豬鏈球菌2型主要毒力因子三重?zé)晒舛縋CR快速檢測(cè)方法的建立和初步應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2021-01-06 05:34
豬鏈球菌是豬的常見病原體,豬鏈球菌病是多種鏈球菌引起豬的一類疾病的總稱,其中由豬鏈球菌2型引起的疾病是一種重要的人畜共患病。該病原可使豬產(chǎn)生腦膜炎、關(guān)節(jié)炎、心內(nèi)膜炎、肺炎、敗血癥等多種病癥甚至可引起急性死亡,同時(shí)還可感染人并致人死亡。根據(jù)菌體表面莢膜多糖的差異,將其分為35個(gè)血清型(1-34型及1/2型),其中以2型分布最普遍,致病力也最強(qiáng),1型、7型以及9型則次之。本研究首先建立了一種對(duì)豬鏈球菌2型3個(gè)重要毒力因子CPS2J、MRP、EF同時(shí)檢測(cè)的三重?zé)晒舛縋CR方法。針對(duì)臨床采集標(biāo)本容易污染、不易分離出典型菌落的現(xiàn)狀,研究出了一種豬鏈球菌選擇性增菌液,提高了其臨床分離效率,縮短了檢測(cè)時(shí)間。基于以上兩部分研究,對(duì)上海奉賢地區(qū)臨床表觀健康豬群的豬鏈球菌攜帶情況進(jìn)行了檢測(cè)。依據(jù)GenBank上的CP2SJ、MRP、EF基因保守序列,用軟件Primer Express 3.0設(shè)計(jì)各自對(duì)應(yīng)的引物以及Taqman控針,其中CP2SJ、MRP、EF探針5’端分別標(biāo)記FAM、HEX、CY5熒光發(fā)射基團(tuán),3’均以BHQ1熒光淬滅基團(tuán)標(biāo)記。通過對(duì)反應(yīng)體系及擴(kuò)增條件的優(yōu)化,建立了一種Taqman探針法...
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
符號(hào)及縮略語
第一篇 文獻(xiàn)綜述
第一章 豬鏈球菌的研究概述
1 豬鏈球菌簡(jiǎn)介
1.1 豬鏈球菌的歷史概況
1.2 豬鏈球菌病原學(xué)
1.2.1 分類
1.2.2 形態(tài)及染色特性
1.2.3 培養(yǎng)特性
1.2.4 抗抗力
1.2.5 耐藥性
1.3 豬鏈球菌流行病學(xué)研究
1.4 豬鏈球菌毒力因子研究
1.4.1 莢膜多糖(CPS)
1.4.2 溶菌酶釋放蛋白(MRP)和胞外蛋白因子(EF)
1.4.3 溶血素(SLY)
1.4.4 谷氨酸脫氫酶(GDH)
1.4.5 甘油醛-3-磷酸脫氫酶(GAPDH)
1.4.6 纖連蛋白和纖連蛋白原結(jié)合蛋白(FBPS)
1.4.7 毒力相關(guān)序列(orf2)
1.4.8 89k毒力島
1.4.9 其他毒力因子
1.5 致病機(jī)制
1.6 豬鏈球菌的檢測(cè)方法及研究進(jìn)展
1.6.1 經(jīng)典鑒定方法
1.6.2 分子生物學(xué)方法
1.7 本試驗(yàn)研究的目的與意義
第二篇 試驗(yàn)部分
第二章 豬鏈球菌2型主要毒力因子三重?zé)晒舛縋CR檢測(cè)方法的建立
摘要
1 試驗(yàn)材料
1.1 主要試劑
1.2 主要設(shè)備
1.3 種系背景明確的試驗(yàn)對(duì)照菌株
1.4 引物及探針
1.5 相關(guān)主要試劑的制備
1.6 豬鏈球菌2型細(xì)菌基因組DNA的提取
1.7 三重實(shí)時(shí)熒光定量PCR陽性標(biāo)準(zhǔn)品的制備
1.7.1 目的片段的PCR擴(kuò)增及電泳成像
1.7.2 PCR產(chǎn)物膠回收
1.7.3 膠回收產(chǎn)物連接
1.7.4 連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化
1.7.5 陽性克隆的PCR篩選及測(cè)序驗(yàn)證
1.7.6 重組質(zhì)粒陽性模板標(biāo)準(zhǔn)的制備
1.7.7 重組質(zhì)粒濃度的測(cè)定及計(jì)算
2 三重?zé)晒舛縋CR檢測(cè)方法的建立
2.1 三重?zé)晒舛縋CR反應(yīng)條件的優(yōu)化
2.2 三重?zé)晒舛縋CR擴(kuò)增曲線及標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立
2.3 敏感性試驗(yàn)
2.4 特異性試驗(yàn)
2.5 重復(fù)性試驗(yàn)
3 結(jié)果
3.1 目的片段的PCR擴(kuò)增
3.2 重組質(zhì)粒的制備和濃度測(cè)定
3.3 Taqman法單項(xiàng)實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立
3.4 Taqman法三重實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法及標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立
3.4.1 反應(yīng)體系和反應(yīng)條件
3.4.2 Taqman三重實(shí)時(shí)熒光定量PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線
3.5 敏感性試驗(yàn)
3.5.1 普通PCR檢測(cè)豬鏈球菌2型敏感性試驗(yàn)
3.5.2 三重?zé)晒舛縋CR檢測(cè)豬鏈球菌2型敏感性試驗(yàn)
3.6 三重?zé)晒舛縋CR檢測(cè)豬鏈球菌2型的特異性
3.7 三重?zé)晒舛縋CR的重復(fù)性試驗(yàn)
4 討論
第三章 豬鏈球菌選擇性增菌液的研究
摘要
1 材料和方法
1.1 菌株
1.1.1 受試菌株
1.1.2 其他菌株
1.2 培養(yǎng)基
1.3 抗生素藥敏紙片
1.4 抗生素添加劑
1.5 麥?zhǔn)媳葷峁?br> 2 方法
2.1 抗菌藥物敏感試驗(yàn)
2.2 抗菌藥物最小抑菌濃度(MIC)的測(cè)定
2.3 抗菌藥物對(duì)其他菌的抑制情況
2.4 組合抗菌藥物添加培養(yǎng)基的效果
2.5 模擬污染樣本分離豬鏈球菌情況的初步比較
3 結(jié)果
3.1 豬鏈球菌2型對(duì)部分抗菌藥物的敏感性
3.2 抗菌藥物最小抑菌濃度(MIC)的測(cè)定
3.3 抗菌藥物對(duì)其他菌的抑制情況
3.4 組合抗菌藥物添加培養(yǎng)基的效果
3.5 模擬污染樣本分離豬鏈球菌情況的初步比較
4 討論
第四章 上海部分地區(qū)臨床表觀健康豬群豬鏈球菌攜帶情況的檢測(cè)
摘要
1 材料和方法
1.1 參考菌株及培養(yǎng)條件
1.2 所用試劑,儀器和設(shè)備
1.2.1 試劑
1.2.2 儀器設(shè)備
1.3 引物合成
2 樣品處理
2.1 樣品的采集
2.2 樣品的均質(zhì)、增菌和分離
2.3 模板的制備
2.4 常規(guī)方法初步鑒定
2.5 豬鏈球菌菌株型鑒定
2.6 豬鏈球菌2型毒力因子檢測(cè)
3 結(jié)果
3.1 豬鏈球菌形態(tài)學(xué)觀察
3.2 豬鏈球菌革蘭氏染色觀察
3.3 淋巴結(jié)樣品中豬鏈球菌分布情況
3.4 GDH陽性的豬鏈球菌2型毒力因子檢測(cè)結(jié)果
4 討論
參考文獻(xiàn)
全文總結(jié)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2型豬鏈球菌Fbps基因敲除突變體的構(gòu)建及毒力分析[J]. 謝文龍,駢亞亞,吳凱,鄭玉玲,姜永強(qiáng),陳福生. 生物技術(shù)通訊. 2012(05)
[2]高致病性豬鏈球菌2型多重實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 朱靜,張錦海,胡丹,石潔,張先云,李先富,潘秀珍,王長(zhǎng)軍. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2012(05)
[3]豬鏈球菌病的研究進(jìn)展[J]. 付建,王敏蘭. 畜牧與飼料科學(xué). 2012(04)
[4]2型豬鏈球菌89K致病島進(jìn)化途徑分析[J]. 胡力文,鄒凌云,倪青山,姚新月,朱軍民,李明,胡福泉. 第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(06)
[5]當(dāng)前豬病的發(fā)病特點(diǎn)及綜合防治措施[J]. 孫志華. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2012(04)
[6]實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)的研究進(jìn)展及應(yīng)用[J]. 徐楠楠,胡桂學(xué). 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2011(21)
[7]2型豬鏈球菌溶血素及其抗血清的免疫保護(hù)活性研究[J]. 劉麗娜,朱軍民,叢延廣,王長(zhǎng)軍. 解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2011(11)
[8]正常屠宰豬致病性豬鏈球菌7型的鑒定和特性研究[J]. 茅愛華,倪艷秀,呂立新,俞正玉,周俊明,胡東波,溫立斌,張雪寒,郭容利,李彬,王小敏,何孔旺. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(05)
[9]仔豬豬鏈球菌、大腸桿菌、梭菌混合感染的診斷與防治[J]. 張延和,尹殿明,于明,阿嘎日,付明山. 畜牧獸醫(yī)科技信息. 2011(03)
[10]豬鏈球菌病的鑒定及中草藥體外抑菌試驗(yàn)[J]. 鐘永慶. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2010(21)
碩士論文
[1]豬鏈球菌多重PCR檢測(cè)方法的建立及屠宰場(chǎng)樣品感染率的調(diào)查研究[D]. 鄭升博.上海交通大學(xué) 2010
[2]二元信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)2148hk/rr與豬鏈球菌2型致病性關(guān)系研究[D]. 程功.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[3]上海地區(qū)致病性豬鏈球菌及其毒力基因的檢測(cè)[D]. 李小軍.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[4]中國(guó)部分地區(qū)豬鏈球菌遺傳背景及進(jìn)化關(guān)系研究[D]. 蔡振鴻.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[5]豬鏈球菌2型強(qiáng)毒株srtA基因缺失株的構(gòu)建及其毒力分析[D]. 董亞青.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
本文編號(hào):2960019
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
符號(hào)及縮略語
第一篇 文獻(xiàn)綜述
第一章 豬鏈球菌的研究概述
1 豬鏈球菌簡(jiǎn)介
1.1 豬鏈球菌的歷史概況
1.2 豬鏈球菌病原學(xué)
1.2.1 分類
1.2.2 形態(tài)及染色特性
1.2.3 培養(yǎng)特性
1.2.4 抗抗力
1.2.5 耐藥性
1.3 豬鏈球菌流行病學(xué)研究
1.4 豬鏈球菌毒力因子研究
1.4.1 莢膜多糖(CPS)
1.4.2 溶菌酶釋放蛋白(MRP)和胞外蛋白因子(EF)
1.4.3 溶血素(SLY)
1.4.4 谷氨酸脫氫酶(GDH)
1.4.5 甘油醛-3-磷酸脫氫酶(GAPDH)
1.4.6 纖連蛋白和纖連蛋白原結(jié)合蛋白(FBPS)
1.4.7 毒力相關(guān)序列(orf2)
1.4.8 89k毒力島
1.4.9 其他毒力因子
1.5 致病機(jī)制
1.6 豬鏈球菌的檢測(cè)方法及研究進(jìn)展
1.6.1 經(jīng)典鑒定方法
1.6.2 分子生物學(xué)方法
1.7 本試驗(yàn)研究的目的與意義
第二篇 試驗(yàn)部分
第二章 豬鏈球菌2型主要毒力因子三重?zé)晒舛縋CR檢測(cè)方法的建立
摘要
1 試驗(yàn)材料
1.1 主要試劑
1.2 主要設(shè)備
1.3 種系背景明確的試驗(yàn)對(duì)照菌株
1.4 引物及探針
1.5 相關(guān)主要試劑的制備
1.6 豬鏈球菌2型細(xì)菌基因組DNA的提取
1.7 三重實(shí)時(shí)熒光定量PCR陽性標(biāo)準(zhǔn)品的制備
1.7.1 目的片段的PCR擴(kuò)增及電泳成像
1.7.2 PCR產(chǎn)物膠回收
1.7.3 膠回收產(chǎn)物連接
1.7.4 連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化
1.7.5 陽性克隆的PCR篩選及測(cè)序驗(yàn)證
1.7.6 重組質(zhì)粒陽性模板標(biāo)準(zhǔn)的制備
1.7.7 重組質(zhì)粒濃度的測(cè)定及計(jì)算
2 三重?zé)晒舛縋CR檢測(cè)方法的建立
2.1 三重?zé)晒舛縋CR反應(yīng)條件的優(yōu)化
2.2 三重?zé)晒舛縋CR擴(kuò)增曲線及標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立
2.3 敏感性試驗(yàn)
2.4 特異性試驗(yàn)
2.5 重復(fù)性試驗(yàn)
3 結(jié)果
3.1 目的片段的PCR擴(kuò)增
3.2 重組質(zhì)粒的制備和濃度測(cè)定
3.3 Taqman法單項(xiàng)實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立
3.4 Taqman法三重實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法及標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立
3.4.1 反應(yīng)體系和反應(yīng)條件
3.4.2 Taqman三重實(shí)時(shí)熒光定量PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線
3.5 敏感性試驗(yàn)
3.5.1 普通PCR檢測(cè)豬鏈球菌2型敏感性試驗(yàn)
3.5.2 三重?zé)晒舛縋CR檢測(cè)豬鏈球菌2型敏感性試驗(yàn)
3.6 三重?zé)晒舛縋CR檢測(cè)豬鏈球菌2型的特異性
3.7 三重?zé)晒舛縋CR的重復(fù)性試驗(yàn)
4 討論
第三章 豬鏈球菌選擇性增菌液的研究
摘要
1 材料和方法
1.1 菌株
1.1.1 受試菌株
1.1.2 其他菌株
1.2 培養(yǎng)基
1.3 抗生素藥敏紙片
1.4 抗生素添加劑
1.5 麥?zhǔn)媳葷峁?br> 2 方法
2.1 抗菌藥物敏感試驗(yàn)
2.2 抗菌藥物最小抑菌濃度(MIC)的測(cè)定
2.3 抗菌藥物對(duì)其他菌的抑制情況
2.4 組合抗菌藥物添加培養(yǎng)基的效果
2.5 模擬污染樣本分離豬鏈球菌情況的初步比較
3 結(jié)果
3.1 豬鏈球菌2型對(duì)部分抗菌藥物的敏感性
3.2 抗菌藥物最小抑菌濃度(MIC)的測(cè)定
3.3 抗菌藥物對(duì)其他菌的抑制情況
3.4 組合抗菌藥物添加培養(yǎng)基的效果
3.5 模擬污染樣本分離豬鏈球菌情況的初步比較
4 討論
第四章 上海部分地區(qū)臨床表觀健康豬群豬鏈球菌攜帶情況的檢測(cè)
摘要
1 材料和方法
1.1 參考菌株及培養(yǎng)條件
1.2 所用試劑,儀器和設(shè)備
1.2.1 試劑
1.2.2 儀器設(shè)備
1.3 引物合成
2 樣品處理
2.1 樣品的采集
2.2 樣品的均質(zhì)、增菌和分離
2.3 模板的制備
2.4 常規(guī)方法初步鑒定
2.5 豬鏈球菌菌株型鑒定
2.6 豬鏈球菌2型毒力因子檢測(cè)
3 結(jié)果
3.1 豬鏈球菌形態(tài)學(xué)觀察
3.2 豬鏈球菌革蘭氏染色觀察
3.3 淋巴結(jié)樣品中豬鏈球菌分布情況
3.4 GDH陽性的豬鏈球菌2型毒力因子檢測(cè)結(jié)果
4 討論
參考文獻(xiàn)
全文總結(jié)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2型豬鏈球菌Fbps基因敲除突變體的構(gòu)建及毒力分析[J]. 謝文龍,駢亞亞,吳凱,鄭玉玲,姜永強(qiáng),陳福生. 生物技術(shù)通訊. 2012(05)
[2]高致病性豬鏈球菌2型多重實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 朱靜,張錦海,胡丹,石潔,張先云,李先富,潘秀珍,王長(zhǎng)軍. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2012(05)
[3]豬鏈球菌病的研究進(jìn)展[J]. 付建,王敏蘭. 畜牧與飼料科學(xué). 2012(04)
[4]2型豬鏈球菌89K致病島進(jìn)化途徑分析[J]. 胡力文,鄒凌云,倪青山,姚新月,朱軍民,李明,胡福泉. 第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(06)
[5]當(dāng)前豬病的發(fā)病特點(diǎn)及綜合防治措施[J]. 孫志華. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2012(04)
[6]實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)的研究進(jìn)展及應(yīng)用[J]. 徐楠楠,胡桂學(xué). 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2011(21)
[7]2型豬鏈球菌溶血素及其抗血清的免疫保護(hù)活性研究[J]. 劉麗娜,朱軍民,叢延廣,王長(zhǎng)軍. 解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2011(11)
[8]正常屠宰豬致病性豬鏈球菌7型的鑒定和特性研究[J]. 茅愛華,倪艷秀,呂立新,俞正玉,周俊明,胡東波,溫立斌,張雪寒,郭容利,李彬,王小敏,何孔旺. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(05)
[9]仔豬豬鏈球菌、大腸桿菌、梭菌混合感染的診斷與防治[J]. 張延和,尹殿明,于明,阿嘎日,付明山. 畜牧獸醫(yī)科技信息. 2011(03)
[10]豬鏈球菌病的鑒定及中草藥體外抑菌試驗(yàn)[J]. 鐘永慶. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2010(21)
碩士論文
[1]豬鏈球菌多重PCR檢測(cè)方法的建立及屠宰場(chǎng)樣品感染率的調(diào)查研究[D]. 鄭升博.上海交通大學(xué) 2010
[2]二元信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)2148hk/rr與豬鏈球菌2型致病性關(guān)系研究[D]. 程功.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[3]上海地區(qū)致病性豬鏈球菌及其毒力基因的檢測(cè)[D]. 李小軍.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[4]中國(guó)部分地區(qū)豬鏈球菌遺傳背景及進(jìn)化關(guān)系研究[D]. 蔡振鴻.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[5]豬鏈球菌2型強(qiáng)毒株srtA基因缺失株的構(gòu)建及其毒力分析[D]. 董亞青.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
本文編號(hào):2960019
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