豬皮下與內臟脂肪組織mRNA轉錄組鑒定和差異分析
發(fā)布時間:2021-01-20 20:03
脂肪組織不僅是機體重要的能量代謝器官,還作為重要的內分泌器官分泌一些脂肪因子如脂聯素、瘦素、抵抗素等,對肥胖、糖尿病以及心血管等代謝疾病都有重要的作用。皮下脂肪(Subcutaneous adipose tissue, SAT)和內臟脂肪(Visceral adipose tissue. VAT)是在解剖學位置上不同的兩類脂肪,與SAT相比,VAT的解剖學位置、靜脈回流模式及其本質的和特有的功能都易于發(fā)生脂質代謝異常,從而導致心血管疾病和代謝疾病的發(fā)生:SAT主要作為豬的能量儲存組織在體內調節(jié)能量平衡。本研究以1個SAT(背部皮下脂肪)和2個VAT(大網膜和腸系膜脂肪)為研究對象,通過石蠟切片分析兩類脂肪組織細胞體積的差異;利用Q-PCR分析7個已知的炎癥相關基因在兩類脂肪組織的表達差異;通過液相色譜測定脂肪酸種類及其含量,探究兩類脂肪組織中脂肪酸組成的差異;利用RNA-seq方法,鑒定新的mRNA轉錄本、可變剪切、SNVs和INDELs;通過差異分析篩出在兩類脂肪組織中差異表達的基因,分析了關鍵基因SCD1和FADS2在脂肪酸代謝過程中的作用。利用石蠟切片對3個脂肪組織細胞形態(tài)和結構...
【文章來源】:四川農業(yè)大學四川省 211工程院校
【文章頁數】:143 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
高頻詞對照表
脂肪酸名稱對照表
第一章 文獻綜述
第一節(jié) 肥胖
1.1 肥胖癥的發(fā)病因素
1.2 與肥胖癥相關的生物大分子
1.3 肥胖是疾病的風險因素
第二節(jié) 脂肪組織
1.1 脂肪組織——能量代謝器官
1.2 脂肪組織——重要的內分泌器官
1.3 脂肪組織的分類
1.4 皮下脂肪與內臟脂肪在生理代謝上的差異
第三節(jié) 轉錄組測序
3.1 轉錄組測序(RNA-seq)
3.2 RNA測序技術平臺
3.3 RNA-seq原理
3.4 RNA-seq技術優(yōu)勢
3.5 RNA-seq的應用
第二章 本研究選題背景與目的意義
第一節(jié) 選題背景
第二節(jié) 主要研究內容
第三節(jié) 研究的目的意義
第三章 材料與方法
1 實驗動物
2 實驗儀器與主要試劑
3 試驗方法
第四章 結果與分析
1 不同部位脂肪組織細胞體積與脂肪酸差異分析結果
2 炎癥相關基因表達分析結果
3 不同部位脂肪組織轉錄組文庫構建
4 不同部位脂肪組織轉錄組特征分析
5 皮下和內臟脂肪組織轉錄組差異分析
6 測序結果的可靠性驗證
第五章 討論
1 轉錄組分析方法的選擇
2 皮下與內臟脂肪組織的細胞體積和脂肪酸組成差異與功能的關系
3 三個脂肪組織轉錄組特征與功能的關系
4 導致皮下與內臟脂肪組織功能差異的基因
5 RNA-seq結果的可靠性
第六章 結論與創(chuàng)新點
1 結論
2 本研究創(chuàng)新點
參考文獻
致謝
博士在讀期間發(fā)表的論文
附錄
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Metabolic syndrome and risk of subsequent colorectal cancer[J]. Raluca Pais,Horatiu Silaghi,Alina Cristina Silaghi,Mihai Lucian Rusu,Dan Lucian Dumitrascu. World Journal of Gastroenterology. 2009(41)
[2]腎素-血管緊張素-醛固酮系統(tǒng)中不同組分在脂肪組織中的表達[J]. 張雪晗,曾正陪,李漢忠,周亞茹,張晶,童安莉,閻朝麗. 中國醫(yī)學科學院學報. 2006(06)
本文編號:2989694
【文章來源】:四川農業(yè)大學四川省 211工程院校
【文章頁數】:143 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
高頻詞對照表
脂肪酸名稱對照表
第一章 文獻綜述
第一節(jié) 肥胖
1.1 肥胖癥的發(fā)病因素
1.2 與肥胖癥相關的生物大分子
1.3 肥胖是疾病的風險因素
第二節(jié) 脂肪組織
1.1 脂肪組織——能量代謝器官
1.2 脂肪組織——重要的內分泌器官
1.3 脂肪組織的分類
1.4 皮下脂肪與內臟脂肪在生理代謝上的差異
第三節(jié) 轉錄組測序
3.1 轉錄組測序(RNA-seq)
3.2 RNA測序技術平臺
3.3 RNA-seq原理
3.4 RNA-seq技術優(yōu)勢
3.5 RNA-seq的應用
第二章 本研究選題背景與目的意義
第一節(jié) 選題背景
第二節(jié) 主要研究內容
第三節(jié) 研究的目的意義
第三章 材料與方法
1 實驗動物
2 實驗儀器與主要試劑
3 試驗方法
第四章 結果與分析
1 不同部位脂肪組織細胞體積與脂肪酸差異分析結果
2 炎癥相關基因表達分析結果
3 不同部位脂肪組織轉錄組文庫構建
4 不同部位脂肪組織轉錄組特征分析
5 皮下和內臟脂肪組織轉錄組差異分析
6 測序結果的可靠性驗證
第五章 討論
1 轉錄組分析方法的選擇
2 皮下與內臟脂肪組織的細胞體積和脂肪酸組成差異與功能的關系
3 三個脂肪組織轉錄組特征與功能的關系
4 導致皮下與內臟脂肪組織功能差異的基因
5 RNA-seq結果的可靠性
第六章 結論與創(chuàng)新點
1 結論
2 本研究創(chuàng)新點
參考文獻
致謝
博士在讀期間發(fā)表的論文
附錄
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Metabolic syndrome and risk of subsequent colorectal cancer[J]. Raluca Pais,Horatiu Silaghi,Alina Cristina Silaghi,Mihai Lucian Rusu,Dan Lucian Dumitrascu. World Journal of Gastroenterology. 2009(41)
[2]腎素-血管緊張素-醛固酮系統(tǒng)中不同組分在脂肪組織中的表達[J]. 張雪晗,曾正陪,李漢忠,周亞茹,張晶,童安莉,閻朝麗. 中國醫(yī)學科學院學報. 2006(06)
本文編號:2989694
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