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基于線粒體數(shù)據(jù)在全球視角下解析家驢的種群系統(tǒng)地理關系和種群歷史

發(fā)布時間:2020-12-13 22:26
  家驢作為馬屬中的一種動物,和馬具有一些相似的特征。但它的抗旱和耐壓能力更為出眾,因此多見分布在一些極端環(huán)境中。家驢的馴化標志著人類社會中的生產(chǎn)模式從固定的農(nóng)耕模式變?yōu)榱烁咭苿有缘哪J?對人類社會文明的發(fā)展具有重要意義。但如今野驢幾近滅絕,家驢種質(zhì)多樣性急劇下降,探明家驢進化起源問題從而找到保護多樣度相關對策變得迫在眉睫。從線粒體DNA分析及考古的證據(jù)都認為,在約5000年前的非洲東北部存在家驢馴化事件,進一步的分子證據(jù)認為馴化后分為了兩支:努比亞世系(NUB)和索馬里世系(SOM),努比亞世系被認為是由努比亞野驢馴化而來,而索馬里世系則起源于一種可能已滅絕的但關系與索馬里野驢很近的野驢。然而目前尚未可知這兩個世系是否源自同一馴化事件,即是否具有相同的馴化歷史。在前期本研究假設兩個世系具有相同馴化歷史,則兩個世系應當具有相似遺傳特征。為了進一步確認該假設,我們選用了來自非洲及中亞地區(qū)以及中國的113個樣品(包括家驢,亞洲野驢,馬)對線粒體D-loop區(qū)以及其中77個樣品進行線粒體全基因組測序,再結合網(wǎng)上已發(fā)表的531條涵蓋非洲,亞洲等地區(qū)的線粒體基因進行綜合分析。之后我們基于線粒體全基... 

【文章來源】:云南大學云南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:67 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于線粒體數(shù)據(jù)在全球視角下解析家驢的種群系統(tǒng)地理關系和種群歷史


本研究中使用的樣品及NCBI下載樣品分布圖

基于線粒體數(shù)據(jù)在全球視角下解析家驢的種群系統(tǒng)地理關系和種群歷史


部分樣品線粒體D-loop序列擴增結果

基于線粒體數(shù)據(jù)在全球視角下解析家驢的種群系統(tǒng)地理關系和種群歷史


家驢線粒體基因組構建的單倍型系統(tǒng)發(fā)育樹

【參考文獻】:
期刊論文
[1]馬屬動物進化特征概述[J]. 任秀娟,趙一萍,薩如拉,鮑紅梅,王希生,道楞,阿娜爾,魏睿元,蘇日嘎,彩麗干,白東義,李蓓,楊麗華,烏尼爾夫,芒來.  畜牧獸醫(yī)學報. 2017(03)
[2]基于1H-NMR代謝組學的驢膠補血顆粒補血作用機制研究[J]. 劉彩春,劉歡,谷陟欣,秦雪梅,田俊生.  中草藥. 2016(07)
[3]MC1R基因編碼區(qū)的系統(tǒng)發(fā)育分析和正選擇位點檢測[J]. 李麗莎,李祥龍,周榮艷,李蘭會,張永改,馬夢云,張秀玲.  江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2016(03)
[4]測序新技術Ion Torrent PGM及其法醫(yī)學應用[J]. 劉宇軒,張文瓊,黃代新.  中國法醫(yī)學雜志. 2015(01)
[5]佳米驢消化生理特點與飼喂應注意的若干問題[J]. 韓英豪,張生衛(wèi),張燕.  畜牧獸醫(yī)雜志. 2010(03)
[6]驢肉主要營養(yǎng)成分及與其它畜禽肉的分析比較[J]. 尤娟,羅永康,張巖春,鄭喆.  肉類研究. 2008(07)
[7]中國驢種線粒體DNA D-loop多態(tài)性研究[J]. 雷初朝,陳宏,楊公社,孫維斌,雷雪芹,葛慶蘭,王朝鋒,呂寧,高雪,侯文通.  遺傳學報. 2005(05)
[8]分子系統(tǒng)地理學及其應用[J]. 王靜,李明,魏輔文,劉定震,蒙世杰,馮祚建.  動物分類學報. 2001(04)
[9]生態(tài)環(huán)境對野驢及家驢影響的比較[J]. 楊再.  家畜生態(tài). 1991(01)



本文編號:2915282

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