京海黃雞生長期胸肌轉(zhuǎn)錄組分析及關(guān)鍵基因RAC2功能初步驗證
發(fā)布時間:2020-12-18 23:17
生長性能對肉雞生產(chǎn)極為重要,在肉雞的生長過程中,不同生長階段基因的表達(dá)情況不同,肌肉生長發(fā)育的調(diào)控機(jī)制較為復(fù)雜,關(guān)于肉雞生長分子機(jī)制的研究依然較少。本試驗采集4、8和12周齡京海黃雞公雞胸肌進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序研究,并運(yùn)用實(shí)時熒光定量技術(shù)對測序結(jié)果進(jìn)行驗證;本試驗進(jìn)一步選取關(guān)鍵差異基因RAC2,采用慢病毒干擾的方法檢測其對下游基因的調(diào)控情況。主要研究結(jié)果如下:1.以Fold Change≥2且FDR≤0.05作為篩選標(biāo)準(zhǔn),4、8和12周齡三個組兩兩比較后共獲得4608個差異表達(dá)基因,其中4周齡與8周齡相比(M4FvsM8F)獲得83個差異表達(dá)基因,4周齡與12周齡相比(M4FvsM12F)獲得3445個差異表達(dá)基因,8周齡與12周齡相比(M8FvsM12F)獲得3903個差異表達(dá)基因。對差異基因進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)在三個組比較中得到6個共同差異表達(dá)基因,其中三個得到了注釋,分別為SNCG、MYH1A和ARHGDIB,說明這些基因在京海黃雞生長前期各個階段都與生長發(fā)育關(guān)系密切。2.分別對M4FvsM8F、M4FvsM12F和M8FvsM12F三個組比較得到的83、3445和3903個差異表達(dá)基因進(jìn)行...
【文章來源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:78 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1?HIV-1病毒基因結(jié)構(gòu)??Fiure?1.1?Gene?structure?of?HIV-1??
圖2.1總RNA瓊脂糖凝膠電泳圖??Figure?2.1?The?agarose?gel?electrophoresis?of?total?RNA??nodrop和Agilent2100對RNA樣品進(jìn)一步檢測,結(jié)果匯總?cè)缦,NA濃度都在正常范圍?nèi),通過28S/18S和0D值260/280可知降解現(xiàn)象,每個樣本RIN(RNAintegritynmnber)值均大于等于7測序要求。??表2.3?RNA檢測結(jié)果匯總表??Table?2.3?The?table?of?RNA?detection?results??稱?濃度(ng/|il)?RIN.h?OD260/280?OD260/230?28S/18S?.?.??ame?Concentration?(ng/ul)?RNA?integrity70?2.059?1.944?1.4?8.5??
?IS??log2(fold?change)??圖2.3差異表達(dá)基因火山圖??Figure?2.3?The?volcano?plot?of?DEGs??M4FvsM8F?M4FvsM12F??25??31?
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蠅蛆蛋白對壽光雞生產(chǎn)性能、屠宰性能和雞肉品質(zhì)的影響[J]. 郭瑞萍,肖發(fā)沂,李超,郭嬪,田慧麗,李舫. 飼料研究. 2018(01)
[2]廣東菜雞肉香腸的加工工藝研究[J]. 相玉秀,宗煥然,郭玲玲. 肉類工業(yè). 2017(11)
[3]肌球蛋白重鏈基因在人類遺傳性疾病中的研究進(jìn)展[J]. 何一旻,顧鳴敏. 遺傳. 2017(10)
[4]肉種雞繁殖技術(shù)措施[J]. 郭紅光. 中國畜禽種業(yè). 2017(01)
[5]慢病毒載體及其研究進(jìn)展[J]. 孟凡榮,陳琛,萬海粟,周清華. 中國肺癌雜志. 2014(12)
[6]黃山黑雞體尺、屠宰性能和肉品質(zhì)測定及相關(guān)分析[J]. 李俊營,陳麗園,詹凱,劉偉,楊秀娟,張偉,劉盛南,羅聯(lián)輝,胡成來. 中國家禽. 2014(14)
[7]珍禽貴妃雞體尺性狀與屠宰性能的相關(guān)分析[J]. 李乃賓,楊芬霞,杜炳旺,陶林,陳潔波. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2014(07)
[8]溧陽雞體尺測量及屠宰性能測定[J]. 萬建洪,張軍,池智賢,成艷,龔道清. 畜牧與獸醫(yī). 2011(05)
[9]不同性別京海黃雞體尺及屠宰性能的比較分析[J]. 楊燕,呂慎金,王金玉,王麗云,于佳慧,陳香艷,魏萍. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2010(05)
博士論文
[1]PAK3在心肌肥厚中的作用和機(jī)制研究[D]. 陳建州.南京大學(xué) 2016
[2]雞生長發(fā)育和肌纖維生長的影響因素與相關(guān)基因表達(dá)研究[D]. 李娟.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]肉雞肌纖維特性與肉質(zhì)性狀的形成規(guī)律及日糧營養(yǎng)調(diào)控研究[D]. 趙景鵬.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2010
碩士論文
[1]氯化鑭對子代大鼠海馬神經(jīng)元樹突棘及Rac1-PAK信號通路的影響[D]. 孫文昌.中國醫(yī)科大學(xué) 2018
[2]復(fù)方中草藥添加劑的研發(fā)及其在肉雞生產(chǎn)中的應(yīng)用研究[D]. 孫啟.安徽科技學(xué)院 2017
[3]高、低產(chǎn)蛋量京海黃雞卵巢組織轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析[D]. 韓昆鵬.揚(yáng)州大學(xué) 2016
[4]不同飼養(yǎng)方式對優(yōu)質(zhì)雞的生長性能、屠宰性能以及肉質(zhì)性狀的影響[D]. 余鵬.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[5]不同品種雞的肌纖維發(fā)育規(guī)律及其與肉質(zhì)的關(guān)系[D]. 劉冰.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
本文編號:2924779
【文章來源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:78 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1?HIV-1病毒基因結(jié)構(gòu)??Fiure?1.1?Gene?structure?of?HIV-1??
圖2.1總RNA瓊脂糖凝膠電泳圖??Figure?2.1?The?agarose?gel?electrophoresis?of?total?RNA??nodrop和Agilent2100對RNA樣品進(jìn)一步檢測,結(jié)果匯總?cè)缦,NA濃度都在正常范圍?nèi),通過28S/18S和0D值260/280可知降解現(xiàn)象,每個樣本RIN(RNAintegritynmnber)值均大于等于7測序要求。??表2.3?RNA檢測結(jié)果匯總表??Table?2.3?The?table?of?RNA?detection?results??稱?濃度(ng/|il)?RIN.h?OD260/280?OD260/230?28S/18S?.?.??ame?Concentration?(ng/ul)?RNA?integrity70?2.059?1.944?1.4?8.5??
?IS??log2(fold?change)??圖2.3差異表達(dá)基因火山圖??Figure?2.3?The?volcano?plot?of?DEGs??M4FvsM8F?M4FvsM12F??25??31?
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蠅蛆蛋白對壽光雞生產(chǎn)性能、屠宰性能和雞肉品質(zhì)的影響[J]. 郭瑞萍,肖發(fā)沂,李超,郭嬪,田慧麗,李舫. 飼料研究. 2018(01)
[2]廣東菜雞肉香腸的加工工藝研究[J]. 相玉秀,宗煥然,郭玲玲. 肉類工業(yè). 2017(11)
[3]肌球蛋白重鏈基因在人類遺傳性疾病中的研究進(jìn)展[J]. 何一旻,顧鳴敏. 遺傳. 2017(10)
[4]肉種雞繁殖技術(shù)措施[J]. 郭紅光. 中國畜禽種業(yè). 2017(01)
[5]慢病毒載體及其研究進(jìn)展[J]. 孟凡榮,陳琛,萬海粟,周清華. 中國肺癌雜志. 2014(12)
[6]黃山黑雞體尺、屠宰性能和肉品質(zhì)測定及相關(guān)分析[J]. 李俊營,陳麗園,詹凱,劉偉,楊秀娟,張偉,劉盛南,羅聯(lián)輝,胡成來. 中國家禽. 2014(14)
[7]珍禽貴妃雞體尺性狀與屠宰性能的相關(guān)分析[J]. 李乃賓,楊芬霞,杜炳旺,陶林,陳潔波. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2014(07)
[8]溧陽雞體尺測量及屠宰性能測定[J]. 萬建洪,張軍,池智賢,成艷,龔道清. 畜牧與獸醫(yī). 2011(05)
[9]不同性別京海黃雞體尺及屠宰性能的比較分析[J]. 楊燕,呂慎金,王金玉,王麗云,于佳慧,陳香艷,魏萍. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2010(05)
博士論文
[1]PAK3在心肌肥厚中的作用和機(jī)制研究[D]. 陳建州.南京大學(xué) 2016
[2]雞生長發(fā)育和肌纖維生長的影響因素與相關(guān)基因表達(dá)研究[D]. 李娟.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]肉雞肌纖維特性與肉質(zhì)性狀的形成規(guī)律及日糧營養(yǎng)調(diào)控研究[D]. 趙景鵬.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2010
碩士論文
[1]氯化鑭對子代大鼠海馬神經(jīng)元樹突棘及Rac1-PAK信號通路的影響[D]. 孫文昌.中國醫(yī)科大學(xué) 2018
[2]復(fù)方中草藥添加劑的研發(fā)及其在肉雞生產(chǎn)中的應(yīng)用研究[D]. 孫啟.安徽科技學(xué)院 2017
[3]高、低產(chǎn)蛋量京海黃雞卵巢組織轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析[D]. 韓昆鵬.揚(yáng)州大學(xué) 2016
[4]不同飼養(yǎng)方式對優(yōu)質(zhì)雞的生長性能、屠宰性能以及肉質(zhì)性狀的影響[D]. 余鵬.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[5]不同品種雞的肌纖維發(fā)育規(guī)律及其與肉質(zhì)的關(guān)系[D]. 劉冰.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
本文編號:2924779
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