目的了解2017-2018年廣東省活禽市場外環(huán)境中H3N2亞型禽流感病毒的污染和變異情況。方法于2017-2018年在廣東省禽流感監(jiān)測點采集環(huán)境樣品進行核酸檢測,陽性樣品接種雞胚分離病毒并進行全基因組測序,利用相關軟件進行生物信息學分析。結果成功獲得7株H3N2亞型禽流感病毒,其HA蛋白裂解位點序列均為PEKQTR↓GL,與典型低致病性禽流感病毒的序列特征相符合。其中一分離株NS基因發(fā)生D92E干擾素抗性突變。HA蛋白受體結合位點、神經(jīng)氨酸酶耐藥位點、M基因上的金剛烷胺類藥物耐藥位點、PB2基因上與哺乳動物適應性相關位點等均未發(fā)生突變。系統(tǒng)進化分析顯示,7株分離株的8個基因片段均處在歐亞禽源分支中,但相互間存在差距。結論 7株分離株中存在5種組合的重配H3N2亞型禽流感病毒,其中1株NS基因發(fā)生D92E干擾素抗性突變。因此應加強活禽市場及環(huán)境監(jiān)測,防止產(chǎn)生能在人群中流行的重配H3N2病毒。 

【文章來源】：中國病原生物學雜志. 2020,15(06)北大核心

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

NA基因系統(tǒng)進化樹

PB2基因進化樹(圖3)顯示,歐亞禽源流感病毒分為兩支:C1、C4、C5、C6、C7分離株處于H3亞型禽流感病毒為代表的小分支(H3 Group 1)中,大部分廣東地區(qū)前期H3N2亞型分離株也屬于這一分支;另一分支(Gene Pool)由多種亞型組成,C2、C3分離株處于其中。C1、C4、C5、C6、C7分離株PB1基因分布與其PB2基因分布相似。C2、C3分離株PB1基因(圖4)分別處于H5 Group和Gene Pool分支。內(nèi)部基因PA、NP、NS和M進化樹如圖5-圖8所示。7株分離株所在位置及其分支已在圖中標出。

C2、C3分離株PB1基因(圖4)分別處于H5 Group和Gene Pool分支。內(nèi)部基因PA、NP、NS和M進化樹如圖5-圖8所示。7株分離株所在位置及其分支已在圖中標出。圖5 PA基因系統(tǒng)進化樹

【參考文獻】：
期刊論文
[1]黑龍江省活禽市場6株H9N2亞型禽流感病毒全基因組序列分析[J]. 舒暢,冷焱,石鑫,曹博,許軍.  中國病原生物學雜志. 2019(08)
[2]1株野鳥源重組H3N2亞型禽流感病毒的遺傳進化分析[J]. 高見勛,黃廷賀,葛伯洋,樊兆斌.  中國獸醫(yī)雜志. 2017(05)
[3]11株H3N2亞型禽流感病毒廣西分離株全基因序列測定與分析[J]. 劉婷婷,謝芝勛,宋德貴,羅思思,謝麗基,鄧顯文,謝志勤,黃莉,黃嬌玲,張艷芳,曾婷婷,王盛.  中國獸醫(yī)學報. 2017(05)
[4]人源H3N2亞型豬流感重組病毒的分離鑒定及全基因序列分析[J]. 周倫江,王隆柏,俞玉鴻,魏宏,車勇良,陳如敬,吳學敏,邵良平,莊向生.  中國預防獸醫(yī)學報. 2011(09)
[5]2株鴨源H3N2亞型流感病毒的分離鑒定和遺傳進化分析[J]. 趙國,鐘蕾,趙坤坤,鹿欣倫,彭大新,劉秀梵.  畜牧獸醫(yī)學報. 2010(10)

碩士論文
[1]兩株鴨源H3N2禽流感病毒全基因組序列分析及其致病性研究[D]. 胡濤.吉林農(nóng)業(yè)大學 2013



本文編號：2991745