布魯氏菌病是一種危害嚴(yán)重的人獸共患病,存在于170多個國家和地區(qū),僅個別發(fā)達國家宣布凈化了布魯氏菌病。本研究以51株2010-2016年間我國北方部分省份分離的羊種布魯氏菌為研究對象,進行了:1.傳統(tǒng)生化方法分型。結(jié)果顯示,主要是羊種3型,占整個羊種分離株的92%,其次是羊種1型和2型。2.MLVA-15分型方法的建立。利用在線分析軟件（http://tandem.bu.edu/trf/trf.html）對參考菌株16M基因組的VNTR位點進行檢索,從基因組中95個VNTR位點選取串聯(lián)重復(fù)序列匹配度100%的47個VNTR位點,其中25個位于1號染色體,22個位于2號染色體。經(jīng)HGDI指數(shù)分析,選取15個VNTR位點建立MLVA-15,其中8個VNTR位點與傳統(tǒng)的MLVA-16相同,增加7個高度多態(tài)性VNTR位點。應(yīng)用軟件BioNumerics7.6聚類分類表明,MLVA-15對國內(nèi)菌株的區(qū)分明顯高于傳統(tǒng)的MLVA-16。MLVA-15方法減少了MLVA-16中不具有多態(tài)性的位點,提高了對布魯氏菌流行菌株的鑒別能力,可以滿足布病流行病學(xué)調(diào)查中對傳染源和傳播途徑精確追溯的需求。3.多位點... 

【文章來源】：甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省

【文章頁數(shù)】：75 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

布魯氏菌Bruce-ladderPCR鑒定結(jié)果

圖 4-1 新疆羊種布魯氏菌流行株三個主要 MLVA-8 基因型的地理分布.4-1 Geographical distribution of three major MLVA-8 genotypes identified as B. melitensis fromXinjiangMLVA-16 分析LVA-16 分析包括了 Panel 1 和 Panel 2 的 16 個 VNTR 位點，由于增加了多態(tài)性 Panel 2 位點，進一步提高了對布魯氏菌菌株的鑒別區(qū)分能力。92 株新疆羊種分離株中共鑒定出 44 個 MLVA-16 基因型（圖 4-2），其中 25 個基因型只包株，其余 19 個基因型包含了 67 個菌株。新疆地區(qū)最常見的基因型是 Gm11，因型的 10 個菌株分離自昌吉、巴州、阿勒泰等 6 個地州，基因型 Gm1、8、13、38 菌株在新疆也比較廣泛。MLVA-16 對菌株的分辨率最高，可區(qū)分單個菌株布病流行病學(xué)調(diào)查中病原的溯源分析。44 個 MLVA-16 基因型中有 30 個是新特有的，13 個基因型是與內(nèi)蒙、陜西、青海、山西等鄰近省份以及與其接壤的

47圖 5-1 基于 21 個基因位點的羊種布魯氏菌不同序列型的進化樹分析g.5-1 Phylogenetic tree of sequence types identified in B. melitensis based on 21 gene SA 方法不僅可以用于區(qū)分不同的菌株，同時在細(xì)菌的分子進化研究上布魯氏菌 MLSA 國際數(shù)據(jù)庫（https://pubmlst.org/）中包括分離株 A9 序列型 76 個，BruMLSA21 序列型 141 個，其中羊種布魯氏菌 Bru41 個。通過 BruMLSA9 分析，51 株羊種布魯氏菌流行株均為 ST8，Br 4 個序列型，ST8 占 72.5%，該序列型菌株主要分布在土耳其、印度，表明我國羊種布魯氏菌流行菌株與上述地區(qū)的菌株具有較緊密的遺的三個序列型中， ST137 和 ST138 與 ST8 進化關(guān)系最近，不排除

【參考文獻】：
期刊論文
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[2]多位點可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)序列分型方法檢測布魯氏菌分型標(biāo)準(zhǔn)化操作方法的建立和應(yīng)用[J]. 楊杰,趙素蓮,崔步云,姜海,趙鴻雁,樸冬日.  疾病監(jiān)測. 2012(02)
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[10]布魯氏菌非典型菌株及R型菌株生物學(xué)特性和產(chǎn)生原因的探討[J]. 李元凱,邱海燕,馬燁,尚德秋.  中國人獸共患病雜志. 1996(05)

博士論文
[1]布魯氏菌中國分離株遺傳多態(tài)性研究[D]. 陳燕芬.吉林大學(xué) 2012

碩士論文
[1]布魯氏菌熒光定量PCR檢測方法的建立及應(yīng)用[D]. 崔玉花.重慶理工大學(xué) 2016
[2]中國布魯氏菌分離株REP-PCR基因分型研究與應(yīng)用[D]. 張正芳.西南大學(xué) 2013
[3]家畜布魯氏菌病流行病學(xué)調(diào)查及布魯氏菌單核苷酸多態(tài)性分子分型研究[D]. 莫莎.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]布魯氏菌脈沖場凝膠電泳分型研究[D]. 崔步云.山西醫(yī)科大學(xué) 2006



本文編號：2939639