān)EDV陜西地方株與Japan 14JM-216株、Fujian FJ-ZP 2014株、Hebei HBQY/2016株處于同一小支,親緣關(guān)系較近,與CV777經(jīng)典株的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)(圖3 A)。

雖然目前已知PEDV只有1種血清型,但對PEDV的全基因系統(tǒng)發(fā)育研究表明,PEDV可以從遺傳學(xué)上分為經(jīng)典組(G1)和變異組(G2)。G1是以CV777株為主的PEDV經(jīng)典株,G2主要是由經(jīng)典株突變進(jìn)化而來的突變株[15]。本研究中分離的3株P(guān)EDV陜西地方株均屬于G2。與CV777經(jīng)典株相比,3株P(guān)EDV分離株在M基因和N基因都有多個(gè)氨基酸位點(diǎn)發(fā)生突變。在M基因上,只有第214位由疏水性氨基酸突變?yōu)橛H水性氨基酸,即由丙氨酸(A)突變?yōu)榻z氨酸(S),其他突變位點(diǎn)親疏水性未發(fā)生改變。在N基因上,除第142(A→T)、241(H→L)、395(L→Q)、397(Q→L)和412(V→S)位點(diǎn)親疏水性發(fā)生改變,其他大部分突變位點(diǎn)親疏水性未發(fā)生改變。這些位點(diǎn)的突變是否會(huì)影響B(tài)細(xì)胞抗原位點(diǎn)和病毒的致病性有待于進(jìn)一步證實(shí)。本研究以陜西部分地區(qū)養(yǎng)豬場發(fā)生的疑似PED仔豬腸道及內(nèi)容物為材料,利用Vero F53細(xì)胞進(jìn)行了病原的分離,擴(kuò)增其M基因和N基因片段,再對其進(jìn)行全基因測序,結(jié)果表明成功分離出榆林、西安和寶雞PEDV地方株,且均為變異株。該結(jié)果對于陜西地區(qū)PED的防控提供了參考資料。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]影響豬流行性腹瀉病毒分離培養(yǎng)的因素[J]. 劉太峰,孫明潔,胡桂學(xué).  中國獸醫(yī)雜志. 2019(05)
[2]2006—2015年甘肅省豬流行性腹瀉流行病學(xué)分析[J]. 于清磊.  中國動(dòng)物檢疫. 2017(04)

碩士論文
[1]2017-2018年中國部分地區(qū)PEDV的遺傳演化分析[D]. 霍琳琳.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2019
[2]豬流行性腹瀉病毒的分離鑒定及滅活疫苗的研制[D]. 郭振剛.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019



本文編號(hào)：3000361