豬親環(huán)素A的原核表達(dá)及其對(duì)豬傳染性胃腸炎病毒體外復(fù)制的影響
發(fā)布時(shí)間:2021-01-16 10:47
動(dòng)物病毒感染、復(fù)制以及致病等過程都離不開宿主細(xì)胞的蛋白質(zhì)參與,宿主細(xì)胞的蛋白質(zhì)可能在病毒感染過程中抑制病毒的生命活動(dòng),限制甚至清除病毒感染,也可能被病毒利用,為病毒的繁殖等提供便利。親環(huán)素A (CypA)是一種保守性極強(qiáng)的伴侶蛋白,廣泛分布于動(dòng)物與微生物體內(nèi),哺乳動(dòng)物的親環(huán)素A大多與疾病相關(guān)。本實(shí)驗(yàn)旨在探索豬CypA在豬傳染性胃腸炎病毒(TGEV)復(fù)制過程中的作用,就豬CypA對(duì)TGEV體外復(fù)制的影響進(jìn)行以下研究:1.TGEV四川株的分離鑒定與熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立利用PK-15細(xì)胞從四川腹瀉仔豬樣品中分離得到一株病毒,經(jīng)PCR檢測(cè)、病毒理化實(shí)驗(yàn)與微量中和實(shí)驗(yàn)證實(shí)該分離株為TGEV,命名為SC-T。根據(jù)TGEV的S基因設(shè)計(jì)合成一對(duì)熒光定量RT-PCR檢測(cè)引物,建立TGEV SYBR Green熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法。構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)品質(zhì)粒繪制熒光定量標(biāo)準(zhǔn)曲線,并進(jìn)行該檢測(cè)方法的特異性、重復(fù)性、靈敏性實(shí)驗(yàn)。標(biāo)準(zhǔn)品質(zhì)粒濃度在5.32×107~5.32×101copies/μL時(shí)可以得到較理想的標(biāo)準(zhǔn)曲線,該方法重復(fù)性與特異性好,可檢測(cè)最低濃度為5copies/μL。2.豬CypA的...
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:75 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
縮略詞表
第一部分 文獻(xiàn)綜述
1 豬傳染性胃腸炎研究進(jìn)展
1.1 病原學(xué)
1.2 豬傳染性胃腸炎流行病學(xué)
1.3 豬傳染性胃腸炎致病機(jī)制
1.4 豬傳染性胃腸炎診斷
1.4.1 病毒的分離與鑒定
1.4.2 血清學(xué)檢測(cè)
1.4.3 豬傳染性胃腸炎病毒分子檢測(cè)
1.5 豬傳染性胃腸炎疫苗與免疫預(yù)防
2 親環(huán)素A研究進(jìn)展
2.1 親環(huán)素A的結(jié)構(gòu)與生物學(xué)功能
2.2 親環(huán)素A在病毒感染中的作用
2.2.1 CypA與艾滋病毒的相互作用
2.2.2 Cyclophilin A與流感病毒的相互作用
2.2.3 Cyclophilin A與其他病毒的相互作用
目的與意義
第二部分 實(shí)驗(yàn)部分
第一章 豬傳染性胃腸炎病毒分離鑒定與熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立
1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1 實(shí)驗(yàn)試劑
1.2 菌株與細(xì)胞
1.3 實(shí)驗(yàn)器材
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 病毒分離
2.2 病毒PCR檢測(cè)
2.2.1 病毒液總RNA提取
2.2.2 反轉(zhuǎn)錄制備cDNA
2.2.3 TGEV PCR檢測(cè)
2.2.4 其他病毒病原PCR檢測(cè)
2.3 病毒TCID50測(cè)定
2.4 病毒中和實(shí)驗(yàn)
2.5 病毒理化性質(zhì)實(shí)驗(yàn)
2.5.1 病毒核酸類型測(cè)定
2.5.2 氯仿實(shí)驗(yàn)
2.6 豬傳染性胃腸炎病毒熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立
2.6.1 熒光定量RT-PCR檢測(cè)引物設(shè)計(jì)
2.6.2 標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒的構(gòu)建
2.6.3 TGEV熒光定量RT-PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線繪制
2.6.4 特異性、靈敏性、重復(fù)性實(shí)驗(yàn)
3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.1 病毒培養(yǎng)
3.2 病毒PCR檢測(cè)
3.3 病毒TCID50
3.4 病毒中和實(shí)驗(yàn)
3.5 病毒理化實(shí)驗(yàn)
3.5.1 病毒核酸類型
3.5.2 氯仿實(shí)驗(yàn)
3.6 TGEV熒光定量檢測(cè)方法
3.6.1 標(biāo)準(zhǔn)品質(zhì)粒的構(gòu)建
3.6.2 TGEV熒光定量RT-PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線繪制
3.6.3 特異性、靈敏性、重復(fù)性實(shí)驗(yàn)
4 討論
4.1 關(guān)于TGEV病毒分離鑒定
4.2 關(guān)于TGEV熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立
第二章 豬親環(huán)素A的克隆與原核表達(dá)
1 材料與試劑
1.1 實(shí)驗(yàn)試劑
1.2 菌株與細(xì)胞
1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 豬CypA基因PCR擴(kuò)增
2.1.1 引物設(shè)計(jì)
2.1.2 豬外周血淋巴細(xì)胞的分離
2.1.3 不同細(xì)胞總RNA的提取
2.1.4 RT-PCR擴(kuò)增
2.2 豬CypA基因的克隆測(cè)序與序列分析
2.3 豬CypA原核表達(dá)載體pET30-CypA的構(gòu)建
2.3.1 酶切消化與DNA回收
2.3.2 連接轉(zhuǎn)化與陽性克隆篩選
2.3.3 豬CypA基因原核表達(dá)菌株的構(gòu)建
2.4 pET30-CypA原核表達(dá)菌的培養(yǎng)與表達(dá)
2.5 原核表達(dá)條件的優(yōu)化
2.6 重組表達(dá)蛋白的可溶性檢測(cè)
2.7 豬CypA蛋白的大量表達(dá)與純化
2.8 豬CypA融合表達(dá)蛋白Westernblot鑒定
3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.1 豬CypA基因PCR擴(kuò)增
3.2 豬CypA基因遺傳進(jìn)化分析
3.3 豬CypA原核表達(dá)載體構(gòu)建結(jié)果
3.4 pET30-CypA原核表達(dá)菌的培養(yǎng)與表達(dá)
3.5 pET30-CypA原核表達(dá)條件優(yōu)化
3.6 重組表達(dá)蛋白的可溶性檢測(cè)
3.7 豬CypA蛋白的大量表達(dá)與純化
3.8 豬CypA蛋白Westernblot鑒定
4 討論
4.1 關(guān)于豬CypA蛋白克隆測(cè)序與原核表達(dá)
4.3 關(guān)于CypA蛋白的鑒定與純化
第三章 親環(huán)素A對(duì)豬傳染性胃腸炎病毒體外復(fù)制的影響
1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1 實(shí)驗(yàn)試劑
1.2 毒株與細(xì)胞
1.3 實(shí)驗(yàn)器材
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 豬CypA蛋白表達(dá)純化與透析
2.2 豬CypA蛋白濃度與純度檢測(cè)
2.3 豬CypA蛋白對(duì)TGEV復(fù)制的影響
2.3.1 分組處理
2.3.2 熒光定量RT-PCR檢測(cè)不同樣品中TGEV含量
3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.1 豬CypA蛋白純化與透析
3.2 豬CypA蛋白濃度與純度檢測(cè)
3.3 豬CypA蛋白對(duì)TGEV一步生長(zhǎng)曲線的影響
4 討論
4.1 關(guān)于TGEV一步生長(zhǎng)曲線的測(cè)定
4.2 關(guān)于豬CypA對(duì)TGEV體外復(fù)制影響的初步探索
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
附表
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]仔豬人工感染豬傳染性胃腸炎病毒的病理分析[J]. 王龍濤,葛晨霞,黃海龍,胡桂學(xué),高豐. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(28)
[2]CypA的生物學(xué)功能及其與肺癌相關(guān)的研究進(jìn)展[J]. 錢哲,岳文濤,李寶蘭. 中國(guó)肺癌雜志. 2010(08)
[3]豬傳染性胃腸炎的防控[J]. 趙永樂,曾春琳,梁志松,曾文娟. 畜牧與飼料科學(xué). 2009(10)
[4]親環(huán)素的研究進(jìn)展與展望[J]. 潘克厚,馬曉磊,石娟. 中國(guó)海洋大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2008(03)
[5]豬傳染性胃腸炎病毒S基因核酸疫苗免疫小鼠體液免疫功能變化的研究[J]. 任玲,李廣興,張宏偉. 畜牧獸醫(yī)雜志. 2007(05)
[6]豬傳染性胃腸炎病毒重組N蛋白抗原間接ELISA抗體檢測(cè)方法的建立[J]. 孫東波,馮力,時(shí)洪艷,劉勝旺,陳洪巖,佟有恩,李偉杰,王明,馬思奇,陳建飛. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2006(05)
[7]應(yīng)用多重RT-PCR方法檢測(cè)158例豬糞樣中的兩種冠狀病毒[J]. 楊群,何孔旺,陸承平. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2006(04)
[8]豬傳染性胃腸炎病毒分子生物學(xué)研究進(jìn)展[J]. 李建強(qiáng),柳紀(jì)省,胡永浩,程杰,蘭喜,殷相平,李寶玉,李志勇,楊彬,馬友記. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2006(02)
[9]多重RT-PCR檢測(cè)豬傳染性胃腸炎病毒和豬流行性腹瀉病毒[J]. 陳芳,劉惠莉,孫紅立,曹祥榮,李震,趙立平. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2005(01)
[10]實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 歐陽松應(yīng),楊冬,歐陽紅生,馬鶴雯. 生命的化學(xué). 2004(01)
本文編號(hào):2980689
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:75 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
縮略詞表
第一部分 文獻(xiàn)綜述
1 豬傳染性胃腸炎研究進(jìn)展
1.1 病原學(xué)
1.2 豬傳染性胃腸炎流行病學(xué)
1.3 豬傳染性胃腸炎致病機(jī)制
1.4 豬傳染性胃腸炎診斷
1.4.1 病毒的分離與鑒定
1.4.2 血清學(xué)檢測(cè)
1.4.3 豬傳染性胃腸炎病毒分子檢測(cè)
1.5 豬傳染性胃腸炎疫苗與免疫預(yù)防
2 親環(huán)素A研究進(jìn)展
2.1 親環(huán)素A的結(jié)構(gòu)與生物學(xué)功能
2.2 親環(huán)素A在病毒感染中的作用
2.2.1 CypA與艾滋病毒的相互作用
2.2.2 Cyclophilin A與流感病毒的相互作用
2.2.3 Cyclophilin A與其他病毒的相互作用
目的與意義
第二部分 實(shí)驗(yàn)部分
第一章 豬傳染性胃腸炎病毒分離鑒定與熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立
1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1 實(shí)驗(yàn)試劑
1.2 菌株與細(xì)胞
1.3 實(shí)驗(yàn)器材
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 病毒分離
2.2 病毒PCR檢測(cè)
2.2.1 病毒液總RNA提取
2.2.2 反轉(zhuǎn)錄制備cDNA
2.2.3 TGEV PCR檢測(cè)
2.2.4 其他病毒病原PCR檢測(cè)
2.3 病毒TCID50測(cè)定
2.4 病毒中和實(shí)驗(yàn)
2.5 病毒理化性質(zhì)實(shí)驗(yàn)
2.5.1 病毒核酸類型測(cè)定
2.5.2 氯仿實(shí)驗(yàn)
2.6 豬傳染性胃腸炎病毒熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立
2.6.1 熒光定量RT-PCR檢測(cè)引物設(shè)計(jì)
2.6.2 標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒的構(gòu)建
2.6.3 TGEV熒光定量RT-PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線繪制
2.6.4 特異性、靈敏性、重復(fù)性實(shí)驗(yàn)
3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.1 病毒培養(yǎng)
3.2 病毒PCR檢測(cè)
3.3 病毒TCID50
3.4 病毒中和實(shí)驗(yàn)
3.5 病毒理化實(shí)驗(yàn)
3.5.1 病毒核酸類型
3.5.2 氯仿實(shí)驗(yàn)
3.6 TGEV熒光定量檢測(cè)方法
3.6.1 標(biāo)準(zhǔn)品質(zhì)粒的構(gòu)建
3.6.2 TGEV熒光定量RT-PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線繪制
3.6.3 特異性、靈敏性、重復(fù)性實(shí)驗(yàn)
4 討論
4.1 關(guān)于TGEV病毒分離鑒定
4.2 關(guān)于TGEV熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立
第二章 豬親環(huán)素A的克隆與原核表達(dá)
1 材料與試劑
1.1 實(shí)驗(yàn)試劑
1.2 菌株與細(xì)胞
1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 豬CypA基因PCR擴(kuò)增
2.1.1 引物設(shè)計(jì)
2.1.2 豬外周血淋巴細(xì)胞的分離
2.1.3 不同細(xì)胞總RNA的提取
2.1.4 RT-PCR擴(kuò)增
2.2 豬CypA基因的克隆測(cè)序與序列分析
2.3 豬CypA原核表達(dá)載體pET30-CypA的構(gòu)建
2.3.1 酶切消化與DNA回收
2.3.2 連接轉(zhuǎn)化與陽性克隆篩選
2.3.3 豬CypA基因原核表達(dá)菌株的構(gòu)建
2.4 pET30-CypA原核表達(dá)菌的培養(yǎng)與表達(dá)
2.5 原核表達(dá)條件的優(yōu)化
2.6 重組表達(dá)蛋白的可溶性檢測(cè)
2.7 豬CypA蛋白的大量表達(dá)與純化
2.8 豬CypA融合表達(dá)蛋白Westernblot鑒定
3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.1 豬CypA基因PCR擴(kuò)增
3.2 豬CypA基因遺傳進(jìn)化分析
3.3 豬CypA原核表達(dá)載體構(gòu)建結(jié)果
3.4 pET30-CypA原核表達(dá)菌的培養(yǎng)與表達(dá)
3.5 pET30-CypA原核表達(dá)條件優(yōu)化
3.6 重組表達(dá)蛋白的可溶性檢測(cè)
3.7 豬CypA蛋白的大量表達(dá)與純化
3.8 豬CypA蛋白Westernblot鑒定
4 討論
4.1 關(guān)于豬CypA蛋白克隆測(cè)序與原核表達(dá)
4.3 關(guān)于CypA蛋白的鑒定與純化
第三章 親環(huán)素A對(duì)豬傳染性胃腸炎病毒體外復(fù)制的影響
1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1 實(shí)驗(yàn)試劑
1.2 毒株與細(xì)胞
1.3 實(shí)驗(yàn)器材
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 豬CypA蛋白表達(dá)純化與透析
2.2 豬CypA蛋白濃度與純度檢測(cè)
2.3 豬CypA蛋白對(duì)TGEV復(fù)制的影響
2.3.1 分組處理
2.3.2 熒光定量RT-PCR檢測(cè)不同樣品中TGEV含量
3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.1 豬CypA蛋白純化與透析
3.2 豬CypA蛋白濃度與純度檢測(cè)
3.3 豬CypA蛋白對(duì)TGEV一步生長(zhǎng)曲線的影響
4 討論
4.1 關(guān)于TGEV一步生長(zhǎng)曲線的測(cè)定
4.2 關(guān)于豬CypA對(duì)TGEV體外復(fù)制影響的初步探索
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
附表
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]仔豬人工感染豬傳染性胃腸炎病毒的病理分析[J]. 王龍濤,葛晨霞,黃海龍,胡桂學(xué),高豐. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(28)
[2]CypA的生物學(xué)功能及其與肺癌相關(guān)的研究進(jìn)展[J]. 錢哲,岳文濤,李寶蘭. 中國(guó)肺癌雜志. 2010(08)
[3]豬傳染性胃腸炎的防控[J]. 趙永樂,曾春琳,梁志松,曾文娟. 畜牧與飼料科學(xué). 2009(10)
[4]親環(huán)素的研究進(jìn)展與展望[J]. 潘克厚,馬曉磊,石娟. 中國(guó)海洋大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2008(03)
[5]豬傳染性胃腸炎病毒S基因核酸疫苗免疫小鼠體液免疫功能變化的研究[J]. 任玲,李廣興,張宏偉. 畜牧獸醫(yī)雜志. 2007(05)
[6]豬傳染性胃腸炎病毒重組N蛋白抗原間接ELISA抗體檢測(cè)方法的建立[J]. 孫東波,馮力,時(shí)洪艷,劉勝旺,陳洪巖,佟有恩,李偉杰,王明,馬思奇,陳建飛. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2006(05)
[7]應(yīng)用多重RT-PCR方法檢測(cè)158例豬糞樣中的兩種冠狀病毒[J]. 楊群,何孔旺,陸承平. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2006(04)
[8]豬傳染性胃腸炎病毒分子生物學(xué)研究進(jìn)展[J]. 李建強(qiáng),柳紀(jì)省,胡永浩,程杰,蘭喜,殷相平,李寶玉,李志勇,楊彬,馬友記. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2006(02)
[9]多重RT-PCR檢測(cè)豬傳染性胃腸炎病毒和豬流行性腹瀉病毒[J]. 陳芳,劉惠莉,孫紅立,曹祥榮,李震,趙立平. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2005(01)
[10]實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 歐陽松應(yīng),楊冬,歐陽紅生,馬鶴雯. 生命的化學(xué). 2004(01)
本文編號(hào):2980689
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