牛支原體貴州株表面膜蛋白p81基因生物信息學(xué)分析
發(fā)布時間:2021-01-13 19:33
為了解牛支原體(Mycoplasma bovis)貴州株表面膜蛋白p81基因的生物信息學(xué)特征,對2株貴州分離株p81基因進(jìn)行克隆測序,應(yīng)用DNAStar 7.1、Mega 5.0、Protparam、Protscale、IEBD等軟件進(jìn)行序列分析。結(jié)果顯示,2株M.bovis貴州分離株培養(yǎng)物DNA樣本均能PCR擴(kuò)增出2 187 bp的特異性條帶,序列編碼728個氨基酸,該分離株與標(biāo)準(zhǔn)株P(guān)G45進(jìn)化關(guān)系最為接近,說明牛支原體p81基因具有良好的保守性。p81蛋白共存在5個N糖基化位點(diǎn),59個絲氨酸、29個蘇氨酸及11個酪氨酸可能被磷酸化。p81蛋白B細(xì)胞抗原表位分析顯示該蛋白具有良好的抗原性。研究結(jié)果表明,p81蛋白具有作為亞單位疫苗和診斷試劑靶標(biāo)蛋白的優(yōu)勢。
【文章來源】:畜牧與獸醫(yī). 2020,52(08)北大核心
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
p81基因片段PCR擴(kuò)增結(jié)果
提取重組質(zhì)粒,用限制性內(nèi)切酶KpnⅠ和SalⅠ對重組質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切鑒定,酶切產(chǎn)物電泳電泳結(jié)果見圖3。重組質(zhì)粒雙酶切可見約2 187 bp的目的基因條帶和2 962 bp的載體條帶,結(jié)果證實(shí),目的基因克隆成功。2.2.3 p81基因推到氨基酸序列分析
經(jīng)PCR和雙酶切鑒定為陽性的重組質(zhì)粒進(jìn)行測序,對氨基酸序列進(jìn)行推導(dǎo)分析。由圖4可見,p81基因序列編碼728個氨基酸,推導(dǎo)氨基酸55 位、230 位、485 位、558位密碼子為TGA,可作為終止密碼子,但對于牛支原體p81基因?yàn)樯彼?如進(jìn)行蛋白表達(dá)需進(jìn)行位點(diǎn)突變。將2株M.bovis貴州株氨基酸序列與參考株P(guān)G45氨基酸序列進(jìn)行比較顯示, 2株分離自貴州省不地區(qū)的M.bovis貴州株氨基酸序列完全相同,但與PG45株p81蛋白氨基酸序列發(fā)生110位點(diǎn)突變。此結(jié)果表明,貴州省內(nèi)M.bovis菌株p81蛋白保守,但相較于標(biāo)準(zhǔn)株P(guān)G45株已出現(xiàn)明顯進(jìn)化。圖4 牛支原體貴州株p81基因推導(dǎo)的氨基酸序列
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]牛支原體新疆株的分離鑒定[J]. 凌晨,郝成武,何海,張飛,候鳳,賀筍. 中國畜牧獸醫(yī). 2019(05)
[2]牛支原體膜蛋白的研究進(jìn)展[J]. 劉暢,曹鈺晗,趙春陽,徐璐堯,張文勁,唐鑫,賴金倫,陳穎鈺,郭愛珍,胡長敏. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2018(10)
[3]牛支原體致病機(jī)理的研究進(jìn)展[J]. 季文恒,陳勝利,趙萍,郝華芳,王展慧,劉永生,儲岳峰. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2018(04)
[4]牛支原體新疆分離株重組P81膜蛋白的表達(dá)及鑒定[J]. 趙陽,陳創(chuàng)夫,剡根強(qiáng),石峰. 中國病原生物學(xué)雜志. 2017(10)
[5]牛支原體TaqMan實(shí)時熒光定量PCR檢測方法的建立[J]. 李建,高航飛,安維雪,牛同州,趙永春,遇培之,滿都拉圖,烏力吉那仁,王建國,申之義. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2017(06)
[6]寧夏某肉牛場牛支原體分離鑒定及病理組織學(xué)觀察[J]. 郭亞男,曹思婷,何生虎,王爽,張鑫,孫鵬. 動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2017(03)
[7]牛支原體P81蛋白的表達(dá)及純化[J]. 馬海彬,韓繼成,孫文超,解長占,靖杰,肖朋朋,趙飛,張萍,魯會軍,金寧一. 中國病原生物學(xué)雜志. 2017(01)
[8]牛支原體實(shí)驗(yàn)室檢測方法研究進(jìn)展[J]. 莊金秋,梅建國,劉吉山,姚春陽,馬力. 中國奶牛. 2017(02)
[9]牛支原體膜蛋白研究進(jìn)展[J]. 李強(qiáng),趙澤慧,牛耀祖,許立華. 動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2016(06)
[10]綿羊肺炎支原體貴州株P(guān)113基因的克隆與生物信息學(xué)分析[J]. 吳燕,袁海文,王琦,岳筠,文明,周碧君,程振濤. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2016(03)
碩士論文
[1]牛肺炎支原體分離鑒定及主要基因分子特征研究[D]. 袁海文.貴州大學(xué) 2017
[2]雞毒支原體S6株P(guān)25、P33蛋白粘附特性的研究[D]. 高利萍.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
本文編號:2975440
【文章來源】:畜牧與獸醫(yī). 2020,52(08)北大核心
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
p81基因片段PCR擴(kuò)增結(jié)果
提取重組質(zhì)粒,用限制性內(nèi)切酶KpnⅠ和SalⅠ對重組質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切鑒定,酶切產(chǎn)物電泳電泳結(jié)果見圖3。重組質(zhì)粒雙酶切可見約2 187 bp的目的基因條帶和2 962 bp的載體條帶,結(jié)果證實(shí),目的基因克隆成功。2.2.3 p81基因推到氨基酸序列分析
經(jīng)PCR和雙酶切鑒定為陽性的重組質(zhì)粒進(jìn)行測序,對氨基酸序列進(jìn)行推導(dǎo)分析。由圖4可見,p81基因序列編碼728個氨基酸,推導(dǎo)氨基酸55 位、230 位、485 位、558位密碼子為TGA,可作為終止密碼子,但對于牛支原體p81基因?yàn)樯彼?如進(jìn)行蛋白表達(dá)需進(jìn)行位點(diǎn)突變。將2株M.bovis貴州株氨基酸序列與參考株P(guān)G45氨基酸序列進(jìn)行比較顯示, 2株分離自貴州省不地區(qū)的M.bovis貴州株氨基酸序列完全相同,但與PG45株p81蛋白氨基酸序列發(fā)生110位點(diǎn)突變。此結(jié)果表明,貴州省內(nèi)M.bovis菌株p81蛋白保守,但相較于標(biāo)準(zhǔn)株P(guān)G45株已出現(xiàn)明顯進(jìn)化。圖4 牛支原體貴州株p81基因推導(dǎo)的氨基酸序列
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]牛支原體新疆株的分離鑒定[J]. 凌晨,郝成武,何海,張飛,候鳳,賀筍. 中國畜牧獸醫(yī). 2019(05)
[2]牛支原體膜蛋白的研究進(jìn)展[J]. 劉暢,曹鈺晗,趙春陽,徐璐堯,張文勁,唐鑫,賴金倫,陳穎鈺,郭愛珍,胡長敏. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2018(10)
[3]牛支原體致病機(jī)理的研究進(jìn)展[J]. 季文恒,陳勝利,趙萍,郝華芳,王展慧,劉永生,儲岳峰. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2018(04)
[4]牛支原體新疆分離株重組P81膜蛋白的表達(dá)及鑒定[J]. 趙陽,陳創(chuàng)夫,剡根強(qiáng),石峰. 中國病原生物學(xué)雜志. 2017(10)
[5]牛支原體TaqMan實(shí)時熒光定量PCR檢測方法的建立[J]. 李建,高航飛,安維雪,牛同州,趙永春,遇培之,滿都拉圖,烏力吉那仁,王建國,申之義. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2017(06)
[6]寧夏某肉牛場牛支原體分離鑒定及病理組織學(xué)觀察[J]. 郭亞男,曹思婷,何生虎,王爽,張鑫,孫鵬. 動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2017(03)
[7]牛支原體P81蛋白的表達(dá)及純化[J]. 馬海彬,韓繼成,孫文超,解長占,靖杰,肖朋朋,趙飛,張萍,魯會軍,金寧一. 中國病原生物學(xué)雜志. 2017(01)
[8]牛支原體實(shí)驗(yàn)室檢測方法研究進(jìn)展[J]. 莊金秋,梅建國,劉吉山,姚春陽,馬力. 中國奶牛. 2017(02)
[9]牛支原體膜蛋白研究進(jìn)展[J]. 李強(qiáng),趙澤慧,牛耀祖,許立華. 動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2016(06)
[10]綿羊肺炎支原體貴州株P(guān)113基因的克隆與生物信息學(xué)分析[J]. 吳燕,袁海文,王琦,岳筠,文明,周碧君,程振濤. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2016(03)
碩士論文
[1]牛肺炎支原體分離鑒定及主要基因分子特征研究[D]. 袁海文.貴州大學(xué) 2017
[2]雞毒支原體S6株P(guān)25、P33蛋白粘附特性的研究[D]. 高利萍.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
本文編號:2975440
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