柔嫩艾美耳球蟲耐藥相關基因特性初步研究及耐藥株與敏感株全基因組重測序分析
發(fā)布時間:2020-12-13 20:09
柔嫩艾美耳球蟲(Eimeria tenella)是一種寄生于雞盲腸的單細胞寄生原蟲,是雞球蟲病的主要病原體,目前國內外對雞球蟲病的防治主要依靠藥物。長期使用藥物使其對藥物表現出嚴重的抗性,給禽類的養(yǎng)殖帶來了大量的經濟損失。為研究雞球蟲耐藥性產生的機制,本實驗室前期以柔嫩艾美耳球蟲的藥物敏感株(DS)為親本,誘導出抗地克珠利耐藥株(DZR)和抗馬杜拉霉素耐藥株(MRR)。對2個耐藥株和敏感株進行轉錄組測序,篩選了敏感株與耐藥株的差異表達基因。在此基礎上,本研究選擇4個在耐藥株體內顯著上調的基因,分別為柔嫩艾美耳球蟲含HD域蛋白(HD domain-containing protein,EtHDCP)、3-磷酸甘油醛脫氫酶(Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,EtGAPDH)、伴侶蛋白TCP-1環(huán)狀復合物亞基α(T-complex protein 1 subunitα,EtTCP-1α)和蘋果酸脫氫酶(Malate dehydrogenase,EtMDH)。對這4個基因進行特性和功能的初步分析,并用全基因組重測序的方法對敏感株和2個耐藥株進行測...
【文章來源】:中國農業(yè)科學院北京市
【文章頁數】:93 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
純化的柔嫩艾美耳球蟲4個階段蟲體Fig.2.1Purified4developmentalstagesofEimeriatenellaA:孢子化卵囊(×200);B:未孢子化卵囊(×200);C:子孢子(×200);D:裂殖子(×400)
經凝膠電泳分析其完整性(圖2.2),可見提取的總 RNA 具有典型的 3 個條帶,表明提取的 RNA 未被降解,完整性較好。分光光度計檢測結果 OD260/OD280=1.93,表明 RNA 未被蛋白質和 DNA 污染,可進行下一步的反轉錄,用反轉錄 M-MLV 試劑盒,得到柔嫩美耳球蟲孢子化卵囊的 cDNA 第一鏈,保存于-20℃。
中國農業(yè)科學院碩士學位論文 第二章 4 個耐藥相關基因的克隆和生物信息學分析因的 cDNA 片段。2.3.3.4 EtMDH 基因的 ORF 克隆根據 EtMDH 基因 ORF 序列,設計特異性引物,以柔嫩艾美耳球蟲孢子化卵囊 cDNA 為模板,設定合適的退火溫度進行 PCR 擴增。瓊脂糖凝膠電泳對產物進行分析,可以發(fā)現在 954 bp處有特異性的單一條帶(圖 2.3D),與預期條帶位置相符;將條帶位置正確的 PCR 產物切下,用膠回收試劑盒對 PCR 產物進行回收。純化后的 PCR 產物與 pGEM-T-easy 載體 4℃條件下連接 8h 后,將連接產物轉入大腸桿菌 TOP10 感受態(tài)細胞中,在 LB 固體平板中挑取陽性菌落進行培養(yǎng),并用 PCR 對菌液進行鑒定和測序。測序結果與原序列比對正確,表明成功擴增獲得 EtMDH 基因的 cDNA 片段。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]抗精噁唑禾草靈和甲基二磺隆看麥娘ACCase和ALS基因突變[J]. 趙寧,郭文磊,李偉,呂玲玲,劉偉堂,王金信. 植物保護學報. 2017(05)
[2]四個半LIM結構域蛋白1對人肝癌細胞紫杉醇耐藥影響的研究[J]. 周蕾,姜妮,周心娜,王小利,任軍. 中國臨床藥理學雜志. 2017(12)
[3]小檗堿對禽源大腸桿菌抑菌作用及耐藥消除作用的轉錄組學分析[J]. 張石磊,翟向和,王春光,陳諫,賈澤,張鐵. 中國畜牧獸醫(yī). 2017(05)
[4]惡性瘧原蟲與耐藥性相關分子遺傳標記的研究進展[J]. 徐超,黃炳成,閆歌,魏慶寬. 中國病原生物學雜志. 2016(12)
[5]柔嫩艾美耳球蟲2個抗藥株的抗藥性評估[J]. 謝雨翔,韓紅玉,趙其平,王自文,董輝,徐帥兵,朱順海,崔曉霞,唐敏,楊志遠,黃兵. 中國動物傳染病學報. 2016(06)
[6]耿氏硬草對乙酰輔酶A羧化酶類除草劑抗性水平及分子機制初探[J]. 袁國徽,王恒智,趙寧,路興濤,劉偉堂,王金信. 農藥學學報. 2016(03)
[7]乙酰輔酶A羧化酶B基因多態(tài)性與2型糖尿病的相關性研究[J]. 唐俊婷,李會芳,劉華,王玉明,宋滇平. 中國糖尿病雜志. 2016(01)
[8]鼠傷寒沙門菌ATCC13311誘導耐藥株的轉錄組測序和分析[J]. 李琳,馮帥,汪瑩,代興楊,楊艷菲,曾明華. 中國獸醫(yī)學報. 2015(07)
[9]乙酰輔酶A羧化酶基因多態(tài)性與冠心病關系[J]. 陳業(yè)達,張高華,梁巖,林美華,張乃尊,金律,饒紹奇. 中國公共衛(wèi)生. 2015(09)
[10]抗精噁唑禾草靈的日本看麥娘ACCase基因突變[J]. 畢亞玲,吳翠霞,郭文磊,李琦,李蓉榮,王金信. 植物保護學報. 2015(03)
博士論文
[1]基于全基因組SNP對豬品種分子種質特性挖掘與保護的研究[D]. 李文婷.中國農業(yè)大學 2017
[2]骨膜蛋白在非小細胞肺癌中的作用及相關機制的研究[D]. 胡文霞.河北醫(yī)科大學 2017
[3]空腸彎曲菌酰胺醇類誘導耐藥株與敏感株的組學比較研究[D]. 李會.中國農業(yè)大學 2015
[4]中華按蚊擬除蟲菊酯殺蟲劑抗性研究[D]. 朱國鼎.蘇州大學 2014
[5]應用全基因組重測序技術初步探討瘢痕增生的發(fā)病機制[D]. 劉暢.中國人民解放軍醫(yī)學院 2014
[6]牙鲆微衛(wèi)星標記的篩選和美洲牡蠣抗病相關基因SNP的初步分析[D]. 于海洋.中國海洋大學 2010
[7]羊胃腸線蟲對常用驅蟲藥抗藥性的初步研究[D]. 蔡葵蒸.內蒙古農業(yè)大學 2007
[8]帶科主要絳蟲45W和14ku/18ku基因變異的研究[D]. 賈萬忠.中國農業(yè)科學院 2003
碩士論文
[1]浮游態(tài)和生物被膜狀態(tài)嗜水氣單胞菌對四環(huán)素耐藥相關蛋白的研究[D]. 李碗芯.福建農林大學 2016
[2]中華按蚊線粒體基因組進化及抗藥性相關基因多態(tài)性研究[D]. 王琰.第二軍醫(yī)大學 2015
[3]柔嫩艾美耳球蟲兩個保守蛋白的初步研究[D]. 翟頎.中國農業(yè)科學院 2015
[4]基于SNP的捻轉血矛線蟲(H.contortus)遺傳多樣性分析及P-糖蛋白基因核苷酸差異位點篩選[D]. 葛程.上海師范大學 2015
[5]P2X7受體和TCP-1蛋白在淋巴瘤中的表達及相關性研究[D]. 曾佳.大連醫(yī)科大學 2013
[6]細粒棘球絳蟲GAPDH蛋白的生物信息學分析及其重組表達純化和酶活性檢測[D]. 吳巨龍.蘭州大學 2013
[7]柔嫩艾美耳球蟲鈣依賴蛋白激酶的研究[D]. 李洋.中國農業(yè)科學院 2010
本文編號:2915111
【文章來源】:中國農業(yè)科學院北京市
【文章頁數】:93 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
純化的柔嫩艾美耳球蟲4個階段蟲體Fig.2.1Purified4developmentalstagesofEimeriatenellaA:孢子化卵囊(×200);B:未孢子化卵囊(×200);C:子孢子(×200);D:裂殖子(×400)
經凝膠電泳分析其完整性(圖2.2),可見提取的總 RNA 具有典型的 3 個條帶,表明提取的 RNA 未被降解,完整性較好。分光光度計檢測結果 OD260/OD280=1.93,表明 RNA 未被蛋白質和 DNA 污染,可進行下一步的反轉錄,用反轉錄 M-MLV 試劑盒,得到柔嫩美耳球蟲孢子化卵囊的 cDNA 第一鏈,保存于-20℃。
中國農業(yè)科學院碩士學位論文 第二章 4 個耐藥相關基因的克隆和生物信息學分析因的 cDNA 片段。2.3.3.4 EtMDH 基因的 ORF 克隆根據 EtMDH 基因 ORF 序列,設計特異性引物,以柔嫩艾美耳球蟲孢子化卵囊 cDNA 為模板,設定合適的退火溫度進行 PCR 擴增。瓊脂糖凝膠電泳對產物進行分析,可以發(fā)現在 954 bp處有特異性的單一條帶(圖 2.3D),與預期條帶位置相符;將條帶位置正確的 PCR 產物切下,用膠回收試劑盒對 PCR 產物進行回收。純化后的 PCR 產物與 pGEM-T-easy 載體 4℃條件下連接 8h 后,將連接產物轉入大腸桿菌 TOP10 感受態(tài)細胞中,在 LB 固體平板中挑取陽性菌落進行培養(yǎng),并用 PCR 對菌液進行鑒定和測序。測序結果與原序列比對正確,表明成功擴增獲得 EtMDH 基因的 cDNA 片段。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]抗精噁唑禾草靈和甲基二磺隆看麥娘ACCase和ALS基因突變[J]. 趙寧,郭文磊,李偉,呂玲玲,劉偉堂,王金信. 植物保護學報. 2017(05)
[2]四個半LIM結構域蛋白1對人肝癌細胞紫杉醇耐藥影響的研究[J]. 周蕾,姜妮,周心娜,王小利,任軍. 中國臨床藥理學雜志. 2017(12)
[3]小檗堿對禽源大腸桿菌抑菌作用及耐藥消除作用的轉錄組學分析[J]. 張石磊,翟向和,王春光,陳諫,賈澤,張鐵. 中國畜牧獸醫(yī). 2017(05)
[4]惡性瘧原蟲與耐藥性相關分子遺傳標記的研究進展[J]. 徐超,黃炳成,閆歌,魏慶寬. 中國病原生物學雜志. 2016(12)
[5]柔嫩艾美耳球蟲2個抗藥株的抗藥性評估[J]. 謝雨翔,韓紅玉,趙其平,王自文,董輝,徐帥兵,朱順海,崔曉霞,唐敏,楊志遠,黃兵. 中國動物傳染病學報. 2016(06)
[6]耿氏硬草對乙酰輔酶A羧化酶類除草劑抗性水平及分子機制初探[J]. 袁國徽,王恒智,趙寧,路興濤,劉偉堂,王金信. 農藥學學報. 2016(03)
[7]乙酰輔酶A羧化酶B基因多態(tài)性與2型糖尿病的相關性研究[J]. 唐俊婷,李會芳,劉華,王玉明,宋滇平. 中國糖尿病雜志. 2016(01)
[8]鼠傷寒沙門菌ATCC13311誘導耐藥株的轉錄組測序和分析[J]. 李琳,馮帥,汪瑩,代興楊,楊艷菲,曾明華. 中國獸醫(yī)學報. 2015(07)
[9]乙酰輔酶A羧化酶基因多態(tài)性與冠心病關系[J]. 陳業(yè)達,張高華,梁巖,林美華,張乃尊,金律,饒紹奇. 中國公共衛(wèi)生. 2015(09)
[10]抗精噁唑禾草靈的日本看麥娘ACCase基因突變[J]. 畢亞玲,吳翠霞,郭文磊,李琦,李蓉榮,王金信. 植物保護學報. 2015(03)
博士論文
[1]基于全基因組SNP對豬品種分子種質特性挖掘與保護的研究[D]. 李文婷.中國農業(yè)大學 2017
[2]骨膜蛋白在非小細胞肺癌中的作用及相關機制的研究[D]. 胡文霞.河北醫(yī)科大學 2017
[3]空腸彎曲菌酰胺醇類誘導耐藥株與敏感株的組學比較研究[D]. 李會.中國農業(yè)大學 2015
[4]中華按蚊擬除蟲菊酯殺蟲劑抗性研究[D]. 朱國鼎.蘇州大學 2014
[5]應用全基因組重測序技術初步探討瘢痕增生的發(fā)病機制[D]. 劉暢.中國人民解放軍醫(yī)學院 2014
[6]牙鲆微衛(wèi)星標記的篩選和美洲牡蠣抗病相關基因SNP的初步分析[D]. 于海洋.中國海洋大學 2010
[7]羊胃腸線蟲對常用驅蟲藥抗藥性的初步研究[D]. 蔡葵蒸.內蒙古農業(yè)大學 2007
[8]帶科主要絳蟲45W和14ku/18ku基因變異的研究[D]. 賈萬忠.中國農業(yè)科學院 2003
碩士論文
[1]浮游態(tài)和生物被膜狀態(tài)嗜水氣單胞菌對四環(huán)素耐藥相關蛋白的研究[D]. 李碗芯.福建農林大學 2016
[2]中華按蚊線粒體基因組進化及抗藥性相關基因多態(tài)性研究[D]. 王琰.第二軍醫(yī)大學 2015
[3]柔嫩艾美耳球蟲兩個保守蛋白的初步研究[D]. 翟頎.中國農業(yè)科學院 2015
[4]基于SNP的捻轉血矛線蟲(H.contortus)遺傳多樣性分析及P-糖蛋白基因核苷酸差異位點篩選[D]. 葛程.上海師范大學 2015
[5]P2X7受體和TCP-1蛋白在淋巴瘤中的表達及相關性研究[D]. 曾佳.大連醫(yī)科大學 2013
[6]細粒棘球絳蟲GAPDH蛋白的生物信息學分析及其重組表達純化和酶活性檢測[D]. 吳巨龍.蘭州大學 2013
[7]柔嫩艾美耳球蟲鈣依賴蛋白激酶的研究[D]. 李洋.中國農業(yè)科學院 2010
本文編號:2915111
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/2915111.html
最近更新
教材專著