為研究山羊痘病毒（goatpox virus, GTPV）G9、A16蛋白的功能,用PCR方法從山羊痘病毒弱毒疫苗毒株GTPV AV41中擴增出編碼G9、A16蛋白的基因進行測序,通過生物信息學方法對目的基因序列進行分析。結(jié)果顯示:G9蛋白有34個磷酸化位點,17個抗原表位位點;二級結(jié)構(gòu)中以α-螺旋和無規(guī)則卷曲為主,分別占36.61%和42.86%,有9個保守結(jié)構(gòu)域,蛋白序列末尾有跨膜區(qū)域,包含15個半胱氨酸殘基位點;三級結(jié)構(gòu)中具有細胞凋亡和跨膜功能的結(jié)構(gòu)。A16蛋白有36個磷酸化位點,19個抗原表位位點;二級結(jié)構(gòu)中α-螺旋和無規(guī)則卷曲為主,分別占25.46%和48.28%,有10個保守結(jié)構(gòu)域,蛋白序列末尾有跨膜區(qū)域,包含21個半胱氨酸殘基位點;三級結(jié)構(gòu)預測結(jié)果顯示可以形成膜蛋白。上述研究結(jié)果為進一步探究GTPV的G9、A16蛋白功能提供了參考。 

【文章來源】：畜牧與獸醫(yī). 2020年10期 北大核心

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

GTPV AV41的A16、G9基因PCR擴增產(chǎn)物

使用MEGA軟件Neighbor Joining方法將所篩選的不同物種的蛋白序列構(gòu)建進化樹,結(jié)果顯示GTPV AV41與GTPV Pellor的親緣關(guān)系最近,與SHPV 17077-99次之,與VACV IHD-J的親緣關(guān)系較遠,GTPV AV41與VACV IHD-J分別在2個不同的大分支上(圖3)。圖3 G9(A)、A16(B)蛋白序列進化樹

G9(A)、A16(B)蛋白序列進化樹

【參考文獻】：
期刊論文
[1]基于全基因組結(jié)構(gòu)域信息的進化樹構(gòu)建[J]. 陳治偉,李曉琴.  生物信息學. 2012(01)
[2]人感染山羊痘五例[J]. 洪艷,謝忠文,施恒豫.  中華傳染病雜志. 2005(02)



本文編號：2957877