為研究RBP4基因單核苷酸多態(tài)性與貴州黑山羊產(chǎn)羔性狀之間的關(guān)系,本研究采用混合DNA池測序和直接測序法篩選SNPs位點,進(jìn)行生物信息學(xué)和群體遺傳參數(shù)分析,并收集118頭貴州黑山羊母羊1～4胎產(chǎn)羔數(shù)據(jù),分析SNPs位點與產(chǎn)羔性狀之間的關(guān)聯(lián)性。結(jié)果顯示:共檢測到2個SNPs位點,為g.4527G>T和g.4744C>T。生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)g.4744C>T位點變異會使mRNA二級結(jié)構(gòu)最小自由能增大,結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性降低;群體遺傳參數(shù)分析發(fā)現(xiàn),g.4527G>T位點基因型頻率差異較大,G為優(yōu)勢等位基因;g.4744C>T位點C為優(yōu)勢等位基因;χ²檢驗顯示兩位點均處于Hardy-Weinberg平衡。基因型與產(chǎn)羔數(shù)關(guān)聯(lián)性分析發(fā)現(xiàn),g.4527G>T位點在2、3、4胎次,野生型產(chǎn)羔數(shù)顯著高于突變型;g.4744C>T位點在第1胎次,突變型母羊產(chǎn)羔數(shù)顯著高于野生型。本研究揭示了RBP4基因?qū)F州黑山羊產(chǎn)羔數(shù)存在顯著影響,g.4527G>T和g.4744C>T可能是影響貴州黑山羊產(chǎn)羔性狀的重要SNPs位點。 

【文章來源】：中國畜牧雜志. 2020,56(10)北大核心

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

RBP4基因的PCR擴增電泳圖

混池測序結(jié)果

圖3 單個樣本測序結(jié)果統(tǒng)計g.4527G>T和g.4744C>T位點各個基因型個體數(shù)量，計算基因型頻率、等位基因頻率、群體純合度、雜合度、多態(tài)信息含量以及HardyWeinberg平衡的卡方適合性檢驗，結(jié)果如表2。由表2可知，g.4527G>T位點基因型頻率差異較大，G為優(yōu)勢等位基因，等位基因頻率為0.885 2，等位基因分布不均勻；雜合度低，表明群體內(nèi)變異程度��；多態(tài)信息含量小于0.25，為低度多態(tài)，能提供的遺傳信息較少；χ2檢驗顯示該位點處于Hardy-Weinberg平衡。g.4744C>T位點C為優(yōu)勢等位基因，等位基因頻率為0.696 7，等位基因分布不均勻；雜合度較高，多態(tài)信息含量為中度多態(tài)，表明該位點可以提供一定的遺傳信息；χ2檢驗顯示該位點處于Hardy-Weinberg平衡。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]貴州黑山羊生態(tài)養(yǎng)殖提質(zhì)增效技術(shù)[J]. 王德鳳,韓勇,張華琦,粟朝芝.  農(nóng)技服務(wù). 2019(10)
[2]視黃醇結(jié)合蛋白4的生物學(xué)作用研究進(jìn)展[J]. 邢轍,欒新紅.  中國家禽. 2017(08)
[3]大白豬FSHβ和RBP4基因多態(tài)性與繁殖性狀的相關(guān)性研究[J]. 胡閃耀,陳佳,姜佳佳,毛翠,毛慧敏,王利通,王國水,左波,徐在言.  豬業(yè)科學(xué). 2017(03)
[4]貴州地方山羊RBP4基因多態(tài)性及生物信息學(xué)分析[J]. 鄧位喜,孫振梅,李鵬程,馮文武,陳祥.  生物技術(shù). 2016(05)
[5]家畜視黃醇結(jié)合蛋白4（RBP4）的研究進(jìn)展[J]. 王旭,白俊艷,楊帥,陳森,劉力.  畜牧與飼料科學(xué). 2016(12)
[6]視黃醇結(jié)合蛋白4（RBP4）基因多態(tài)性對豬繁殖性能的影響[J]. 王懷禹.  養(yǎng)豬. 2015(04)
[7]視黃醇結(jié)合蛋白4的研究進(jìn)展[J]. 胡敏敏,王曉青,閆福媛,高璠,琚堅.  胃腸病學(xué)和肝病學(xué)雜志. 2015(07)
[8]大白豬、長白豬和杜洛克豬RBP4基因多態(tài)性及其與繁殖性能的相關(guān)分析[J]. 劉璐,梁永曄,吳正常,蘇先敏,鄭先瑞,王瑾,吳圣龍,包文斌.  中國畜牧獸醫(yī). 2012(10)
[9]豬PRLR和RBP4基因多態(tài)性與產(chǎn)仔性能的關(guān)系[J]. 孫延曉,曾勇慶,唐輝,樊新忠,陳其美,李華,錢源,宋一萍.  遺傳. 2009(01)
[10]小尾寒羊高繁殖力候選基因RBP4的研究[J]. 何遠(yuǎn)清,郭曉紅,王金玉,儲明星,方麗,葉素成,周忠孝.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2006(07)

碩士論文
[1]松遼黑豬RBP4和RARG基因多態(tài)性及其與繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 王萬興.長春師范大學(xué) 2019
[2]RBP4基因和RARγ基因單核苷酸多態(tài)性與小尾寒羊高繁殖力關(guān)系的研究[D]. 郭曉紅.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004



本文編號：2980752