發(fā)布時(shí)間：2021-01-20 06:39

　　本論文對鴨疫里默氏桿菌（Riemerella anatipestifer, RA）外膜外排基因做了以下的一些研究：RA （outer membrane efflux protein, OEP）外膜外排蛋白基因核苷酸生物學(xué)特性分析、該基因編碼的蛋白生物學(xué)特性分析、外膜外排基因的T克隆及亞克隆、原核表達(dá)、重組蛋白的純化、兔抗RA外膜外排基因多克隆抗體的制備、多克隆抗體的粗提、用實(shí)時(shí)熒光定量PCR的方法來檢測RA外膜外排蛋白基因表達(dá)量與RA耐四環(huán)素的關(guān)系。結(jié)果如下：1.RA外膜外排蛋白基因生物信息學(xué)分析該基因有一個(gè)完整的ORF,其基因片段長度為1437bp,NCBI BLASTN進(jìn)行序列比對發(fā)現(xiàn)該基因與GenBank上提交的RACH-2和RAATCC11845的外膜外排蛋白基因序列相似度最高,對RAOEP基因密碼子偏嗜性分析顯示該基因密碼子的偏性比較弱并且沒有2個(gè)以上的稀有密碼子串。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析該蛋白質(zhì)與RACH-2和RAATCC11845外膜外排蛋白的親緣關(guān)系最近,并且還屬于同一分支,有信號(hào)肽,但沒跨膜區(qū),抗原表位相對集中,有4種不同的功能位點(diǎn),即分別為蛋白激酶C磷酸化位點(diǎn)、N-豆蔻�；�... 

【文章來源】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：46 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖１夕Ｉ、膜夕陸睡白家族的大體結(jié)構(gòu)??巧ｇｌ?Ｔｈｅ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?ｏｕｒ?ｍｅｍｂｒａｎｅ?ｅｆｆｌｕｘ?ｐｒｏｔｅｉｎ?ｆａｍｉｌｙＰ］??

疏水性有利于蛋白質(zhì)向內(nèi)折疊形成二級(jí)結(jié)構(gòu)，進(jìn)一步形成結(jié)構(gòu)域，王級(jí)結(jié)構(gòu)等，最根??本的是利于形成ａ螺旋，保證其穩(wěn)定性。疏水作用及疏水和親水之間的平衡在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)??與功能方面起著重要的作用用在線分析工具將氨基酸序列輸入，分析結(jié)果如圖２，整個(gè)蛋．??白質(zhì)疏水性最大值是３．００，最小值是－２．４７９，１０－２０位氨基酸蛋白質(zhì)疏水性最強(qiáng)。??？?〇?一?＊?口?一—?—?ｒ?？？？?一??９?－?Ｉ?＊?＇?Ｈ?ｉ？＇Ｋｉ?？ｂ?－?￣＾￣＇??＇－叫’…Ｉ－?＇?麵?［１?；；?ｊ?ｊｌ?－??ｉ?．｝?ｋ?ｉｌ／｜?ｋ?ｉ?Ｊ?ｊ?／｛?ｉｉ?％?蘭�。�?／ｕ�。欤�?ｉ（ｌ??。－．＇ｙ畫Ｙ專窄卽％］伽??＊＊?＇?ｉｉ?Ｉ?ｉ＼?ｊ??■Ｓ＇????．‘．Ｉ－?ｒＩ－－＇－－…：＇．‘Ｉ－…—??－?．．‘報(bào)?＾?－??—３?Ｉ，，?一，?■！■?－－?—?，?－?Ｉ?１?Ｉ?１?Ｉ?１?Ｉ?．?Ｉ?Ｉ?，?Ｉ?？???ｓｅ?１６６?１?ｓｅ?ｓｅｅ?ｓｓｅ?ｓｅｅ?ｓｓｅ?４ｓｅ?????ｆ．ＳＭ?々．円???????圖２?ＲＡＯＥＰ蛋白質(zhì)疏水性分析??巧昏２?Ｔｈｅ?ｐｒｅｄｉｃｔｅｄ?ｒｅｓｕｈ?ｏｆ?ｈｙｄｒｏｐＨｏｂｉｃｉｔｙ?ｏｆ?ｔｈｅ?ＲＡ?ＣＥＰ?ｇｅｎｅ??３．?１．４?ＲＡＯＥＰ蛋白抗原表位分析??抗原表位即抗原決定簇，是指抗原分子中決定抗原特異性的特殊化學(xué)集團(tuán)�？乖峭�??過它與相應(yīng)的淋己細(xì)胞表面的抗原進(jìn)行抗原受體結(jié)合

過它與相應(yīng)的淋己細(xì)胞表面的抗原進(jìn)行抗原受體結(jié)合，進(jìn)而激活淋己細(xì)胞，引起免疫應(yīng)備??抗原的特異性是由抗原表位的性質(zhì)、數(shù)目和空間構(gòu)型決定的。利用ＢｅｐｉＰｒｅｄ?１．０?Ｓｅｒｖｅｒ進(jìn)行??蛋白質(zhì)抗原表位分析，結(jié)果如圖３，發(fā)現(xiàn)該蛋白質(zhì)抗原表位主要集中在２２－２８、３５－巧、??１０５－１０７、１１７－１４２、２６９－２７５、２８５－２９０、２９７－３０２、４７５￣４７８?位難酸。??ｉ?ｗｒ?Ｉｆ?ｆ?Ｗｉｎ?Ｔｎ?Ｙ?？?ｔＲ?ｉｆ?Ｉ??ｉ?■??？?１????圖３?ＲＡＯＥＰ蛋白質(zhì)抗原表位預(yù)測??Ｆｉｇ．３?Ｔｈｅ?ｅｐｉｔｏｐｅ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ＲＡ?ＯＥＰ?ｐｒｏｔｅｉｎ??３．１．５?ＲＡ?ＯＥＰ蛋白功能位點(diǎn)分析??通過在線工具分析，ＲＡＯＥＰ蛋白有多個(gè)功能位點(diǎn)，其中Ｎ－糖基化位點(diǎn)６個(gè)，蛋白激??酶Ｃ憐酸化位點(diǎn)５個(gè)，Ｎ－豆憲醜化位點(diǎn)２個(gè)，酪蛋白激酶ＩＩ稱酸化位點(diǎn)８個(gè)。??３．?１．６?ＲＡ?ＯＥＰ蛋白權(quán)酸化位點(diǎn)預(yù)測分析??將ＲＡ０ＢＰ基因編碼氨基酸序列在線預(yù)測

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：2988580