目的了解2017-2018年廣東省活禽市場(chǎng)外環(huán)境中H3N2亞型禽流感病毒的污染和變異情況。方法于2017-2018年在廣東省禽流感監(jiān)測(cè)點(diǎn)采集環(huán)境樣品進(jìn)行核酸檢測(cè),陽(yáng)性樣品接種雞胚分離病毒并進(jìn)行全基因組測(cè)序,利用相關(guān)軟件進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果成功獲得7株H3N2亞型禽流感病毒,其HA蛋白裂解位點(diǎn)序列均為PEKQTR↓GL,與典型低致病性禽流感病毒的序列特征相符合。其中一分離株NS基因發(fā)生D92E干擾素抗性突變。HA蛋白受體結(jié)合位點(diǎn)、神經(jīng)氨酸酶耐藥位點(diǎn)、M基因上的金剛烷胺類藥物耐藥位點(diǎn)、PB2基因上與哺乳動(dòng)物適應(yīng)性相關(guān)位點(diǎn)等均未發(fā)生突變。系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示,7株分離株的8個(gè)基因片段均處在歐亞禽源分支中,但相互間存在差距。結(jié)論 7株分離株中存在5種組合的重配H3N2亞型禽流感病毒,其中1株NS基因發(fā)生D92E干擾素抗性突變。因此應(yīng)加強(qiáng)活禽市場(chǎng)及環(huán)境監(jiān)測(cè),防止產(chǎn)生能在人群中流行的重配H3N2病毒。 

【文章來(lái)源】：中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2020,15(06)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：8 頁(yè)

【部分圖文】：

NA基因系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)

PB2基因進(jìn)化樹(shù)(圖3)顯示,歐亞禽源流感病毒分為兩支:C1、C4、C5、C6、C7分離株處于H3亞型禽流感病毒為代表的小分支(H3 Group 1)中,大部分廣東地區(qū)前期H3N2亞型分離株也屬于這一分支;另一分支(Gene Pool)由多種亞型組成,C2、C3分離株處于其中。C1、C4、C5、C6、C7分離株P(guān)B1基因分布與其PB2基因分布相似。C2、C3分離株P(guān)B1基因(圖4)分別處于H5 Group和Gene Pool分支。內(nèi)部基因PA、NP、NS和M進(jìn)化樹(shù)如圖5-圖8所示。7株分離株所在位置及其分支已在圖中標(biāo)出。

C2、C3分離株P(guān)B1基因(圖4)分別處于H5 Group和Gene Pool分支。內(nèi)部基因PA、NP、NS和M進(jìn)化樹(shù)如圖5-圖8所示。7株分離株所在位置及其分支已在圖中標(biāo)出。圖5 PA基因系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
[1]兩株鴨源H3N2禽流感病毒全基因組序列分析及其致病性研究[D]. 胡濤.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013



本文編號(hào)：2991745